Runs of Homozygosity Analysis Reveals 1,900-Year-Old ECEL1 Arthrogryposis Mexican Founder Variant
这项研究确定了一个具有1,900年历史的墨西哥原住民奠基者变异(ECEL1基因中的c.110_155del)是墨西哥远端关节强直5D型的主要原因,在所研究的人群中占致病等位基因的68%。
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每个人都携带一份独特的遗传蓝图,这是一本由四种化学字母编写的长篇说明书。在大多数情况下,我们会从父母双方各继承一个略有不同的版本。这种多样性通常是一种优势,充当着维持我们健康的备份系统。然而,有时一个人会继承两个完全相同的特定指令副本,这种状态被称为纯合性。虽然这可能在任何家庭中由于偶然发生,但当一个族群经历过一段严酷的苦难或隔离时期,导致只有一小部分祖先重新繁衍并填充该地区时,这种情况就会变得更加频繁。当其中一位祖先发生罕见的遗传变化并代代相传时,这种变化在他们的后代中可能会变得异常普遍,科学家称之为创始人效应。了解这些模式有助于医生理解为什么某些罕见疾病会在特定群体中频繁出现,从而将医学之谜转化为一段写在 DNA 中的人类历史故事。
在最近的一项研究中,研究人员致力于解决一个涉及墨西哥患有先天性多发性关节挛缩症(arthrogryposis multiplex congenita)儿童的遗传谜题。这种疾病会导致关节在出生时就处于弯曲固定的状态,影响手部、足部和其他肢体。虽然这种疾病可以由许多不同的原因引起,但团队将重点放在了 93 名接受过详细基因组测序的墨西哥儿童身上。他们发现,在这些儿童中,近一半(共 37 名)携带了一个名为 ECEL1 的基因中的特定遗传错误。该基因对于控制肌肉运动的神经发育至关重要。当这个基因发生故障时,肌肉在胎儿期无法接收到运动所需的信号,从而导致出生时出现的关节挛缩。在携带这种特定遗传错误的儿童中,出现了一个显著的模式:大量儿童携带了完全相同的破碎 DNA 片段,即遗传密码中 46 个字母的缺失。
研究人员想知道为什么这种特定的错误在这一群体中如此常见。一种可能性是许多家庭之间存在亲属关系,这种做法被称为近亲结婚,它增加了儿童继承两个罕见错误副本的机会。为了测试这一点,团队寻找了能够表明近期亲属关系的、长段的相同 DNA 片段。他们发现,虽然这些儿童拥有共同的远亲血统,但他们并没有表现出暗示其父母为近亲关系的那些长而近期的相同 DNA 片段。这排除了近期家族联系是主要原因的可能性。相反,证据指向了一个更为古老的故事。通过分析破碎基因周围的 DNA,团队发现,在 20 名携带两个错误副本的儿童中,有 18 名儿童在错误位置周围共享一段长且相同的 DNA 片段。这段共享的片段就像一个遗传指纹,证明了这些儿童都是从很久以前的一位共同祖先那里继承了这一错误。
利用这段共享 DNA 的长度以及它随时间破碎的程度,研究人员估计这位共同祖先生活在约 1,900 年前。这使得该突变的起源远在欧洲人到达美洲之前。研究还检查了这些儿童更广泛的祖源背景。虽然许多人拥有墨西哥原住民、欧洲和非洲的混合血统,但携带该破碎基因的特定染色体几乎总是具有墨西哥原住民来源。这表明该突变产生于墨西哥原住民群体之中,并通过世代传承了下来。研究人员指出,这种特定错误在具有墨西哥原住民血统的人群中的频率比在欧洲或非洲血统的人群中高出约 30 倍。他们还观察到,该突变可能发生了不止一次,因为研究中的两名儿童虽然也携带相同的错误,但并未共享其他人的那段长 DNA 指纹。这表明 DNA 中发生错误的那个位置可能天生容易发生断裂,或许是因为某种重复的字母模式导致遗传密码不稳定。
研究结果证实,这种特定的遗传错误是墨西哥这种关节疾病的主要诱因,其驱动力是历史性的创始人效应,而非近期的家族通婚。这项研究强调了单个遗传变化——起源于近两千年前——是如何塑造当今人群的健康状况的。通过识别这一特定原因,医生可以为墨西哥的家庭提供更准确的诊断和遗传咨询。这项工作也强调了研究原住民遗传史的重要性,他们的独特故事往往保存在 DNA 中,但在医学研究中仍代表性不足。这一发现不仅解释了一种疾病,更揭示了一段人类历史,展示了遥远过去的单一事件如何持续影响着今日儿童的生活。
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