Methodological pitfalls in plant pangenome gene family identification may lead to biased evolutionary inferences
Diese Studie zeigt, dass die ausschließliche reliance auf Sequenzähnlichkeit zur Identifizierung von Genfamilien in Pangenomenen erhebliche Verzerrungen in evolutionären Schlussfolgerungen einführt, und empfiehlt eine zweistufige Strategie, die graphbasierte Orthologie mit Sequenzverfeinerung kombiniert, um genaue Ergebnisse zu gewährleisten.