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genomics

415 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

🧬 Genomik

Adult porcine intestinal organoids as models for regional epithelial identity and individual regulatory variation

Diese Studie zeigt, dass adulte porcine Darmorganoide, obwohl sie einen relativ unreifen Transkriptionszustand und ein reduziertes immunologisches räumliches Muster aufweisen, erfolgreich eine erhebliche regionale Epithelidentität beibehalten und artspezifische regulatorische Signaturen bewahren, wodurch ihre Eignung als kontrollierte Modelle für die funktionelle Nachverfolgung von Kandidatengenen und Varianten bei Nutztieren validiert wird.

Blanc, F., CHALABI, S., Pepke, F., Mongelaz, M., Charles, M., Rau, A., Djebali, S., Egidy-Maskos, G., Giuffra, E.2026-08-05
🧬 Genomik

Whole-genome sequencing data of a diverse grapevine germplasm collection maintained in Bordeaux, France

Diese Arbeit präsentiert einen standardisierten Ganftgenom-Varianten-Datensatz, der etwa 9,1 Millionen SNPs und 0,77 Millionen INDELs für 547 diverse Reben-Akzessionen aus der INRAE Bordeaux-Sammlung umfasst, generiert durch einheitliche Sequenzierung und Analyse, um als harmonisierte Ressource für die Reben-Genetik, Züchtung und Populationsgenomik-Forschung zu dienen.

de Miguel, M., Lafargue, M., Saez-Laguna, E., Tran, J., Girollet, N., Bert, P.-F., Wang, Y., Liang, Z., Guillaumie, S. (…)2026-08-05
🧬 Genomik

Trajectory Uncertainty Framework (TUF): A Modular Framework for Identifying Transitional and Branch-Point Cell States in Single-Cell Trajectory Analysis

Dieses Paper stellt das Trajectory Uncertainty Framework (TUF) vor, ein modulares, Open-Source-Tool, das die Unsicherheit von Einzelzell-Trajektorien mittels Temporal Entropy und Trajectory Divergence Scores quantifiziert, um Übergangszustände zu identifizieren und kontextspezifische transkriptionelle Treiber über diverse biologische Systeme hinweg aufzudecken.

Mahdavifar, M., Mohammadifar, Z., Iranpourtari, T.2026-08-05
🧬 Genomik

Single-cell transcriptomics reveals a multiphasic Wolbachia host infection trajectory

Mithilfe von Einzelzell-RNA-Sequenzierung zeigt diese Studie, dass die *Wolbachia*-Infektion in *Drosophila* einer multiphasischen Trajektorie folgt, die distinkte transkriptionelle Wellen umfasst, welche die Zellzyklen, die Organellenfunktion und die Immunantworten des Wirts umprogrammiert, um eine stabile chronische Infektion zu etablieren.

Jacobs, J. M., Lum, A., Nykamp, J., Lagousis, C. R. M., Russell, S. L.2026-08-04
🧬 Genomik

Omega-seq: ultra-low-background RNA sequencing with faithful molecular counting and precise transcript-end capture

Omega-seq ist eine RNA-Sequenzierungsmethode mit ultra-niedrigem Hintergrundrauschen, die USER-exzisierbare Template-Switching-Oligonukleotide und einen spezialisierten dT-Primer nutzt, um Phantom-UMIs und Poly-T-Artefakte zu eliminieren, was ein getreues molekulares Zählen und eine präzise Kartierung von Transkriptenden selbst in winzigen Proben wie einzelnen Drosophila-Neuroblasten ermöglicht.

Chen, H.-M., Kao, J.-C., Yang, C.-P., Tan, C., Lee, T., Sugino, K.2026-08-01
🧬 Genomik

Concerted evolution and unorthodox recombination of human subtelomeres

Durch die Anwendung eines referenzfreien Pangenom-Ansatzes auf 465 nahezu vollständige menschliche Assemblierungen zeigt diese Studie auf, dass hochidentische pseudo-homologe Regionen die Chromosomenenden in Sequenzgemeinschaften organisieren, welche den rekurrenten ektopischen Austausch erleichtern und so die konzertierte Evolution der menschlichen Subtelomere über das gesamte Genom hinweg vorantreiben.

Guarracino, A., Gyamfi, A., Human Pangenome Reference Consortium,, Garrison, E.2026-07-31
🧬 Genomik

Multiple origins of endogenous virophage and polinton-like virus in the halophilic protist Halocafeteria seosinensis

Diese Studie offenbart die beispiellose Abundanz und Diversität endogener Virophagen und Polinton-ähnlicher Viren innerhalb des Genoms des halophilen Protisten *Halocafeteria seosinensis*, was deren komplexen genetischen Austausch, die Supraparasitierung durch mobile Elemente und den signifikanten Beitrag zur genomischen Landschaft des Wirts hervorhebt.

Haro, R., Gallot-Lavallee, L., Blais, C., Archibald, J. M.2026-07-30
🧬 Genomik

Germline genomic and methylomic dynamics following three generations of early-life metabolic challenges

Diese Studie zeigt, dass drei Generationen frühkindlicher metabolischer Herausforderungen bei Mäusen Genominstabilität induzieren und die genetische Variabilität durch die Aktivität transponierbarer Elemente und Kopienzahlvariationen einschränken, anstatt durch weit verbreitete DNA-Methylierungsänderungen.

de Anca Prado, V., Pertille, F., Andersson, D., Mourin-Fernandez, M., Godia, M., Jimenez-Chillaron, J. C., Ruegg, J., Gu (…)2026-07-24
🧬 Genomik

Genetic architecture of soluble arabinoxylan fibre in elite genotypes of bread wheat revealed by genome-wide association analysis

Diese Studie nutzte eine genomweite Assoziationsanalyse an 384 elite britischen Weizengenotypen, um sieben genetische Loci zu identifizieren, einschließlich bedeutender stabiler Effekte auf den Chromosomen 1B und 6B, welche den Gehalt an wasserlöslichem Arabinoxylan regulieren, und demonstrierte damit, dass das Pyramidisieren günstiger Allele innerhalb bestehenden Keimplasmas eine praktische Strategie für die Züchtung von Weizen mit erhöhtem Ballaststoffgehalt darstellt.

Alabdullah, A. K., Kosik, O., Leverington-Waite, M., Mitchell, R. A., Prins, A., Brett, J., Griffths, S., Shewry, P. R. (…)2026-07-24