HiFi-ST: High-Fidelity Reconstruction of Continuous Spatial Transcriptomic Expression Fields via Conditional Neural Fields
HiFi-ST 引入了一种条件神经场框架,通过将位点(spots)建模为区域观测值并整合多尺度组织特征来重建连续的空间转录组表达场,从而在准确性上显著超越现有方法,并赋能如肿瘤微环境表征等高级下游分析。
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HiFi-ST 引入了一种条件神经场框架,通过将位点(spots)建模为区域观测值并整合多尺度组织特征来重建连续的空间转录组表达场,从而在准确性上显著超越现有方法,并赋能如肿瘤微环境表征等高级下游分析。
本研究表明,乙烯信号组分 MaEIN2 介导了桑叶中由食草作用诱导的氯原酸积累,从而将蚕的摄食信号与增强的植物防御联系起来,并可能支持蚕的发育。
本研究表明,通过引入领域特定元特征与分子表征,优化的梯度提升决策树集成模型在 ApisTox 数据集上的蜜蜂毒性预测准确度较现有基准显著提升。
本研究引入了 DiSuCy,一个经过精心策划的硫代谢基因知识库,旨在揭示不同生态系统中硫循环微生物的进化动态和独特的代谢策略,包括在海洋和人类肠道中发现的新型分类单元和非典型途径。
这项研究揭示了定海湾季节性的环境波动驱动了微生物群落组成、组装过程及网络结构的平行演变,并同时改变了由浮游植物和细菌性浮游生物介导的摄食驱动碳流效率,其中浮游植物始终是主要的碳源。
本文介绍了 WATER,这是一个通过重建独立的基因表达时间轨迹来检测发育与疾病背景下分子异时性(基因表达失时)的计算框架,揭示了传统阶段匹配比较所忽略的广泛转录重组。
这项研究揭示了 GPCR 激活开关架构并非由配体身份组织,而是由一个涉及离子锁、Tyr5.58 和钠结合口袋残基的协同进化结构网络所组织,该网络利用多样且具有谱系特异性的机制来稳定保守的 DRY 精氨酸。
本研究提出了一个结合生态、生物和社会维度的综合承载力框架,旨在为易发生冲突的受威胁物种建立基于证据且符合特定情境的种群目标,并以中国云南野生亚洲象为例,倡导优先考虑人类耐受度并将土地利用政策与保护目标相统一。
本研究通过对37个RNA-seq样本进行组装,并对其功能完整性进行了验证,呈现了一个高质量的多组织转录组与表达图谱,涵盖了窄爪螯虾(*Astacus leptodactylus*),从而为非模式甲壳动物的离子通道研究与功能基因组学建立了基础资源。
本研究通过对20项实验研究和9篇文章进行结构化综合,整合了放射性核素生物积累、代谢率、解剖屏蔽和增殖动力学等因素,提出了一个解释慢性电离辐射下脊椎动物发育放射敏感性种间差异的统一机制框架。