Accurate interdomain contacts in mixed folded proteins from NMR-guided coarse-grained simulations
该研究通过在粗粒度模拟中引入基于 NMR 化学位移数据的骨架二面角项,成功修正了混合折叠蛋白(如 DNAJB6)的局部构象偏差,从而准确重构了包含折叠结构域与无序连接区的复杂体系中的结构域间接触图谱。
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生物物理学是一门迷人的交叉学科,它像一座桥梁,将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里,研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠,甚至探索意识背后的物质基础,让抽象的生命现象变得清晰可测。
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该研究通过在粗粒度模拟中引入基于 NMR 化学位移数据的骨架二面角项,成功修正了混合折叠蛋白(如 DNAJB6)的局部构象偏差,从而准确重构了包含折叠结构域与无序连接区的复杂体系中的结构域间接触图谱。
本研究揭示了赤潮藻*Chattonella marina*通过昼夜节律调节其前鞭毛长度和摆动频率,从而控制游动速度以优化昼夜垂直迁移,并首次通过药理学证据证实了细胞内运输(IFT)机制在其中起关键作用。
该研究通过引入睡眠稳态过程中的随机性,揭示了个体间睡眠稳态动力学的变异性如何导致人群层面的睡眠时型分布呈现右偏,从而解释了为何睡眠时型不能直接作为内在昼夜节律周期的代理指标。
该研究通过建立由 E-和 N-钙黏蛋白组成的非平衡物理模型,揭示了细胞间连接(CCJ)的力学动态特性,阐明了两种钙黏蛋白对细胞骨架力机械敏感性的差异是驱动具有不同粘附强度的杂交上皮/间质(E/M)状态形成的关键机制。
该研究通过光谱分析证实,具有迁徙起源的家养鹌鹑其隐花色素 4a(CRY4a)表现出与欧洲知更鸟相似的磁敏感性,表明鹌鹑是解析候鸟磁感应机制的潜在理想实验模型。
该研究揭示,在秀丽隐杆线虫中,用于标记 F-肌动蛋白的 Lifeact::mKate2 过量表达会逆转皮层活性扭矩的手性,进而导致肌动球蛋白流动、6 细胞期细胞接触模式及最终生物体左右轴手性的镜像反转,从而证实了活性扭矩的手性直接决定了生物体左右轴的建立。
该研究利用扩张显微镜和高速成像技术揭示,草履虫通过在其细胞表面构建具有不同时空模式的异质性纤毛阵列,实现了摄食与游泳两种流体功能的局部编码与同时执行。
该研究提出了一种利用消费级紫外固化树脂快速、低成本制造光学级半球形固体浸没透镜(SIL)的单步工艺,其成本较商用玻璃透镜降低五个数量级,在显著提升普通光学显微镜分辨率的同时,为显微成像技术的普及与光学教育提供了极具可扩展性的解决方案。
本文提出了一种名为 BEEP 学习的新型机器学习框架,通过整合荧光染料的发射光谱、激发变异性和光漂白动力学等多维特征,利用基于秩一张量的广义线性模型,显著提升了在复杂生物样本中对多重荧光标记的区分能力与成像准确性。
该研究通过粗粒度分子动力学模拟,揭示了内折蛋白(endophilin)的 NBAR 结构域亚基如何通过协同作用识别并诱导负高斯曲率,从而促进膜芽形成及半裂变,阐明了其在非经典胞吞途径中的关键调控机制。