Deep Branching of Archaea: A Phylogenomic Study Using Five Universal Protein Markers
这项利用五种通用蛋白质标记并采用邻接法(Neighbor Joining analysis)进行的系统发育基因组学研究表明,古菌物种 *Thermococcus pelagicus* 代表了最深的分支谱系,其分化时间早于细菌与真核生物的共同祖先,同时将特定的真核生物物种置于细菌分支内。
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这项利用五种通用蛋白质标记并采用邻接法(Neighbor Joining analysis)进行的系统发育基因组学研究表明,古菌物种 *Thermococcus pelagicus* 代表了最深的分支谱系,其分化时间早于细菌与真核生物的共同祖先,同时将特定的真核生物物种置于细菌分支内。
本研究表明,昆虫 *Neolithus fasciatus* 通过广泛的组织重组和特定的细胞壁重塑,在 *Sapium glandulosum* 截然不同的花蜜腺和果皮中诱导产生形态趋同的瘿瘤,同时保留了器官特异性的果胶特征。
通过利用长读段测序和人类泛基因组组装,本研究揭示了预测的 Z-DNA 形成序列与较高的突变密度(特别是插入和缺失)相关联,且这种现象存在于多样的人类单倍型和基因组背景中。
本研究表明,由非生物胁迫诱导并定位至细胞核和细胞质中的辽东滨藜转录因子SlNAC6,通过增强抗氧化酶活性、减轻氧化损伤以及上调应激响应基因,正向调节转基因拟南芥的耐盐与耐旱性。
本研究表明,慢性基因毒性应激与代谢应激驱动了人类小胶质细胞中截然不同但又相互重叠的衰老程序,其特征在于差异化的调节通路、线粒体重塑以及独特的炎症特征,这些特征可能在神经退行性过程中发挥不同的作用。
本研究表明,FINO2 通过抑制 TrxR1,从而阻止 PDI 的还原,进而激活 PDI 氧化酶以驱动 NOS 二聚化、一氧化氮(NO)积累以及随后的脂质过氧化,从而诱导 HT22 神经元发生铁死亡。
本研究表明,低温和短期酸性应激均能显著增强 CHO-K1 和 HEK-293E 悬浮细胞的质膜通透性,其中 CHO-K1 细胞对酸性条件的反应尤为显著且持久,从而确定了细胞外 pH 值是提高生物技术应用中分子递送效率的关键调节因子。
本文提出了一种用于建模生物神经回路的 T-时间 Petri 网框架,该框架通过实现可形式化验证、具有截止日期保证的实时执行,同时保持与连续时间动力学的解析对应关系,克服了固定步长模拟的局限性,并已通过三个模拟微电路得到了验证。
本研究利用全外显子组测序和计算机模拟分析表明,尽管伴有继发性免疫缺陷的 B 细胞淋巴增殖性疾病患者与原发性免疫缺陷患者具有较高的突变频率,但他们表现出独特的遗传特征,其特点是联合免疫缺陷和免疫失调基因的突变发生率更高,以及不同的遗传模式和变异共现模式。
本研究表明,在防止证据复用的分区 ACMG 框架下,仅凭内在序列数据在数学上不足以将错义变异分类为致病性,这揭示了减少临床意义不明负担的方法在于引入多样化的证据类型,而非改进计算预测器。