380 Arbeiten
Diese Studie nutzt zeitaufgelöste serielle Synchrotronkristallographie, um die Diffusion von Indol und die daraus resultierende, populationsquantifizierte Konformationsanpassung der T4-Lysozym-Mutante L99A in Echtzeit zu visualisieren.
Die Studie zeigt mittels Molekulardynamik-Simulationen, dass eine vollständige Oxidation der viralen Membranlipide die Verankerungsstabilität des SARS-CoV-2-Spike-Proteins signifikant verringert, indem sie die Membranstruktur destabilisiert und die hydrophobe Passung stört, was einen physikalischen Mechanismus für antivirale Behandlungen wie Ozon- oder Kaltplasmabehandlungen liefert.
Diese Studie entschlüsselt den kinetischen Mechanismus der uridylierungsvermittelten RNA-Abbauphase in Drosophila melanogaster und zeigt, wie die Enzyme Tailor und Dis3l2 durch die Erzeugung und selektive Erkennung spezifischer, kinetisch abgestimmter Oligo(U)-Zwischenprodukte eine quantitative Kopplung zwischen Uridylierung und exonukleolytischem Abbau ermöglichen.
Die Studie zeigt, dass ein ultraschnelles Screening mit einem voluminösen Fluoreszenzsubstrat die Identifizierung entfernter Mutationen in der Dehalogenase LinB ermöglicht, die durch Modulation der Konformationsdynamik die Substratzugänglichkeit und katalytische Effizienz verbessern.
Die Studie stellt eine Plattform vor, die mithilfe enantiomerer Oxaziridin-Reagenzien stereospezifische Methionin-Oxidationsstellen in Proteomen identifiziert und zeigt, wie die chirale Regulation dieser Modifikationen durch spezifische Reduktasen die Proteinfunktion allosterisch steuern kann.
Die Studie präsentiert einen integrativen Modellierungsansatz, der experimentelle Kreuzvernetzung mit verschiedenen computergestützten Methoden kombiniert, um die Struktur des neu identifizierten MHAP1/HDAC2/MIER1-Komplexes aufzuklären und dabei die Rolle der intrinsisch ungeordneten Regionen zu beleuchten, die von reinen AlphaFold-Ansätzen nicht erfasst werden.
Die Studie zeigt, dass chemische Modifikationen an den R1- und R3-Positionen des HIV-1-Kapsid-Inhibitors PF74 zu Verbindungen mit verbesserter antiviraler Potenz, erhöhter Stabilität des Kapsids und stärkerer Bindung führen, was wertvolle Erkenntnisse für die Entwicklung zukünftiger klinisch relevanter Kapsid-Targeting-Antiviralia liefert.
Diese Studie nutzt all-atomische Molekulardynamik-Simulationen, um die mannosebindenden Schnittstellen von DC-SIGN und MRC1 zu vergleichen und zeigt auf, wie eine spezifische, für DC-SIGN unzugängliche Bindungskonfiguration die höhere Affinität von MRC1 erklärt, was für die Entwicklung selektiver Therapeutika gegen Retinoblastom entscheidend ist.
Die Studie stellt einen multi-objektiven Engineering-Ansatz vor, der durch Kombination von computergestütztem Design und evolutionärer Rekonstruktion den hochselektiven Thrombolytikum-Kandidaten „Brnoteplase" entwickelt, der im Vergleich zu bestehenden Therapeutika eine verbesserte katalytische Effizienz, Fibrin-Selektivität und Inhibitionsresistenz aufweist und in vivo eine effektivere Thrombolyse mit reduzierten Blutungsrisiken ermöglicht.
Die Studie identifiziert ein konserviertes saures Motiv in FANCD2, das als zentrales Bindeglied für die direkte Rekrutierung von DNA-Reparaturproteinen sowie Faktoren der Histonmodifikation und RNA-Prozessierung dient und so die strukturelle Grundlage für die Rolle von FANCD2 bei der Reparatur von DNA-Verknüpfungen erklärt.
Die Studie zeigt, dass das Exonukleas EXO1 an entkoppelten Replikationsgabeln unabhängig von umgekehrten Gabeln die nascente Leitsstrang-5'-Ende degradiert, was für die Aktivierung des ATR-Checkpoint-Signals und die Bremsung der Gabelprogression entscheidend ist, während die 3'-Ende stabil bleiben.
Diese Studie liefert durch die Aufklärung der Cryo-EM-Struktur des PTCH1-Rezeptors in Komplex mit dem Inhibitor PAH strukturelle und zelluläre Einblicke in den Mechanismus, durch den PAH den Cholesterin- und Medikamenten-Transport blockiert, und bietet damit eine Grundlage für die rationale Entwicklung neuer Chemotherapeutika.
Diese Studie zeigt, wie die strukturelle Dynamik zwischen Argonaute-2 und CK1α durch die progressive Basenpaarung von miRNA und Ziel-RNA die Phosphorylierung des EI-Bereichs auslöst, was zur Freisetzung der Ziel-RNA und einem effizienten Umsatz des RISC-Komplexes führt.
Die Studie zeigt, dass der bakterielle Second Messenger c-di-AMP den K+/H+-Antiporter CpaA in Bacillus subtilis bei einer Konzentration von etwa 1 µM inaktiviert, was die Komplexität der osmotischen Regulation durch c-di-AMP unterstreicht.
Die Studie demonstriert erstmals die Stabilisierung eines hochvalenten Mn(V)-Nitrido-Komplexes innerhalb eines neu gestalteten Proteins, der durch Unterdrückung bimolekularer Zerfallswege eine langfristige Stabilität ermöglicht und als Katalysator für enantioselektive Aziridinierungsreaktionen dient.
Die Studie zeigt, dass Ammonium- und Alkylammonium-Gegenionen unter trockenen Bedingungen die Polymerisation von 2',3'-cyclischen Nukleotiden zu RNA-Oligomeren durch Wasserstoffbrückenbindungen, allgemeine Basenkatalyse und die Bildung wasserfreier Materialien signifikant fördern, was auf eine Rolle von ammoniakhaltigen Gasen in der frühen RNA-Evolution hindeutet.
Die Studie zeigt, dass die Antibiotikaresistenz durch Est-Typ-Macrolidesterasen durch eine wasservermittelte „Käfig"-Struktur bestimmt wird, die ein promiskuitives Substratbinden und eine unpräzise Positionierung ermöglicht, was wichtige Erkenntnisse für die Entwicklung neuer Antibiotika liefert.
Die Studie zeigt, dass die plasminvermittelte Spaltung von GPIbα die Dissoziation von Thrombozyten-VWF-Komplexen in vitro antreibt, ihr Beitrag zur Auflösung dieser Komplexe bei akuten TTP-Episoden in vivo jedoch begrenzt zu sein scheint.
Die Studie zeigt, dass der Ersatz des inaktivierenden Reduktionsmittels DTT durch TCEP bei der Kristallisation von menschlicher Aldehydoxidase zu gut geordneten Kristallen führt, die eine Strukturaufklärung ohne Enzymdeaktivierung ermöglichen.
Die Studie zeigt, dass die reversible S-Palmitoylierung der mitochondrialen Glutamat-Dehydrogenase (GDH) durch Palmitoyl-CoA die Enzymaktivität hemmt und die hexamere Struktur in Dimere auflöst, während mitochondriale Thioesterasen wie APT1 und ABHD10 diese Modifikation rückgängig machen und so die Struktur sowie Funktion des Enzyms wiederherstellen.