🧬 生物学
Inverse design of chemical perturbations for desired cellular state transitions with GEMGen
该论文介绍了 GEMGen，这是一个基于大语言模型的框架，通过生成能够诱导期望细胞状态转变的新型化学结构来解决扰动生物学中的逆向设计问题，并成功在动物模型中鉴定并验证了强效抗纤维化化合物。
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q-bio
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🧬 生物学
A Spatial Model of Chronic Wasting Disease and the Optimal Placement of a Sight-Based Cull
本研究利用真实景观上的空间反应-扩散模型证明，虽然针对临床感染鹿科动物的最佳视觉化捕杀可以减缓慢性消耗性疾病的传播并使易感种群恢复，但由于来自临床前动物和环境宿主的显著传播，在数学上无法阻止其入侵。
🧬 生物学
Library size and structure, not synthetic labels, explain apparent benchmark--experiment discrepancies in antibody machine learning
本文表明，抗体机器学习中合成基准测试与实验结果之间表面的差异，源于库规模、结构和噪声的不可控差异，而非使用合成标签所致，并展示了匹配这些条件可以解决大部分性能分歧。
🧬 生物学
A leading genetic cause of short stature in an Arab population
这项研究鉴定出一种在阿拉伯阿联酋人群中高度富集的罕见奠基者效应 GHSR 错义变异（p.Arg141Leu），该变异通过一种对生长激素治疗有反应的半显性遗传模式，解释了超过 10% 的身材矮小病例。
🧬 生物学
Developmental perturbation of Purkinje cell function induces male-biased core and associated autism spectrum disorder–like phenotypes in adulthood
本研究表明，出生后早期阶段对浦肯野细胞功能的瞬时化学遗传学干预，会诱发成年期具有雄性偏向性的核心及相关自闭症谱系障碍样表型，并伴随后脑和前脑中性别依赖性的转录变化，从而强调了发育性小脑功能障碍可能是导致自闭症谱系障碍易感性存在性别差异的一个潜在因素。
🧬 生物学
Deep Feature Selection and Multi-Sparsity Functional Connectivity Networks for Autism Classification
本研究提出了一种结合深度特征选择与多稀疏性功能连接网络的方法框架，利用来自871名参与者的静息态功能磁共振成像（fMRI）数据，以86.2%的准确率对自闭症谱系障碍进行分类，并识别出主要集中在额叶、枕叶和顶叶脑区的判别性连接。
🧬 生物学
Temporal organization of the Plasmodium falciparum transcriptome prioritises genetic polymorphisms associated with artemisinin response
通过将节律性转录组数据与群体基因组学及敏感性检测相结合，本研究鉴定了 10 个基因中的 13 个非同义变异，这些变异在转录时间上与 *pfk13* 同步，并可作为恶性疟原虫青蒿素耐药性的潜在补充中介因子。
🧬 生物学
RAD51 novel target EIF4A1 promotes colorectal cancer cell proliferation and migration via the CYP51A1/cholesterol metabolic homeostasis pathway
这项研究揭示了 RAD51 通过上调 CYP51A1 并维持胆固醇代谢稳态，在转录水平激活 EIF4A1，从而促进结直肠癌细胞的增殖与迁移。
🧬 生物学
Habitat-mediated reassembly of rodent assemblages along an urban–suburban–rural gradient
这项研究表明，武汉的城市化主要通过由生境介导的物种更替和优势种转变来塑造啮齿动物群落，即居住区倾向于支持较大的鼠属（*Rattus*）物种，而农田和林地则分别支持较小的姬鼠属（*Apodemus*）和穗鼠属（*Niviventer*）物种，而非通过统一的种内性状响应。
🧬 生物学
Integrative hdWGCNA and multi-model validation identify BAIAP2 as a shared neuronal hub for cognitive impairment acrossAlzheimer's disease, diabetic encephalopathy and brain aging
通过将单细胞转录组学与多模型验证相结合，本研究确定了 BAIAP2 是一个保守的神经元枢纽基因，其表达下调是连接阿尔茨海默病、糖尿病性脑病及大脑衰老中认知功能障碍的统一分子机制。