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A mechanical model of multicellular remodelling in epithelial monolayers
本文在离格点细胞中心模型中引入了一个动态参考系（DRF），用于模拟上皮单层中的亚细胞重塑，从而能够重现多尺度力学响应，并分析变形历史如何影响组织恢复。
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biophysics
412 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
⚛️ biophysics
The cytokine structural homologs IL-1β and IL-1Ra have distinct dynamical character that potentially influence their roles in allosteric regulation of the IL-1 receptor.
尽管细胞因子 IL-1β 与其拮抗剂 IL-1Ra 拥有近乎相同的折叠结构和平均骨架柔性，但由于激动剂的受体结合界面具有异常高的局部流动性，两者表现出截然不同的功能角色，这表明构象熵的空间分布而非其总量，决定了变构调节和生物学结果。
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Structural Plasticity and Ligand Promiscuity of CYP3A4 Revealed by Cryo-EM
本研究利用冷冻电子显微镜技术解析了未结合配体和结合配体的 CYP3A4 结构，揭示了 F/G 环的结构可塑性和配体多效性是该酶能够容纳多种药物的基础，并解释了当前预测模型的局限性。
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Surface Tension and Stalk Elongation Drive Dictyostelium Morphogenesis
本研究结合实验测量与流体动力学相场模型，旨在证明表面张力和柄尖拉伸驱动了导致黏质胞膜虫（*Dictyostelium*）子实体形态发生及基质脱离的去润湿过程。
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BioSecBench-Function: A Verifiable Benchmark for Reasoning about Biological Function from Experimental Data
该论文介绍了 BioSecBench-Function，这是一个包含七类生物安全相关问题类型、共计 111 项评估的可验证基准测试，旨在评估 AI 智能体从实验数据中准确推断生物功能的能力，并揭示了不同模型之间的显著性能差异，同时强调了成本并非准确性的可靠预测指标。
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Autonomous Homeostatic Synthetic Cells via Self-Gating DNA Nanopores
本研究展示了一种由配备了门控 DNA 纳米孔的巨型单层囊泡构建的极简合成细胞，该细胞通过利用内部转录的 RNA 阻断剂调节 rNTP 流入的负反馈回路来自主维持稳态，从而使 RNA 的生产在多变的外部条件下能够持续进行长达 16 小时。
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Comparative Transcriptional Responses of Human Blood to Neutron and Photon Irradiation
本研究呈现了首次针对人类血液转录反应在中子与光子辐照下的全基因组分析，揭示了中子会诱导更强效且独特的基因表达谱，该谱图由 cGAS-STING-NF-κB 信号通路驱动，其全局转录组相对生物有效性（RBE）约为 1.3，同时确定了一个 6 小时的狭窄时间窗口及特定的基因特征，这些对于在生物剂量学中区分中子暴露与光子暴露至关重要。
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Optogenetic control of actin crosslinker length reveals a mechanical basis for cortical symmetry breaking
通过利用光遗传学工具箱来操纵肌动蛋白交联物的长度，本研究表明肌动蛋白皮层的力学特性（特别是其硬度和应力强化行为）编码了一个长度依赖型开关，该开关决定了细胞是发生皮层脱离，还是发生极化与对称性破缺。
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Structure of an RNA polymerase ribozyme replication complex
本文展示了一个 RNA 聚合酶核酶复制复合物的结构，揭示了定向进化如何将一个保守的催化核心塑造成类似于蛋白质聚合酶的“右手”构型，以促进遗传物质的复制。
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A thermodynamic framework for mapping elastic recoil mechanism across the human proteome
本文提出了一个利用序列衍生熵估计和蛋白质语言模型来对全人类蛋白质组中的弹性蛋白质进行制图、分类和预测的热力学框架，揭示了独特的回弹机制，并将其功能范围扩展到了传统的结构材料之外。