🧬 biology

Interaction-Token Structural Alignment (ITSA): An Interpretable Framework for Protein Similarity Based on Residue-Level Chemical Interactions

تقدم الورقة البحثية "المحاذاة الهيكلية لرموز التفاعل" (ITSA)، وهو إطار عمل قابل للتفسير يحول هياكل البروتين إلى رموز تفاعل كيميائية حيوية على مستوى الثمالات من أجل المحاذاة المحلية، مما يثبت فعاليته في التقاط التشابه على مستوى العائلة والحفاظ على السياق الميكانيكي حيث تقصر الطرق التقليدية التي تركز على الهندسة.

Samanyu Kulkarni, Ranjita Thapa2026-07-30
🧬 biology

Quantum Biogenesis Driven by Methylated Colloidal Sulfur Within Diamagnetic Metal Matrices and Proto-Cell Self-Assembly

تقترح هذه الورقة نموذجاً للتنشؤ الحيوي الكمومي حيث تصطف معقدات الكبريت الميثيلية حرارياً داخل مصفوفات مغنيسيوم-فضة دايامغناطيسية لإنشاء تدرجات مغناطيسية تعمل كقالب للتجميع الذاتي والانقسام المستقل للأغشية البروتو-خلوية.

Aydın Kurt2026-07-30
🧬 biology

Transforming MRI volumes with Space-Filling Curves reveals Multifractal Signatures of Ageing and Dementia Progression

تقدم هذه الدراسة تحليل المنحنى الممتلئ متعدد الفركتلات (MFSCA) لتوضيح أن التنظيم المكاني لبنيات الدماغ، كما يتم قياسه من خلال تعدد الفركتلات في بيانات التصوير بالرنين المغناطيسي، يتدهور تدريجياً من حالة معقدة وغير متجانسة إلى حالة أبسط ومتجانسة مع تقدم العمر وتطور الخرف.

Marta Lotka, Jacek Grela, Zbigniew Drogosz, Jeremi K Ochab, Paweł Oświęcimka2026-07-30
🧬 biology

Novel genes in spermatozoa as robust markers for reproductive behavior in fish: Physiological perspectives on environmental RNA sequencing

تحدد هذه الدراسة نسخاً جينية جديدة وفيرة للغاية وخاصة بالخصية، لا سيما تلك الشبيهة بـ *pmfbp1*، كعلامات قوية للحمض النووي البيئي للكشف عن السلوك التناسلي للأسماك من خلال أخذ عينات مائية غير جراحية.

Marty Kwok-Shing Wong, Yuto Aminaka, Takehiro Tsukada, Susumu Hyodo2026-07-30
🧬 biology

Exploring ubiquitination-related biomarkers in osteoarthritis based on single-cell and transcriptomic data

تدمج هذه الدراسة بيانات النسخ المتماثل أحادي الخلية والنسخ المتماثل الكلي لتحديد خمسة مؤشرات حيوية مرتبطة باليوبيكويتين (MYC، وTLR7، وCX3CR1، وPER1، وGADD45B) تشارك في إمراضية الفصال العظمي، مما يكشف عن إثراء هذه المؤشرات في مسار TNF-alpha/NF-kappaB، وارتباطها بمجموعات خلايا مناعية محددة، وارتفاع تعبيرها في الخلايا الليفية الزليلية، مما يقدم بذلك أهدافاً علاجية جديدة لهذا المرض.

Tian Lan, Huan Dai, DeGuang Li, ChongYu Zhao, XiaoYu Mu, Li Li, Chao Wang2026-07-30
🧬 biology

Transformed Callus of Panax vietnamensis: Promising In Vitro Platform for Majonoside R2 Production alongside Hairy Roots

تُظهر هذه الدراسة أن الكالوس المحوّل بفعل بكتيريا *Agrobacterium rhizogenes* لنبات *Panjax vietnamensis* يعمل كبديل مستقر، وخالٍ من الهرمونات، وعالي الإنتاجية للجذور المشعرة من أجل الإنتاج المستدام للماجونوسيد R2 (majonoside R2) النادر في المختبر، لا سيالما عند تعزيز ذلك بواسطة التنشيط بـ ميثيل جاسمونات (MeJA).

HUYEN TRAN, THI QUY TRAN, HongIk Yoon, Hei Chan Lee2026-07-30
🧬 biology

Polarity-Registered Nuclear Mapping Reveals Discrete Topological Classes of Chromosome Organization

تقدم هذه الدراسة نظام إحداثيات نووية مسجل القطبية يعمل على تطبيع الهندسة النووية للكشف عن فئات طوبولوجية منفصلة وقابلة للتكرار لتنظيم الكروموسومات في الخلايا الجذعية الميزنكيمية البشرية، مما يثبت أن القيود الميكانيكية وقيود القطبية تقود سلوكيات مكانية غير متماثلة وخاصة بالمتماثلات.

Paolo Netti, Luca Messina, Carlo Natale2026-07-30
🧬 biology

BMP9 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression By Accelerating Cell Cycle through CKS1B Lactylation

تكشف هذه الدراسة أن ارتفاع تعبير البروتين BMP9 يدفع تقدم سرطان الخلايا الكبدية من خلال تعزيز عملية لكتلة (Lactylation) لبروتين CKS1B عند الموقع K4، مما يعزز تفاعل CKS1B مع CDK1–3 ويسهل تحلل p27 لتسريع تقدم الدورة الخلوية.

Hong Tang, Han Chen, Jianhao li, Ying-Yi Li, Mingming Zhang, Jiayi Wang, Xia Zhu, Weixiu Li, Junpeng Zhou, Xiangnan Teng (…)2026-07-30
🧬 biology

FuncDECODE Resolves Cell-Type-Specific Functional Heterogeneity across Biological States and Spatial Contexts

يُعد FuncDECODE إطاراً حوسبياً يستفيد من مراجع الخلية الواحدة لفك التوليف في بيانات النسخ المتعددة (bulk) والنسخ المكانية المختلطة، مما يتيح تحديد إعادة تشكيل البرامج الوظيفية الخاصة بأنواع الخلايا عبر مختلف الحالات البيولوجية، وسياقات المرض، والبنى النسيجية المكانية.

Yadong Wang, Renjie Liu, Tianyi Zhao2026-07-30
🧬 biology

Malaria parasites coordinate host cell remodeling through the AP2-HCR DNA-binding protein

تحدد هذه الدراسة أن PfAP2-HCR هو عامل نسخ ApiAP2 أساسي في المتصورة الملارية (*Plasmodium falciparum*) ينظم إعادة تشكيل الخلية المضيفة من خلال التنظيم المباشر للتعبير عن البروتينات الرئيسية المصدرة، مما يضمن بقاء الطفيلي وتطوره وانتقاله عبر كل من مراحل الدم اللاجنسية والجنسية.

Arnab Pain, Amit Subudhi, Dhiviya Vedagiri, Sara Mfarrej, Reem Abu-Shamma, Rohit Satyam, Rahul Salunke, Di Liu, Maya Aya (…)2026-07-30