A novel chromosomally encoded OXA-12-like β-lactamase variant (bla OXA-1433 ) in a new Aeromonas veronii sequence type (ST3591) from ready-to-eat oysters
本研究表征了从即食生蚝中分离出的韦氏气单胞菌(Aeromonas veronii)中一种新型染色体编码的 OXA-12 类 β-内酰胺酶变体(blaOXA-1433)及一种新序列类型(ST3591),强调了海鲜作为新兴抗生素耐药决定因素储库的作用。
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细菌是适应的大师,不断进化出在变化环境中生存的新方式。它们最强大的生存工具之一是耐药性,即对旨在杀死它们的抗生素产生抵抗力。这种耐药性不仅仅是医院里发现的问题;它在河流、海洋和我们食用的食物中自由循环。海鲜,尤其是像牡蛎这样的贝类,生活在自然世界与人类消费的交汇点。由于牡蛎通过过滤大量海水来进食,它们可以聚集环境中的细菌和遗传物质。这使它们成为理解耐药基因如何在环境中移动并可能到达人类手中的关键窗口。科学家们越来越关注即食海鲜中的细菌,不仅是为了确保食品安全,也是为了追踪这些微观防御者在成为人类健康威胁之前的自然进化过程。
在最近的一项研究中,研究人员检查了来自巴西弗洛里亚诺波利斯商业来源的即食牡蛎,以观察它们携带哪些细菌。在样本中,他们发现了一种特定的细菌,称为Aeromonas veronii(威氏气单胞菌)。虽然这种细菌在水生环境中很常见,但研究人员发现,这些牡蛎中的这种细菌却很不寻常。它属于一个此前未知的遗传家族或序列类型,研究人员将其命名为 ST3591。更重要的是,这种特定的菌株对被称为碳青霉烯类(carbapenems)的一类强效抗生素表现出了耐药性。这类药物通常被视为治疗严重感染的最后手段,因此在食物中发现能够抵御它们的细菌具有重要意义。研究团队致力于准确了解这种细菌是如何实现这种耐药性的,以及其耐药性的遗传指令来自何处。
为了解开这个谜团,科学家们使用了先进的基因测序技术来读取该细菌的整个“说明书”,即基因组。他们结合了两种不同的测序技术,以确保捕捉到该生物 DNA 的每一个细节。这种高质量的遗传图谱使他们能够识别出负责抗生素耐药性的特定基因。他们发现该细菌携带了一个名为 blaOXA-1433 的新版本基因。该基因产生一种酶,这种酶是一种类似于“分子剪刀”的蛋白质,能够切开并破坏碳青霉烯类抗生素。研究人员将这种新的酶变体命名为 OXA-1433。它是已知酶 OXA-12 的近亲,两者共享近 95% 的氨基酸构建模块,但在 13 个特定位点上存在差异。尽管存在这些细微差别,这种新酶仍保留了发挥功能所需的关键结构特征,从而有效地中和了药物。
这项研究不仅限于识别基因,还调查了该基因在细菌 DNA 中的位置,以及它是否可以轻易转移到其他细菌中。研究人员发现,blaOXA-1433 基因直接嵌入在细菌的主染色体中,即其遗传信息的中央图书馆。它被一些稳定的、细菌生存所必需的必需基因所包围,例如涉及构建细胞壁和产生能量的基因。至关重要的是,该耐药基因周围缺乏通常有助于耐药性在不同细菌间快速传播的移动遗传元件(如跳跃基因或质粒)。这表明这种耐药性是该特定细菌谱系的内在、内置特征,而非可以轻易传递的近期获得性特征。该基因似乎是这种水生细菌遗传历史中一个稳定的组成部分,随着时间的推移而在该群体中得以维持。
为了证实这个新基因确实是耐药性的原因,团队进行了实验室测试。他们将该细菌暴露在亚胺培南(imipenem,一种碳青霉烯类抗生素)中,并观察细菌是否能够分解它。结果显示,该细菌成功水解(即分解)了抗生素。他们还测试了这种耐药性是否依赖于金属离子,这是另一类耐药酶的特征。测试表明,即使在阻断金属离子的情况下,耐药性依然保持强劲,这证实了 OXA-1433 酶(它不依赖金属)才是活跃的媒介。这一发现排除了另一种酶(该细菌也携带,但需要金属才能发挥作用)是主要原因的可能性。
这种新序列类型的发现及其独特的耐药基因,凸显了生活在我们的食物供应中的细菌所隐藏的多样性。研究人员发现,这种具有新遗传身份和稳定染色体编码耐药性的特定 Aeromonas veronii 菌株,代表了环境中一种此前未知的特征组合。虽然这种特定的细菌目前并不是人类疾病的主要诱因,但它出现在即食牡蛎中的现象提醒我们,水生生态系统是遗传创新的动态储库。研究表明,抗生素耐药性的进化是一个持续进行的自然过程,由细菌对其环境的不断适应所驱动。通过监测这些海鲜的变化,科学家可以更好地理解耐药基因的起源和稳定性,从而在这些微生物防御者遇到人类患者之前,为它们如何进化提供更清晰的图景。
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