Characterisation of 16S rRNA gene, phylogenetic analysis, and multidrug resistance profiling of hospital-associated Myroides and Bacillus strains from Anambra State, Nigeria
本研究通过详细阐述从尼日利亚阿南布拉州医院环境中分离出的两种多重耐药机会性致病菌——*Myroides* sp. strain Awka-1 和 *Bacillus* sp. strain Awka-1 的表型耐药谱、质粒携带情况及其系统发育关系，旨在建立用于追踪医疗相关感染环境储库的基线分子标记。
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医院是旨在治愈疾病的地方，然而其墙壁和空气有时也会隐藏着无形的威胁。在这些建筑内部，微小的细菌生活在物体表面、灰尘中，甚至漂浮在气流中。这些微生物大多是无害的，但其中一些是机会主义性的，这意味着它们在等待机会去感染那些免疫系统已经削弱的人群。医生和科学家面临的一个主要担忧是，许多这类细菌已经学会了抵抗旨在杀死它们的药物。当一种单一的病原体在接受多种不同药物处理后依然存活下来时，它就变成了“多重耐药”病原体，使得感染变得更加难以治疗。为了了解这些无形的敌人，科学家经常研究细菌遗传密码中的一个特定部分——一种分子特征，它就像指纹一样，能够让科学家准确识别出他们正在面对的是哪种生物，以及它与其他已知细菌的关系。
在最近一项针对尼日利亚阿夫卡（Awka）医院的研究中，研究人员着手调查了在这些医疗环境中发现的两种特定细菌菌株。他们试图寻找这些病菌如何生存和传播的线索，特别关注它们抵抗抗生素的能力及其遗传组成。研究小组从两个截然不同的来源收集了样本：一家专科医院病房内的空气，以及医护人员穿着的衣物。他们从空气中分离出了一种被命名为 Myroides sp. strain Awka-1 的细菌。从工作人员的着装中，他们发现了第二种菌株，即 Bacillus sp. strain Awka-1。这两种生物都是已知的机会主义生物，能够给脆弱的患者带来麻烦，但在此项研究之前，它们在该地区的特定遗传图谱和耐药模式尚未得到充分记录。
研究人员首先测试了这些细菌对多种常见抗生素的反应。结果显示，这两种菌株确实对多种类型的药物具有耐药性。空气中的菌株对青霉素类、头孢菌素类、氨基糖苷类和喹诺酮类药物具有耐药性。衣物上的菌株则对氟喹诺酮类、青霉素类和酚类药物具有耐药性。为了衡量这些细菌的耐药程度，科学家为每种细菌计算了一个耐药评分。空气中的菌株得分为 0.5，而与衣物相关的菌株得分为 0.4。这些数字表明，测试的相当一部分抗生素未能阻止这些细菌的生长。此外，团队还在细菌内部寻找了质粒，即通常携带耐药指令的小型额外 DNA 环。他们在两种菌株中都发现了质粒的证据，这表明这些细菌有可能将它们的耐药特性分享给周围的其他病菌，这一过程有助于危险特征在医院内快速传播。
为了准确了解这些细菌究竟是什么以及它们在生命之树中的位置，研究人员对一种被称为 16S rRNA 基因的特定基因进行了测序。这种基因是鉴定细菌的标准工具，因为它随时间变化非常缓慢，使科学家能够追踪进化关系。遗传分析证实，空气中的菌株属于 Myroides odoritimimus 家族，与该物种的其他已知菌株亲缘关系密切。在衣物上发现的菌株被鉴定为 Bacillus cereus 复合物的一部分，这是一组以能够形成坚韧的休眠孢子而闻名的细菌，这些孢子使其能够在织物等干燥表面长期存活。通过将他们新的遗传序列与庞大的全球数据库进行对比，研究人员将这些尼日利亚菌株牢固地归入已建立的细菌类别中，从而毫无疑问地确认了它们的身份。
这项研究强调了一条特定且常被忽视的感染途径：医院病房内的空气以及工作人员穿着的衣服。空气中存在这些耐药细菌表明，通风系统和气流可以将病菌从一个地方移动到另一个地方，而医护人员衣物上的发现则表明，制服可以作为这些顽强微生物的移动储库。研究人员将他们的遗传数据上传到了一个公共国际数据库中，建立了一个永久记录，以便其他科学家将来可以追踪这些特定的菌株。虽然这项研究为安布拉州（Anambra State）三家医院的情况提供了一个清晰的快照，但它也指出需要进行更广泛的全国性监测，以充分了解问题的规模。这项工作是一项基础性的步骤，提供了精确的遗传标记和耐药谱，将有助于卫生部门监测和控制这些难以治疗的细菌在尼日利亚医疗环境中的传播。
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