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genomics

368 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

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PC1-guided transcriptomic stratification reveals hepatic transcriptional heterogeneity and defines a myeloid-associated 20-gene signature

Diese Studie zeigt, dass die PC1-gestützte transkriptomische Stratifizierung die behandlungsbedingte Heterogenität in hyperlipidämischen Leberdaten überwindet, um eine Myeloid-assoziierte 20-Gen-Signatur zu identifizieren, welche über Kohorten hinweg validiert wurde und TAGLN2 als einen zentralen genetischen Zusammenhang zur koronaren Herzkrankheit hervorhebt.

Li, Z., Xie, F., He, Y., Ma, L., Liu, Q.2026-08-18
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Valeriana officinalis genome sequence reveals candidate genes for valerenic acid biosynthesis and flavonoid metabolism

Diese Studie präsentiert die erste hochwertige Genomsequenz von *Valeriana officinalis*, die eine grundlegende Ressource bereitstellt, welche Kandidatengene für die Biosynthese von Valerensäure und den Flavonoidstoffwechsel identifiziert, um die zukünftige Forschung zu deren anxiolytischen Eigenschaften zu erleichtern.

de Oliveira, J. A. V. S., Baez, M. A., Pucker, B.2026-08-18
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Phylogenomics and comparative genomics of the genus Erwinia reveal taxonomic inconsistencies and evolutionary diversification

Diese Studie nutzt umfassende phylogenomische und vergleichende genomische Analysen von 104 *Erwinia*-Stämmen, um evolutionäre Beziehungen zu klären, taxonomische Inkonsistenzen zu identifizieren und aufzuzeigen, wie die linienspezifische genomische Plastizität durch diverse Kombinationen von Virulenzfaktoren die ökologische Anpassung und Pathogenität vorantreibt.

Maurya, N., Dobhal, S., Sundin, G. W., Rodoni, B., Stack, J. P., Arif, M.2026-08-11
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Genomic plasticity and homologous recombination drive the evolution of Pectobacterium jejuense across hosts and geographic regions

Diese Studie zeigt auf, dass homologe Rekombination und Genomplastizität die Evolution und Wirtsadaptation des neu auftretenden Weichfäule-Erregers *Pectobacterium jejuense* vorantreiben, wie globale genomische Analysen von 214 Stämmen belegen, die distinkte Linien, extensiven interspezifischen Genfluss und einzigartige adaptive Merkmale in hawaiianischen Isolaten identifizierten.

Arizala, D., Dobhal, S., Boluk, G., Arif, M.2026-08-11
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Genome-Wide Selection Signatures in Nili-Ravi Buffalo (Bubalus bubalis) Reveal a T-Cell Costimulatory and Cytokine-Signaling Gene Network Distinct from Classical Bovine Tuberculosis Candidate Genes

Durch das Re-Mapping von SNP-Daten auf ein natives Büffel-Referenzgenom zeigt diese Studie, dass Nili-Ravi-Büffel Selektionssignaturen in einem Netzwerk aus T-Zell-Kostimulations- und Zytokin-Signalgenen aufweisen statt in klassischen bovinen Tuberkulose-Kandidatengenen, was die entscheidende Bedeutung artspezifischer genomischer Ressourcen für eine präzise Schlussfolgerung über Krankheitsresistenz hervorhebt.

Ahmad, A., bakar, A., Laeeque, S. M., Khan, W. A., Kaul, H., Manan, A., mustafa, h.2026-08-11
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The contribution of short tandem repeats to splicing variation in the human cortex

Diese Studie nutzt tiefgreifende RNA-Seq- und Genotypisierungsdaten aus 336 menschlichen Gehirnproben, um Tausende von kurzen Tandem-Repeats zu identifizieren, die das alternatives Spleißen signifikant beeinflussen, wodurch deren potenzielle Rolle bei der Regulierung von RNA-Bindeprotein-Interaktionen und ihr Beitrag zum genetischen Risiko für hirnbelassene Störungen wie Alzheimer und Schizophrenie aufgezeigt werden.

Li, Y., Margoliash, J., Goren, A., Gymrek, M.2026-08-10
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Verification of nanopore sequencing technology for clinical carbapenem-resistant Enterobacterales surveillance

Diese Studie validiert die Nanoporen-Vollgenomsequenzierung als kosteneffizientes Werkzeug für die klinische Überwachung von Carbapenem-resistenten Enterobacterales, indem sie deren Überlegenheit gegenüber der Routine-Diagnostik bei der Auflösung des genomischen Kontextes nachweist und spezifische Anforderungen an die Sequenziertiefe (10x bis 40x) für eine präzise Speziesidentifizierung, Stammtypisierung und Plasmid-Epidemiologie definiert.

Sauerborn, E., Foster-Nyarko, E., Schroeder, K., Sobkowiak, A., Atum, S., Gebhardt, F., Wantia, N., Urban, L.2026-08-10
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A pangenome-graph approach for mapping and imputing barley sequences

Dieses Paper präsentiert Pan20, ein Gersten-Pangenom-Graph, der auf Basis der MorexV3-Referenz und globaler Diversitätsdaten erstellt wurde und eine neuartige Greedy-Mapping-Strategie sowie den Practical Haplotype Graph (PHG)-Ansatz nutzt, um eine präzise Sequenzähnlichkeit, die Detektion von Präsenz-Absenz-Variationen und eine effiziente genomische Imputation über die Einschränkungen einer einzelnen linearen Referenz hinaus zu ermöglichen.

Sarria, J., Amhal, H., Ramirez, C. J., Igartua, E., Casas, A. M., Contreras-Moreira, B.2026-08-10
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BLink-seq delivers population-scale haplotypes without long reads: a scalable framework for non-model genomics

Diese Studie stellt BLink-seq vor, ein skalierbares, kostengünstiges Linked-Read-Sequenzierungs-Framework, das mit Standard-Short-Read-Plattformen kompatibel ist und die Erzeugung von chromosomweit phasierten Haplotypen sowie die Detektion von Strukturvarianten im Populationsmaßstab bei Nicht-Modellorganismen ermöglicht, wie durch die Validierung in *Drosophila melanogaster* und die groß angelegte Anwendung auf Populationen des Atlantischen Silberfisches demonstriert wurde.

Iqbal, A. R., Dimens, P. V., Rick, J. A., Munn, P. R., McNairn, A. J., Landis, J. B., Schembri, R., Chan, Y. F., Kucka (…)2026-08-07