🧬 biology
Biodiversity-forest structural diversity relationships differ among taxa
通过利用遍布美国和波多黎各的航空激光雷达和实地数据，本研究表明，尽管森林结构多样性是鸟类、哺乳动物和甲虫分类多样性的重要驱动因素，但这些关系具有特定类群性，且在强度和方向上各不相同，这与在植物中观察到的微弱关联不同。
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q-bio
1754 篇论文
🧬 biology
Codon Usage Bias Shapes CpG Architecture in Millet Coding Sequences
这项针对六种小米及其相关C₄禾本科物种的全基因组分析表明，同义密码子使用偏好性积极地塑造了编码序列中的CpG二核苷酸结构，这暗示了密码子的选择与排列预先配置了基因体甲基化的结构基质，并将密码子偏好性的功能角色从翻译效率扩展到了表观遗传维度。
🧬 biology
Shared genetic mechanisms link type 2 diabetes to CMR-derived cardiac remodeling
这项研究揭示了 2 型糖尿病与心血管磁共振衍生的心脏重构具有显著的遗传架构，识别出 156 个共享位点并优先确定了 18 个候选基因，其中包括六个可能驱动糖尿病相关心脏结构改变的核心免疫调节基因。
🧬 biology
Dysbiotic shifts in intestinal Streptococcus, Veillonella, and butyrate-producing bacteria are associated with disease severity in hepatitis E
本研究利用宏基因组鸟枪法测序技术证明，以链球菌属（*Streptococcus*）和韦荣氏球菌属（*Veillonella*）相关物种（sCAG5 和 sCAG4）相对于产丁酸盐细菌（sCAG10）比例上升为特征的菌群失调转变，可作为衡量戊型肝炎疾病严重程度的新型肠道微生物指标。
🧬 biology
Mining and Analysis of Key Genes in the Biosynthetic Pathway of Kinsenoside in Anoectochilus roxburghii
本研究确定了茉莉酸甲酯诱导的最佳条件，并利用 RNA-seq 结合 WGCNA 锁定了参与二倍体和四倍体报春苣（*Anoectochilus roxburghii*）中药用成分亲芹苷生物合成的关键基因，其中包括显著上调的 UGT88F3 及其他 15 个候选基因。
🧬 biology
Low GROa/CXCL1 expression predicts poor outcome and promotes tumour progression in vivo and in vitro, revealing a context-dependent tumour-suppressive role in triple-negative breast cancer
本研究表明，低水平的 GROα/CXCL1 表达预示着三阴性乳腺癌的生存率降低并促进肿瘤进展，揭示了其具有值得进一步研究作为预后生物标志物和治疗靶点的背景依赖性抑癌作用。
🧬 biology
Assembly and characterization of the mitochondrial genome of Camellia pitardii Coh.-St
本研究首次对茶属植物 *Camellia pitardii* 的线粒体基因组进行了全面的组装与表征，揭示了其结构特征、基因含量及进化动态，同时强调了线粒体与叶绿体系统发育之间的拓扑不一致性，为茶属植物未来的比较基因组学研究及种质资源利用提供了基础资源。
🧬 biology
Genome-wide identification, structural characterization and gene expression analysis of CYP450 family under different light-conditions in Coptis chinensis
本研究全面鉴定并表征了黄连（*Coptis chinensis*）中的 283 个 CYP450 基因，揭示了其不均匀的染色体分布、组织特异性表达，以及在弱光和长光周期条件下的显著上调现象，这表明由光响应元件和 MeJA 元件介导的调节作用在生物碱积累中发挥着重要作用。
🧬 biology
Brain-region-aware genetic prioritization separates Alzheimer disease risk from APOE-sensitive β-amyloid burden in public genetic and expression quantitative trait locus resources
通过整合公共遗传学和表达资源，本研究证明了阿尔茨海默病风险与 β-淀粉样蛋白负荷代表了不同的生物学过程，在确定 BIN1 为广泛风险锚点的同时，表明此前被涉及的 ZNF227 信号主要由 APOE 区域变异而非独立的淀粉样蛋白病理所驱动。
🧬 biology
Identification of Maize Fusarium Ear Rot Resistance Genes via Integrated BSA-Seq and RNA-Seq Analysis
本研究整合了 BSA-Seq、RNA-Seq 和 WGCNA 分析，以阐明玉米对禾谷镰刀菌（*Fusarium graminearum*）抗性的分子机制，鉴定了 8 个抗性相关位点和 6 个高置信度候选基因，这些基因涉及氧化应激、激素信号传导和细胞壁修饰，从而区分了抗性系 K0743 与感病系 K0742。