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What Knowledge Can Be Extracted from Single-Cell Data? An Empirical Analysis of Donor-Robust Cell-Type Annotation
对人类胰腺单细胞 RNA 测序数据的实证分析表明，对于丰度高的经典细胞类型，细胞类型注释模型在通过留一供者法进行评估时，与随机拆分相比仅表现出轻微的性能下降，从而证明了在声称从单细胞数据中提取知识时，明确阐明其群体和技术范围的必要性。
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q-bio
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When Do Single-Cell Foundation Models Beat PCA? A Simulation-Based Empirical Analysis of Label Scarcity and Perturbation Generalization
这项基于模拟的研究表明，单细胞基础模型在标签稀缺的注释任务（每类仅 1–5 个标记细胞）中显著优于经典的 PCA 流水线，但在有充足标签可用或预测对新扰动的响应时，相比简单的线性基准模型几乎没有优势。
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Rank or Value? An Empirical Analysis of Single-Cell Transformer Tokenization under Sequencing-Depth Loss
这项实证研究表明，在单细胞 RNA 测序中，固定表达值分箱法在测序深度损失下的细胞分类表现优于语料库中位数秩编码，从而揭示了对库大小乘法的不变性并不保证对随机分子丢失的鲁棒性。
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Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology
这项实证分析表明，在基因调控网络基准测试中限制候选空间会显著使跨组织方法的排名发生不稳定，这表明候选定义选择可能会改变比较结论，因此应当随结果一同报告，而非将其视为中性因素。
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Bacteria getting wired: The porin-cytochrome complex Om(abc)B kickstarts extracellular electron transfer and nanowire formation
这项研究揭示了硫还原地杆菌（*Geobacter sulfurreducens*）利用一种顺序性的两阶段胞外电子传递策略，即通过孔道-细胞色素复合物 Om(abc)B 首先实现高耗能的 OmcS 纳米线合成，从而使细胞能够从无线模式切换到有线模式，从而极大地扩大了其获取用于复制的 Fe(III) 的范围。
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Integrative genomic and network analyses map horizontal gene transfer dynamics in Pantoea agglomerans
通过对165个基因组的整合基因组学和网络分析，本研究揭示了聚集泛Pantoea（*Pantoea agglomerans*）拥有由水平基因转移驱动的开放式泛基因组，这种转移主要由质粒介导，并受到以聚合泛Pantoea（*Pantoea vagans*）为关键供体的生态位聚类的影响。
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Bacteroides acidifaciens derived pentadecanoic acid alleviates MAFLD by sensitizing senescent macrophages to ferroptosis via JNK-JUN-NCOA4 pathway
本研究表明，来源于*Bacteroides acidifaciens*的代谢物十五碳酸，通过激活JNK-JUN-NCOA4信号通路使衰老的巨噬细胞对铁死亡更加敏感，从而促进其清除并减轻代谢相关脂肪性肝病（MAFLD），进而缓解该疾病。
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Fast-Paced Breathwork as a Workplace Microbreak Preserves Attentional Orienting and Neural Task Engagement
这项研究表明，与对照组播客不同，15分钟的快速呼吸微休有助于受雇知识工作者维持注意力定向和神经任务参与，因为它防止了指示脱离状态的课后注意力捕获和阿尔法波功率的增加。
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Integrative genomic and transcriptomic analyses identify functionally relevant causal genes for exercise in a large animal model
本研究整合了纯种赛马的基因组学与转录组学数据，旨在识别导致运动表现性状的具体因果基因与变异，并区分遗传性遗传因素与对运动及训练产生的获得性分子反应。
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Agar oligosaccharides mitigate lipopolysaccharide-induced apoptosis and inflammatory damage in rumen epithelial cells via the tlr4-myd88-nf-κb signaling pathway
本研究表明，琼胶寡糖（AOS）通过抑制TLR4-MyD88-NF-κB信号通路，减轻脂多糖诱导的绵羊瘤胃上皮细胞凋亡和炎症损伤，提示AOS可作为缓解反刍动物代谢性疾病的一种潜在绿色饲料添加剂。