Rational Design and Experimental Validation of a CCR7-Targeted Multi-Epitope Cytokine Fusion Protein for Cancer Immunotherapy
本研究报告了一种新型靶向 CCR7 的多表位细胞因子融合蛋白的合理设计、结构验证及实验表征,该蛋白成功激活了先天性和适应性免疫反应,从而在临床前模型中抑制乳腺癌生长并增强全身免疫。
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人类免疫系统是一个庞大而复杂的网络,旨在识别并消除威胁,从入侵的细菌到人体自身的变异细胞。在癌症的情况下,这种防御系统往往无法识别肿瘤,或者被疾病隐藏自身的能力所压倒。帮助免疫系统反击最有效的方法之一是充当向导,将免疫细胞直接引导至肿瘤部位。这种引导系统的关键部分涉及免疫细胞表面的一种特定受体,称为 CCR7。可以将这个受体想象成细胞表面的一种专门的锁。当正确的化学钥匙插入其中时,细胞就会接收到移动、增殖和攻击的信号。人体内有两种被称为 CCL19 和 CCL21 的天然化学物质通常充当这些“钥匙”,但它们在作为药物使用时存在局限性。
研究人员长期以来一直在寻求一种更强大、全能的工具,能够触发更广泛的免疫反应,同时专门针对这个“锁”。挑战在于如何将免疫系统工具箱中的不同部分组合成一个单一且稳定的分子,以便人体能够有效地产生并使用它。如果能设计出这样一种分子,它或许能够同时唤醒多种类型的免疫细胞,从而发起一场比现有疗法更有效的协同进攻。这正是来自伊朗和格鲁吉亚的一个科学家团队试图回答的核心问题:他们能否构建一种定制的蛋白质,既能作为 CCR7 受体的“万能钥匙”,又能携带额外的指令来提升免疫系统的整体力量?
该团队并非从实验室里的试管开始工作,而是首先在数字环境中,利用计算机模型设计了一种新型蛋白质。他们想要创造一种融合蛋白,本质上是将四种不同的天然免疫信号的部分缝合在一起的单一分子。他们选择了来自 CCL21 和 CCL19(即 CCR7 受体的天然钥匙)的部分,以确保新蛋白能找到目标。在此基础上,他们加入了来自另外两种已知能促进免疫细胞成熟与激活的免疫信号——GM-CSF 和 IL-1β 的片段。其目标是将这四个不同的部分融合为一个连续的链条,并保持稳定和功能。在构建之前,他们进行了广泛的计算机模拟,以观察该分子如何折叠成三维形状,以及它如何与 CCR7 受体相互作用。这些数字测试预测,该新蛋白将具有稳定性,不会引发过敏反应,并且能与受体紧密结合,即使在模拟的人体环境压力下也能保持其形状。
一旦在计算机上确认了设计方案,研究人员便进入实验室使该分子“获得生命”。他们将这种新蛋白的遗传密码插入到一种常见的细菌——大肠杆菌(Escherichia coli)中,使其充当微型工厂。细菌被大量培养,团队成功诱导它们生产出了这种定制蛋白。随后,他们通过化学过程将新蛋白从其余细菌成分中分离出来,得到了纯化样本。为了证明他们制造出的正是设计之物,他们对该蛋白进行了一系列严格测试。他们使用一种按分子量分离蛋白质的技术来确认其大小是否正确,并使用另一种基于抗体的方法来验证其身份。他们甚至使用高精度质谱仪将蛋白质分解成微小的碎片并读取其序列,从而证实它包含了他们编写的精确遗传指令。该蛋白不仅存在,而且结构完整,符合早期计算机模型的预测。
拿到蛋白质后,团队测试了它在活细胞中的表现。他们首先观察了取自健康志愿者和癌症患者的人类免疫细胞。当这些细胞暴露于这种新蛋白时,细胞通过增加与免疫反应相关的基因表达做出反应。具体而言,CCR7 受体及其天然钥匙的水平显著上升,这表明该蛋白成功开启了免疫系统的通信渠道。随后,研究人员将注意力转向癌症本身,在实验室中使用了一种常见的乳腺癌细胞系。当用这种新蛋白处理这些癌细胞时,癌细胞开始死亡。这种效应具有剂量依赖性,这意味着更高剂量的蛋白会杀死更多的细胞。经过三天的处理,特定浓度的蛋白将存活的癌细胞数量减少到了原始数量的三成以下。这种效果非常强劲,足以媲美甚至优于他们所模拟的一种天然钥匙的标准商业版本。
除了单纯杀死癌细胞外,这种新蛋白还改变了癌细胞的运动方式。癌症的扩散发生在细胞脱离肿瘤并迁移到身体其他部位时。在一种用于测量这种运动的实验中,研究人员在层状癌细胞层中制造了一个小缺口,并观察缺口闭合的速度。接受新蛋白处理的细胞移动得非常缓慢,即使在三天后,缺口仍基本保持开放。相比之下,未经处理的细胞在相同时间内几乎完全闭合了缺口。这表明该蛋白不仅能杀死癌细胞,还能阻止它们的扩散。最后,团队测试了该蛋白作为免疫细胞“磁铁”的能力。他们将该蛋白放入装有人类免疫细胞的培养皿中,并观察到大量细胞向其移动,这证明该蛋白保留了将人体的防御者招募到特定位置的能力。虽然这项研究的详细实验部分侧重于实验室(in vitro)和计算机(in silico)模型,但摘要指出,在小鼠肿瘤模型中的初步给药也导致了白细胞计数的增加,暗示了在生物体内的潜在全身性免疫激活作用。
研究结论认为,这种定制设计的蛋白质是进一步开发的有力候选者。它成功地将四种不同的免疫信号组合成一个单一且稳定的分子,并能通过细菌生产。在实验室中,它被证明能够结合其靶点、激活人类免疫细胞、杀死乳腺癌细胞并阻止这些细胞的移动。虽然目前的工作仍局限于计算机模拟和实验室实验,但结果为下一步研究奠定了坚实的基础。研究人员建议,这种将多种免疫信号缝合在一起的方法,可能为治疗癌症提供一种比仅使用单一成分更精准、更强大的新途径。该蛋白现在已准备好在更复杂的动物模型中进行测试,以观察这些充满前景的实验室结果能否转化为针对患者的现实疗法。
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