Computational Synthetic Inner Membrane Reveals Cardiolipin-Leak Control of ATP Output
该研究提出了一种可重复的计算合成线粒体内膜框架，通过系统扰动和敏感性分析揭示了心磷脂含量与膜泄漏之间的权衡关系是调控 ATP 产出的关键，从而为可编程生物能膜的设计提供了定量规则。
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biophysics
613 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Critical Assessment of ML models for ADMET Prediction in TDC leaderboards
本文对 Therapeutics Data Commons (TDC) ADMET 排行榜中的 22 个终点进行了批判性评估，发现绝大多数顶级模型因代码缺失、环境不可复现或数据泄露等问题无法复现，仅少数模型通过验证，从而揭示了公开测试集过拟合导致的指标虚高问题，并呼吁建立包含隐藏测试集、严格版本控制及标准化推理环境的更优基准体系。
Impact of Image Representation on Deep Learning-Based Single-Cell Classification by Holographic Imaging Flow Cytometry
本文首次系统评估了全息成像流式细胞术中不同图像表示对深度学习单细胞分类性能的影响，揭示了重建相位图像精度最高但计算成本大，而简化表示或加速重构方法能在显著降低处理时间的同时保持较高准确率，并通过帕累托分析为平衡精度与效率提供了优化策略。
Enhanced 2D structured illumination microscopy: super-resolution with optical sectioning and reduced reconstruction artifacts
本文提出了一种增强型二维结构光照明显微镜技术，通过结合用于去除离焦背景的大周期条纹和用于突破衍射极限的小周期条纹，实现了兼具光学切片能力、高对比度超分辨率成像以及显著降低重建伪影的效果。
Local GPCR density tips the balance of μ-opioid receptor trafficking
该研究利用单粒子追踪技术揭示，μ-阿片受体的局部表面密度通过形成亲和力基质促进 GRK2/3 和β-arr 的可逆相互作用，从而在低密度下无法触发但在高密度下能驱动受体内吞，而 B 类 GPCR 则通过隔离β-arr 阻断这一过程。
Stretching drives Membrane Homogenization of Phase-Separated Supported Lipid Bilayers
该研究利用柔性基底上的支撑脂双层模型，证实了膜张力通过诱导相分离区域均质化及连续相变，可作为调控细胞膜侧向组织结构的物理机制。
Large-scale simulations reveal evolutionary constraints on intrinsically disordered regions imposed by full-length protein architecture
该研究通过大规模分子动力学模拟揭示，全长蛋白的架构对内在无序区域（IDRs）施加了显著的进化约束，使其构象与有序结构域协同演化，从而形成特定的结构 - 功能特化模块。
A universal scaling law for mitotic spindles across eukaryotes driven by chromosome crowding
该研究揭示了一条由染色体拥挤产生的压缩力所驱动的通用有丝分裂纺锤体标度律，即中期板宽度随基因组大小呈 1/3 次幂的标度关系，从而解释了真核生物如何适应巨大的基因组差异并推动了多倍体细胞的进化与肿瘤进展。
Radiation dose effects in correlative X-ray / cryo-electron microscopy of frozen hydrated biological samples
该研究证实，尽管同步辐射 X 射线成像（最高剂量达 100 MGy）会对冷冻含水生物样品造成一定损伤，但样品仍可进行后续冷冻电镜分析并获得近原子分辨率（约 4 Å）的结构信息，从而为结合 X 射线与冷冻电镜技术开展厚样品多尺度成像奠定了坚实基础。
QuantiTrack: A unified software to study protein dynamics in living cells
本文介绍了 QuantiTrack 这一基于 MATLAB 的图形化单分子追踪分析软件，旨在通过提供端到端的解决方案和严格的质量控制指标，帮助生物学家无需编程背景即可研究活细胞内蛋白质动力学，并以糖皮质激素受体为例展示了其在解析激素治疗响应机制中的实际应用价值。