q-bio 篇论文 | Gist.Science

对日本破碎化景观中草地植物群落进行的十年期重新调查显示，显著的物种流失和群落解体是由近期的生境破坏以及作为灭绝债务持续存在的历史景观变化共同驱动的，且这些滞后效应因空间尺度和植物功能群而异，从而强调了在生境保护之余进行前瞻性修复的必要性。

这项研究表明，在人类化 DFNB111 小鼠模型中，只要 Deiters 细胞结构保持完整，即使在耳蜗发育成熟后，体内碱基编辑仍能有效恢复听力，从而确立了结构完整性而非生理年龄是决定治疗窗口的关键因素。

通过分析肺腺癌和结直肠癌，本研究绘制了肿瘤微环境中功能可塑性的图谱，揭示了与免疫抑制相关的肿瘤特异性过渡性髓系状态，以及多种细胞类型向相似功能状态的广泛趋同。

这项独立的计算研究表明，机器学习分类器（尤其是随机森林）能够利用短 k-mer 频率特征有效地将 CTCF 相关 DNA 序列与二核苷酸打乱的背景区分开来，从而建立了一个将分子生物学与应用机器学习相结合的透明且可重复的端到端工作流。

这项涵盖整个后生动物的系统发育基因组学研究表明，前列腺素类受体经典的八家族结构是脊椎动物特有的创新，并揭示了此前被提议的非脊椎动物同源物实际上是不同的受体谱系，其与脊椎动物 EP4 受体的表观相似性源于系统发育上的亲缘关系而非真正的直系同源性。

本研究表明，沙棘果提取物通过雌激素受体α（ERα）介导的β-catenin信号通路上调，促进骨形成并抑制骨吸收，从而在去卵巢小鼠中发挥骨保护作用。

通过一项利用环境DNA进行的跨分类群大规模分析，本研究表明，非常年性河流拥有不同于常年性河流和陆地土壤的独特且多样化的生物群落，挑战了将其仅视为过渡系统的观点，并凸显了它们在全球生物多样性中的关键作用。

本系统综述综合了关于镰状细胞病肠道微生物组的异质性人类证据，旨在提出一个超越不一致的分类谱系、转向关于功能性代谢改变的可检验假设的循证框架。

通过将一种新型模拟退火框架应用于来自四种人类癌症的单细胞 RNA-seq 数据，本研究识别了五个保守的 T 细胞耗竭驱动因子和二十个新的候选基因，同时揭示了挑战先前报道的标记物（如 NR4A1）具有普遍作用性的组织特异性耗竭特征。

这项研究揭示了浸润性小叶癌具有独特的血管-免疫微环境，其特征为 IL33 高表达的分化内皮细胞、减少的血管生成芽生以及 IL1RL1 表达肥大细胞的富集，这些特征共同使其区别于浸润性导管癌。