🧬 生物学
Semi-metric optimal transport enables robust spatial multi-omics integration
本文介绍了 SpaOT，这是一个稳健的空间多组学整合框架，它基于具有理论依据的半度量最优传输公式，能够在尽管存在细胞组成和测量技术差异的情况下，实现精确的对齐、具有代表性的组织重心化以及跨不同样本、分辨率和模态的稳定生物学比较。
🧬 Category
q-bio
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🧬 生物学
Phylogenetic Differentiation and Species Delimitation among Iranian Quercus L. (Fagaceae) Using Nuclear ITS2 and Chloroplast rbcL Barcodes
本研究表明，虽然叶绿体 *rbcL* 标记由于过于保守而无法解析亲缘关系较近的伊朗栎属物种，但核基因 ITS2 区域——尤其是与 *rbcL* 结合使用时——为 *Quercus brantii*、*Q. infectoria*、*Q. libani* 和 *Q. robur* 提供了稳健的系统发育解析能力和有效的物种界定，从而为它们的分类学和保护工作建立了至关重要的分子框架。
🧬 生物学
Detecting White Rhinoceros DNA From Footprints
本研究建立并验证了一种新型的、物种特异性的 qPCR 检测方法，能够从足迹中检测南白犀的热线粒体 DNA，为在复杂生境中监测行踪诡秘的犀牛种群提供了一种极具前景的非侵入性工具。
🧬 生物学
Postnatal Changes in ChAT and NGF Expression in Rat Oculomotor Neurons
本研究表明，在出生后发育过程中，大鼠动眼神经元中的 ChAT 和 NGF 蛋白表达均呈进行性增加，这暗示 NGF 信号通路的同步上调可能支持了这些胆碱能运动神经元的成熟及其卓越的抗退行性特征。
🧬 生物学
Basolateral amygdala neurons await oscillatory recruitment into valence-relevant ensembles
这项研究揭示了由中间神经元驱动的振荡状态如何根据特定亚群基底外侧杏仁核神经元的频率敏感性和投射目标，选择性地招募这些神经元，从而通过编排不同的效价特异性集合来驱动行为结果。
🧬 生物学
Morpho-anatomical and molecular characterization of Isoberlinia doka ectomycorrhizal morphotypes in the Sudanian woodlands
本研究证实，贝宁的豆科木（*Isoberlinia doka*）始终与多样化的真菌群落形成外生菌根共生关系，揭示了其在潮湿的苏丹-几内亚地带的定殖率显著高于较干燥的苏丹地带，并为未来的林地修复工作建立了基础性参考。
🧬 生物学
Centromeric retention and recurrent introgression preserve adaptive ancestry across ploidy barriers in common reed
本研究表明，着丝粒区域的重组抑制使得共同芦苇在倍性屏障中能够保留共享的适应性祖先遗传信息，在促进重复生态适应的同时，也根据局部结构背景驱动了谱系特异性的分化。
🧬 生物学
Unlocking Programmable and Creative RNA Sequence Design with RDiffusion
RDiffusion 是一种基于离散扩散模型的生成式 Transformer，它在设计多样化且具有功能的 RNA 序列方面优于现有方法，并成功鉴定出一种用于治疗骨关节炎的新型治疗性微小 RNA 模拟物，从而建立了 AI 驱动的 RNA 发现新范式。
🧬 生物学
Heart Rate Variability Has No Unique Meaning Without Heart Rate as Revealed by β-Adrenergic Blockade
通过在犬类模型中使用特定于受试者的心率依赖性主曲线框架，本研究表明，β-肾上腺素阻断从根本上改变了内在的心率-变异性关系，而非仅仅移动了运行点，从而证明了如果不考虑并发的心率，心率变异性便缺乏独特的生理学意义。
🧬 生物学
Identification of Selenium Metabolism Related Prognostic Genes in Ovarian Cancer and Experimental Validation
本研究识别了八个与卵巢癌预后相关的硒代谢基因，开发了一个用于生存评估的经验证的风险预测模型和列线图，并通过生物信息学和分子分析实验证实了它们的表达模式及其在特定细胞类型中的作用。