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微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
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本研究鉴定了从大西洋鲑鱼肠道中分离出的红球菌 ASF-10 菌株，证实该菌株能通过特定的酶系（如烷烃单加氧酶和 Baeyer-Villiger 单加氧酶）有效降解氧化聚乙烯产生的低分子量衍生物，为利用鱼类肠道微生物修复氧化微塑料污染提供了新的科学依据。
本研究开发了一种新型质粒救援系统，通过共表达痘病毒加帽酶（D1R 和 D12L）及 T7 RNA 聚合酶，显著提高了哺乳动物细胞中鼠诺如病毒（MNV）的拯救效率及病毒滴度，为评估病毒突变体提供了一种稳健且高通量的方法。
该研究通过长读长基因组测序和功能分析揭示，尽管温带和热带笛鲷（Siphamia）宿主均严格特异性地结合发光细菌 Photobacterium mandapamensis，但该共生菌在菌株水平上展现出显著的基因组可塑性（如移动遗传元件扩张和辅助基因差异）及表型灵活性（如发光强度变化），证明了宿主在维持严格共生特异性的同时，共生伙伴具备适应环境变化的基因组弹性。
该研究提出了一种名为 MATRIX 的高效工作流程，通过整合样本提取、荧光染色、自动显微成像分析及贝叶斯统计推断，实现了对环境微生物群落中总细胞数、活性细胞及单细胞表型的快速、直接且可重复的定量分析，从而克服了传统间接方法的局限性并深化了对微生物生态响应的机制理解。
该研究通过结合原位动物梯度培养与宏基因组及宏转录组分析，首次揭示海洋沉积物中的底栖动物（如小型和大型底栖无脊椎动物）能显著且选择性地增强 DNA 病毒的丰度、多样性及转录活性，从而确立了其作为 DNA 病毒动态关键调节因子的新生态角色。
该研究验证了鞋底尘作为微生物采样方法的有效性，发现其能可靠反映环境微生物暴露，并揭示了细菌和真菌群落对植被绿度的响应分别受路径局部和景观尺度绿度的不同驱动。
该研究通过理论模型与微滴实验证实，微尺度空间碎片化能通过减缓细菌生长和限制抗生素进入细胞等物理机制，在不依赖基因突变或群体保护的情况下，显著促进细菌在抗生素环境中的存活。
该研究揭示，植物叶片微生物群中酵母与细菌通过协作交换铁载体（如红锈素），不仅维持了群落稳定性，还通过激活植物防御反应来共同抵御病原菌感染。
该研究通过对两台机器中金属加工液的培养分析，鉴定出 27 种细菌和 1 种真菌（其中 20 种为首次发现），并深入探讨了这些微生物的生长、健康风险、污染途径及其在烃类降解中的代谢作用。
该研究证明，利用环境采集的细菌与绿藻共培养可显著降低藻类生物燃料作物因真菌感染导致的损失，从而在不增加成本的情况下提高其经济可行性。