NPannotator: a genome- and chemistry- constrained automation for type I polyketide synthase pathway elucidation
Die Studie stellt NPannotator vor, einen automatisierten, genomkontextbewussten Cheminformatik-Pipeline, der die katalytische Reihenfolge von Typ-I-Polyketidsynthase-Domänen und die Substratspezifitäten ihrer Acyltransferasen durch den Abgleich von synthetisch generierten Polyketid-Gerüsten mit Ziel-Naturstoffen ableitet, um so die Lücke zwischen Gencluster-Architektur und chemischer Struktur zu schließen.