388 Arbeiten
Diese Studie analysiert 345 NADH-Protein-Komplexstrukturen und etabliert ein vereinheitlichtes biophysikalisches Rahmenwerk, das die Konformationsvielfalt und Interaktionssignaturen von NADH über Protein-Familien hinweg beschreibt, um rationale Einblicke für das Cofaktor-Engineering und die Entwicklung von Inhibitoren zu liefern.
Die Studie zeigt, dass aus Serum gesunder Blutspender gewonnene, kommutable Referenzmaterialien zur Harmonisierung von IGF1-Immunoassays mit einer LC-MS/MS-Methode verwendet werden können, um alters- und geschlechtsspezifische Referenzintervalle zu etablieren und die Messvariabilität signifikant zu reduzieren.
Die Studie nutzt activity-based protein profiling, um in dem Weizenpathogen Zymoseptoria tritici orthologspezifisch ligandbare Cysteinreste zu identifizieren, wobei ein stereodefinites Elektrophil die GTPase SAR1 selektiv hemmt und so das Pilzwachstum durch Störung der COPII-vermittelten Vesikeltransportwege effektiv unterdrückt.
Die Kristallstruktur des H158Y-Mutanten der Pyranose-Oxidase aus *Phanerochaete chrysosporium* zeigt, dass die Tyrosin-Substitution eine Konformation einnimmt, die eine kovalente Flavinylierung verhindert und zu einer drastischen Verringerung der katalytischen Aktivität führt, obwohl das Enzym seine FAD-Beladung und tetramere Struktur beibehält.
Die Studie kombiniert klassische und QM/MM-Molekulardynamiksimulationen, um den vollständigen Reaktionsmechanismus der kovalenten Bindung von Spliceostatinen an das PHF5A-Zinkfinger-Protein aufzuklären, wobei eine lokale Verzerrung der Zink-Koordinationskugel und ein Asp34-Lys29-Protonenrelay die Bildung eines hochreaktiven Thiolats und die Epoxidöffnung ermöglichen.
Die Autoren stellen Enzyme-toolkit (Enzyme-tk) vor, ein integriertes Framework aus 23 Open-Source-Tools und zwei neuen Methoden (Func-e und Oligopoolio), das die Entdeckung bisher unbekannter Enzyme für spezifische Reaktionen ermöglicht und erfolgreich zur Identifizierung thermostabiler Enzyme zum Abbau von Umweltgiften wie DEHP und TPP eingesetzt wurde.
Diese Studie entschlüsselt den bipartiten Aktivierungsmechanismus von Kondensin II, bei dem das Protein M18BP1 einerseits die autoinhibitorische NCAPD3-Schwanzdomäne verdrängt, um die DNA-Bindung freizulegen, und andererseits durch die Bildung einer positiv geladenen Schleife die DNA-Ankerung direkt verstärkt, um die präzise Bildung von Mitosechromosomen zu gewährleisten.