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bioinformatics

766 Arbeiten

Die Bioinformatik verbindet Biologie und Informatik, um riesige Mengen an biologischen Daten verständlich zu machen. Statt sich nur auf einzelne Experimente zu konzentrieren, nutzen Forscher hier computergestützte Methoden, um Muster im Leben selbst zu entschlüsseln, von der DNA bis zu komplexen Krankheitsverläufen. Diese Schnittstelle ermöglicht es, die Sprache des Lebens in Zahlen und Algorithmen zu übersetzen und neue Erkenntnisse schnell zu gewinnen.

Auf Gist.Science durchsuchen wir täglich die neuesten Vorab-Veröffentlichungen auf bioRxiv in diesem Bereich. Für jedes neu eingereichte Preprint erstellen wir nicht nur eine detaillierte technische Zusammenfassung für Fachleute, sondern auch eine einfache Erklärung in Alltagssprache, damit jeder den Kern der Forschung verstehen kann. So wird komplexes Wissen für ein breites Publikum zugänglich, ohne dass wichtige Details verloren gehen.

Unten finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Bioinformatik, die wir kürzlich für Sie aufbereitet haben.

Evidence of off-target probe binding affecting 10x Genomics Xenium gene panels compromise accuracy of spatial transcriptomic profiling

Diese Studie identifiziert mit dem neu entwickelten Software-Tool Off-target Probe Tracker (OPT) off-target-Bindungen in 10x Genomics Xenium-Genpanels, die die Genauigkeit der räumlichen Transkriptomik beeinträchtigen, und validiert diese Befunde durch den Abgleich mit orthogonalen Transkriptomik-Daten, um die biologische Interpretierbarkeit und Reproduzierbarkeit der Forschung zu verbessern.

Hallinan, C., Ji, H. J., Tsou, E., Salzberg, S. L., Fan, J.2026-03-13💻 bioinformatics

Per-residue optimisation of protein structures: Rapid alternative to optimisation with constrained alpha carbons

Die Autoren stellen PROPTIMUS RAPHAN vor, eine Methode zur per-residuenbasierten Optimierung von Proteinstrukturen, die durch die Zerlegung in überlappende Teilstrukturen eine lineare Skalierung der Rechenzeit ermöglicht und dabei Ergebnisse liefert, die mit der herkömmlichen Optimierung bei eingeschränkten Alpha-Kohlenstoffatomen vergleichbar sind, jedoch deutlich schneller erreicht werden.

Schindler, O., Bucekova, G., Svoboda, T., Svobodova, R.2026-03-13💻 bioinformatics

Descriptron-GBIF Annotator: A browser-based platform for crowdsourced morphological annotation of biodiversity images to help accelerate morphology based biodiversity data

Das Paper stellt den Descriptron-GBIF Annotator vor, eine browserbasierte Plattform, die durch KI-gestützte Segmentierung und Ontologie-Integration die crowdsourcende morphologische Annotation von Biodiversitätsbildern ermöglicht, um die Lücke zwischen der Fülle an verfügbaren Spezimenbildern und dem Mangel an strukturierten morphologischen Daten zu schließen.

Van Dam, A. R., Hita Garcia, F.2026-03-13💻 bioinformatics

Fast and accurate resolution of ecDNA sequence using Cycle-Extractor

Die Studie stellt Cycle-Extractor (CE) vor, ein schnelles und genaues Werkzeug zur Rekonstruktion von ekDNA-Strukturen aus Kurz- und Langread-Sequenzierungsdaten, das durch die Nutzung von Langreads signifikant vollständigere und validierte Ergebnisse liefert als bestehende Methoden.

Faizrahnemoon, M., Luebeck, J., Hung, K. L., Rao, S., Prasad, G., Tsz-Lo Wong, I., G. Jones, M., S. Mischel, P., Y. Chang, H., Zhu, K., Bafna, V.2026-03-13💻 bioinformatics

SuperSurv: A Unified Framework for Machine Learning Ensembles in Survival Analysis

Das Paper stellt SuperSurv vor, ein benutzerfreundliches R-Paket, das eine einheitliche Schnittstelle für das Erstellen, Bewerten und Interpretieren von Ensemble-Modellen in der Überlebensanalyse bietet, indem es heterogene Lernalgorithmen auf eine gemeinsame Zeitachse abbildet und fortschrittliche Techniken wie Stacking, Hyperparameter-Optimierung sowie SHAP-basierte Interpretierbarkeit integriert.

Lyu, Y., Huang, X., Lin, S. H., Li, Z.2026-03-13💻 bioinformatics

BioPipelines: Accessible Computational Protein and Ligand Design for Chemical Biologists

Das Open-Source-Framework BioPipelines ermöglicht es experimentell arbeitenden Chemikern, komplexe Workflows für das computergestützte Protein- und Ligandendesign durch eine einfache, modulare Python-Schnittstelle zu definieren und auszuführen, wodurch technische Hürden überwunden und der Fokus auf die wissenschaftliche Fragestellung gelenkt wird.

Quargnali, G., Rivera-Fuentes, P.2026-03-13💻 bioinformatics