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bioinformatics

1197 Arbeiten

Die Bioinformatik verbindet Biologie und Informatik, um riesige Mengen an biologischen Daten verständlich zu machen. Statt sich nur auf einzelne Experimente zu konzentrieren, nutzen Forscher hier computergestützte Methoden, um Muster im Leben selbst zu entschlüsseln, von der DNA bis zu komplexen Krankheitsverläufen. Diese Schnittstelle ermöglicht es, die Sprache des Lebens in Zahlen und Algorithmen zu übersetzen und neue Erkenntnisse schnell zu gewinnen.

Auf Gist.Science durchsuchen wir täglich die neuesten Vorab-Veröffentlichungen auf bioRxiv in diesem Bereich. Für jedes neu eingereichte Preprint erstellen wir nicht nur eine detaillierte technische Zusammenfassung für Fachleute, sondern auch eine einfache Erklärung in Alltagssprache, damit jeder den Kern der Forschung verstehen kann. So wird komplexes Wissen für ein breites Publikum zugänglich, ohne dass wichtige Details verloren gehen.

Unten finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Bioinformatik, die wir kürzlich für Sie aufbereitet haben.

💻 Bioinformatik

Time-Resolved Phosphoproteomics-Guided BFS Beam Search Reveals Cell-Type-Specific EGFR Signaling Architectures and SHP2 Inhibitor-Induced Pathway Rewiring

Diese Studie stellt ein systematisches rechnerisches Framework vor, das zeitlich aufgelöste Phosphoproteomik mit einem durch BFS geleiteten Beam-Search-Algorithmus integriert, um zelltypspezifische EGFR-Signalnetzwerke zu rekonstruieren, und zeigt erfolgreich auf, wie die Hemmung von SHP2 Signalwegarchitekturen umverdrahtet und adaptive Resistenzmechanismen antreibt.

Lee, H., Lee, G.2026-05-23
💻 Bioinformatik

Interpreting Omics Data Analysis with Large Language Models for Disease Target and Drug Discovery

Dieser Beitrag stellt ein herkunftsorientiertes Text-zu-Ziel-Framework vor, das die schema-geschränkte Abrufsuche mit großen Sprachmodellen mit der Analyse numerischer Omics-Daten integriert, um interpretierbare, revisionsbereite Krankheitsziele und Strategien zur Wirkstoffentwicklung zu generieren, wobei eine signifikante Validierung bei der Alzheimer-Krankheit und dem Pankreasgangadenokarzinom demonstriert wird.

XU, Z., Chen, W., Ren, W., Xu, T., Amaechin, S., Khan, R., Chen, Y., Province, M., Payne, P., Li, F.2026-05-23
💻 Bioinformatik

Asymmetric Contrastive Objectives for Efficient Phenotypic Screening

Dieser Artikel stellt asymmetrische kontrastive Zielvorgaben vor, darunter eine geometrisch inspirierte SPC-Variante, die experimentelle Metadaten als gelernte Klassenvektoren integriert, um effizient Bildrepräsentationen für die phänotypische Screening zu extrahieren, die in mehreren Datensätzen und Metriken früheren Methoden überlegen sind und gleichzeitig bei begrenzten Daten- und Rechenressourcen wirksam bleiben.

Nightingale, L., Tuersley, J., Warchal, S., Cairoli, A., Howes, J., Shand, C., Powell, A., Green, D., Strange, A., Howel (…)2026-05-22
💻 Bioinformatik

Rewriting protein alphabets with language models

Dieser Artikel stellt TEA vor, ein neuartiges 20-Buchstaben-Protein-Alphabet, das durch kontrastives Lernen aus Embeddings von Sprachmodellen abgeleitet wird und eine schnelle und sensitive Fernhomologieerkennung ermöglicht, die mit strukturbasierten Methoden konkurriert, während sie bestehende Sequenzsuchalgorithmen nutzt.

Pantolini, L., Studer, G., Engist, L., Pudziuvelyte, I., Pommerening, F., Waterhouse, A. M., Bienert, S., Tauriello, G. (…)2026-05-22
💻 Bioinformatik

Widespread use of invalid statistical tests in biomedical machine learning

Dieser Artikel zeigt auf, dass die weit verbreitete Verwendung ungültiger statistischer Tests, die die Abhängigkeit zwischen den Kreuzvalidierungs-Folds in der biomedizinischen maschinellen Lernforschung ignorieren, zu einer Aufblähung der falsch-positiven Raten führt, was die Autoren dazu veranlasst, den SHARP-Test als robuste Lösung vorzuschlagen und neue Berichterstattungsrichtlinien für einen gültigen Modellvergleich bereitzustellen.

Zeng, T., Li, H., Zhang, S., Tan, Y. Q., Tian, F., Orban, C., An, L., Che, W., Cheng, J., Chong, J. S. X., Dehestani, N. (…)2026-05-22
💻 Bioinformatik

GlyComboCLI enables command line-based FAIR workflows for glycan composition assignment in mass spectrometry data

GlyComboCLI ist ein flexibles, quelloffenes Befehlszeilentool, das die Zuweisung von Glykanzusammensetzungen für Massenspektrometriedaten automatisiert und damit FAIR-konforme, skalierbare bioinformatische Workflows ermöglicht, die die manuelle Interpretation erheblich reduzieren und gleichzeitig reproduzierbare Ergebnisse sicherstellen.

Kelly, M. I., Thang, W. C. M., Pang, C. N. I., Gustafsson, O. J. R., Ashwood, C.2026-05-21
💻 Bioinformatik

A unified framework for batch correction and missing data handling in large-scale and single-cell mass spectrometry proteomics

Das Papier stellt NMFBatch vor, ein einheitliches statistisches Framework, das diskrete Batch-Effekte und kontinuierliche Signal-Drift gleichzeitig korrigiert und dabei direkt fehlende Werte in der großmaßstäblichen und single-cell Massenspektrometrie-Proteomik berücksichtigt, wodurch im Vergleich zu bestehenden Methoden die biologische Struktur erhalten und der Informationsverlust reduziert wird.

Anwar, A. M., Bayoumi, S., Lahti, L., Coffey, E.2026-05-21