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genomics

272 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

BAF complexes maintain accessibility at stimulus-responsive chromatin and are required for transcriptional stimulus responses

Die Studie zeigt, dass BAF-Komplexe für die Aufrechterhaltung der Chromatinzugänglichkeit an stimuli-responsiven regulatorischen Elementen, insbesondere an „primierten" Enhancern, essenziell sind, um die Transkriptionsantwort auf externe Signale wie Interferon-gamma zu ermöglichen, was darauf hindeutet, dass ein Verlust dieser Funktion zu pathologischen Signalstörungen führen kann.

Gulka, A. O. D., Kang, K. A., Zhou, Z., Gorkin, D. U.2026-03-21🧬 genomics

The population structure and genetic health of European wolves

Die Analyse von 1.001 Wolfsgenomen zeigt, dass sich die europäischen Wolfspopulationen aus unterschiedlichen evolutionären Linien zusammensetzen und trotz ihrer Erholung unter starkem Inzestdruck sowie genomischer Erosion leiden, was differenzierte, regional angepasste Schutzmaßnahmen erfordert.

Todd, E. T., Fontsere, C., Sun, X., Scharff-Olsen, C. H., Hernandez-Alonso, G., Lanigan, L. T., Gomes Martins, N. F., Ciucani, M. M., Ramos-Madrigal, J., Hennelly, L., Mak, S. S. T., Andersone-Lilley (…)2026-03-21🧬 genomics

Self-organization of Drosophila chromatin architecture in a cell-free system

Die Studie etabliert ein zellfreies System aus Drosophila-Embryonenextrakten, das zeigt, dass sich Chromatinarchitektur wie TADs spontan bildet, wobei die Bildung von TADs am eve-Locus nicht durch einfache Loop-Extrusion, sondern durch die direkte Paarung von Boundary-Elementen mittels des Insulator-Proteins Su(Hw) erfolgt.

Jayakrishnan, M., Kars, G., Campos-Sparr, A., Karpinska, M. A., Zunjarrao, S., Maziak, N., Margulies, C. E., Vaquerizas, J. M., Gambetta, M. C., Oudelaar, M., Becker, P. B. B.2026-03-20🧬 genomics

Evolutionary and Deep Learning Models Highlight Deleterious Mutations Behind the History of Sugar Beet Breeding

Diese Studie kombiniert evolutionäre Konservierung und Deep-Learning-Modelle, um schädliche Mutationen in Zuckerrüben zu identifizieren und zeigt, dass zwar die Domestizierung die genetische Last erhöht hat, moderne Züchtung jedoch zu einer signifikanten Verringerung dieser schädlichen Varianten geführt hat.

Long, E. M., Dorn, K. M., Naegele, R., Majumdar, R.2026-03-20🧬 genomics

Dynamic genomes uncover opposite sex determination in the invasive quagga and zebra mussels

Die Studie enthüllt, dass sich die Geschlechtsbestimmung bei den invasiven Zebramuscheln und Quaggamuscheln durch völlig unterschiedliche genetische Mechanismen entwickelt hat, wobei die Zebramuschel ein polygenetisches ZZ/ZW-System aufweist, während die Quaggamuschel eine neuartige, lokalisierte XY-Region mit dem duplizierten Gen FoxL2-Y als männlichen Bestimmungsfaktor besitzt.

Weber, A. A.-T., Uthanumallian, K., Kocot, K. M., Giulio, M., Signorini, S. G., Senut, M.-C., Chen, Z., Sigwart, J., Passamaneck, Y.2026-03-20🧬 genomics

Chromosome-level genome sequence of the C4 grass Themeda triandra reveals karyotype orthology with sorghum and genetic variation in accessions adapted to diverse environments

Die Studie präsentiert eine Chromosomenebene-Genomsequenz des C4-Grases *Themeda triandra*, die eine hohe Syntenie mit Sorghum aufdeckt und durch die Analyse genetischer Variation in verschiedenen Zugängen wichtige Einblicke in die Anpassung an diverse Umweltbedingungen sowie das Potenzial für die Züchtung klimaresistenter Nutzpflanzen liefert.

Butler, J. B., Humphreys, J. L., Allnutt, T., Jacob, V. K., Chen, L., Correa-Lozano, A., Lopez-Jurado, J., Foo, E., Wright, I. J., Smith, S. M., Atwell, B. J.2026-03-20🧬 genomics

Perturbation-guided mapping of colorectal cancer cell states to causal mechanisms

Die Studie entwickelt ein kontinuierliches Lernframework, das über 300 Patienten umfassende Einzelzell-Daten integriert, um kausale Mechanismen von Darmkrebs-Zuständen zu entschlüsseln und therapeutische Ansätze wie MAPK-Inhibition zu modellieren, die Zellen in einen plastischen, endodermähnlichen Zustand überführen.

Hediyeh-zadeh, S., Toh, T. S., Dufva, O., Serra, G., Jakhmola, R., Fourneaux, C., Pinto, G., Fang, Z., Picco, G., Oliver, A. J., Elmentaite, R., Richter, T., To, K., Pett, J. P., Teichmann, S. A., Azi (…)2026-03-19🧬 genomics

Atopic Dermatitis and Psoriasis Differ in Lesional DEG Reference Instability and Non-Lesional Spectrum Displacement: Multi-Cohort Geometric Evidence of Individual Homeostatic Boundary Escape

Diese Studie nutzt einen geometrischen Transkriptomik-Ansatz auf mehreren Kohorten, um zu zeigen, dass die bekannte Inkonstanz bei der Genexpressionsanalyse der atopischen Dermatitis (AD) auf eine strukturelle Abhängigkeit von Signalen kleinerer Effektstärke zurückzuführen ist und dass ein signifikanter Teil der nicht-lesionalen AD-Fälle bereits vor dem klinischen Ausbruch eine individuelle Entgleisung der hämodynamischen Homöostase aufweist, die sich von der bei Psoriasis beobachteten Dynamik unterscheidet.

Shabana, B.2026-03-19🧬 genomics

Modeling cis-regulatory variation in human brain enhancers across a large Parkinson's Disease cohort

Diese Studie stellt eine umfassende Ressource und neue Sequenzmodellierungsstrategien vor, die auf multimodalen Daten von 190 Spendern basieren, um zelltypspezifische cis-regulatorische Varianten in menschlichen Gehirn-Enhancern zu identifizieren, deren funktionelle Auswirkungen zu modellieren und ihre Rolle bei Parkinson-Erkrankungen aufzuklären.

Sigalova, O. M., Pancikova, A., De Man, J., Theunis, K., Hulselmans, G. J., Konstantakos, V., Stuyven, B., De Brabandere, A., Geurts, J., Mikorska, A., Mukherjee, S., Abouelasrar Salama, S., Vandereyk (…)2026-03-19🧬 genomics

OxBreaker: species-agnostic pipeline for the analysis of outbreaks using nanopore sequencing

Das Paper stellt „OxBreaker" vor, eine automatisierte, benutzerfreundliche und open-source Pipeline für Oxford Nanopore-Sequenzdaten, die eine hochpräzise, artsunabhängige Analyse von bakteriellen Ausbrüchen und Plasmiden ermöglicht und so die lokale, Echtzeit-Genomüberwachung für den Infektionsschutz erleichtert.

Reding, C., Hopkins, K. M. V., Colpus, M., Sanderson, N. D., Gentry, J., Oakley, S., Campbell, M., Karageorgopoulos, D., Jeffery, K. J. M., Eyre, D. W., Bejon, P., Stoesser, N., Walker, A. S., Young (…)2026-03-19🧬 genomics