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genomics

271 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

Single-Plant Genome-Wide Association Study Identifies Loci Controlling Multiple Vegetative Architecture Traits in Cultivated Northern Wild Rice (Zizania palustris L.)

Diese Studie demonstriert die Wirksamkeit einer Einzel-Pflanzen-Genomweiten Assoziationsstudie (sp-GWAS) zur Identifizierung von genetischen Loci, die mehrere vegetative Architekturmerkmale in der kultivierten nordamerikanischen Wildreisart (Zizania palustris L.) steuern, und liefert damit eine Grundlage für genomische Vorhersage und die beschleunigte Züchtung dieser Kulturpflanze.

McGilp, L., Millas, R., Mickelson, A., Shannon, L. M., Kimball, J.2026-04-19🧬 genomics

Improved deconvolution of circulating tumor DNA from ultra-low-pass whole-genome methylation sequencing using CelFiE-ISH

Die Studie zeigt, dass die Integration einer größeren Anzahl epithelial-spezifischer Marker in das CelFiE-ISH-Deconvolutionsframework die Nachweisgrenze für zirkulierende Tumor-DNA in ultra-low-pass Nanopore-Methylierungssequenzierungen auf 1,7–3,1 % senken und damit etablierte Kopienzahl-Veränderungs-Benchmarks erreichen oder übertreffen kann.

Katsman, E., Isaac, S., Darwish, A., Maoz, M., Inbar, M., Marouani, M., Unterman, I., Gugenheim, A., Salaymeh, N., Abu Khdeir, S., Uziely, B., Peretz, T., Kaduri, L., Hubert, A., Cohen, J. E., Salah (…)2026-04-18🧬 genomics

Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual andgametocyte development in Plasmodium falciparum

Diese Studie nutzt fortschrittliche Sequenzierungstechnologien, um eine umfassende, stadienspezifische Charakterisierung von long non-coding RNAs in *Plasmodium falciparum* zu erstellen und deren potenzielle regulatorische Rolle insbesondere bei der Gametogenese aufzudecken.

Gruenebast, J., Singhal, R., Olson, S., Bromley, R., Kanatani, S., Ko, K., Dunning Hotopp, J. C., Sinnis, P., Llinas, M., Serre, D.2026-04-18🧬 genomics

Genome sequencing and multi-stage, blood-feeding, and tissue-specific transcriptome atlas of the Rocky Mountain wood tick provide a critical resource for this vector

Diese Studie stellt ein hochkontiguiertes Referenzgenom und einen umfassenden, mehrstufigen sowie gewebespezifischen Transkriptom-Atlas für den Rocky-Mountain-Wood-Tick (Dermacentor andersoni) bereit, die als entscheidende Ressource für das Verständnis der Biologie dieses Krankheitsüberträgers und die Entwicklung von Bekämpfungsstrategien dienen.

Tompkin, J. E., Saelao, P., Kruczalak, J., Yeo, H., Olafson, P. U., Sim, S. B., Oyen, K., Kelley, M., Corpuz, R. L., Scheffler, B., Geib, S. M., Childers, A., Chen, X., Weirauch, M. T., Dergousoff, S. (…)2026-04-17🧬 genomics

Whole-genome 3D architectural screen reveals modulators of brain DNA structure

Die Studie stellt die hochdurchsatzfähige Plate-C-Plattform vor, die durch systematische Screens Tausender genomischer Architekturen in verschiedenen Zelltypen aufzeigt, wie diverse Signalwege die 3D-DNA-Struktur des Gehirns modulieren, und validiert diese Erkenntnisse durch in-vivo-Experimente an Mäusen.

Parasar, B., Raja Venkatesh, A., Perera, J., Sosnick, L., Moghadami, S., Seo, Y., Shi, J., Chan, L., Takenawa, S., Akiyama, T., Sianto, O., Uenaka, T., Hadjipanayis, A., Wernig, M., Gitler, A. D., Tan (…)2026-04-17🧬 genomics

Comparing DNA extraction methods for successful PacBio HiFi sequencing: a case study of the freshwater mussel Anodonta anatina (Bivalvia: Unionidae)

Diese Fallstudie zeigt, dass für die PacBio-HiFi-Sequenzierung der Flussmuschel *Anodonta anatina* das Omega Mollusc Kit bei flashgefrorenem Gewebe die beste Wahl ist, während bei frischem Gewebe die Nanobind- oder CTAB-Protokolle überlegen sind, wobei Nachreinigungsschritte die DNA-Qualität eher verschlechterten.

Giulio, M., Lergster, U., Feulner, P. G. D., Weber, A. A.-T.2026-04-16🧬 genomics

Complete Telomere-to-Telomere Assembly of the Y Chromosome in the Chinese Quartet

Diese Studie präsentiert die erste vollständige, lückenlose Telomere-zu-Telomere-Assembly des Y-Chromosoms (CQ-chrY) aus dem Vater des chinesischen Quartetts, die durch die Integration verschiedener Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien erstellt wurde und damit eine entscheidende Ressource für die Erforschung der Genomvielfalt und Evolution des Y-Chromosoms in ostasiatischen Populationen darstellt.

Wang, B., Wan, S., Zhang, P., Zhang, Y., Wang, X., Dong, L., Ye, K., Yang, X.2026-04-16🧬 genomics

CSI-SSU: Phylogenetic contamination screening of genomic datasets, demonstrated on the Protist 10,000 Genomes (P10K) database

Das Paper stellt CSI-SSU vor, ein skalierbares computergestütztes Werkzeug zur phylogenetischen Identifizierung von Kontaminationen und taxonomischen Validierung genomischer Daten, das erfolgreich auf die Protist-10.000-Genome-Datenbank (P10K) angewendet wurde, um deren Qualität und Zuverlässigkeit für die Erforschung der eukaryotischen Evolution zu gewährleisten.

Porfirio-Sousa, A. L., Jones, R. E., Brown, M. W., Lahr, D. J. G., Tice, A. K.2026-04-15🧬 genomics