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genomics

271 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

Genomic resources of Ascidiella aspersa and comparative analysis across tunicates reveal class-level features and evolutionary diversification

Diese Studie stellt ein hochwertiges Genom und Transkriptom der invasiven Tunicata-Art *Ascidiella aspersa* bereit, führt eine umfassende vergleichende Analyse von 35 weiteren Tunicata-Arten durch, um klassenspezifische Merkmale und evolutionäre Diversifizierung aufzuklären, und veröffentlicht die daraus resultierenden Daten sowie phylogenetische Hypothesen in einer neuen Online-Datenbank namens TUNOME.

Shito, T. T., Jayakumar, V., Nishitsuji, K., Nishitsuji, Y., Shimon, K., Miyasaka, S. O., Oka, K., Sakakibara, Y., Hotta, K.2026-04-09🧬 genomics

Deep-Plant: a supervised foundation model for plant regulatory genomics

Die Studie stellt Deep-Plant vor, einen überwachten Grundmodell für die pflanzliche regulatorische Genomik, der durch das Vorhersagen von Chromatinzuständen direkt aus der DNA-Sequenz eine überlegene Genauigkeit, Geschwindigkeit und Interpretierbarkeit im Vergleich zu selbstüberwachten DNA-Sprachmodellen bietet.

Daoud, A., Roy, S., Zeng, H., Bao, X., Zhang, Z., Wang, J., Parodi, P., Reddy, A., Liu, J., Ben-Hur, A.2026-04-09🧬 genomics

Transposable element disruption of a second thyroglobulin-like gene confers Vip3Aa resistance in Helicoverpa armigera

Die Studie identifiziert mittels Langread-Sequenzierung und CRISPR-Cas9-Editierung eine durch ein Transposon gestörte zweite Thyreoglobulin-ähnliche Genvariante (HaVipR2) als neuen, entscheidenden Mechanismus für die Vip3Aa-Insektizidresistenz beim Baumwollkapselbohrer Helicoverpa armigera.

Bachler, A., Walsh, T. K., Andrews, D., Williams, M., Tay, W. T., Gordon, K. H., James, B., Fang, C., Wang, L., Wu, Y., Stone, E. A., Padovan, A.2026-04-09🧬 genomics

Over-representation of sperm-associated deleterious mutations across wild and ex situ cheetah (Acinonyx jubatus) populations

Die Studie zeigt, dass Wild- und Ex-situ-Populationen von Geparden vergleichbare genetische Diversität und Inzucht aufweisen, wobei schädliche Mutationen, die die Spermienqualität beeinträchtigen, in allen Populationen überrepräsentiert sind, während sich die Last und die Populationsspezifität dieser Mutationen regional unterscheiden.

Peers, J. A., Sibley, H. R., Armstrong, E. E., Crosier, A. E., Nash, W. J., Koepfli, K.-P., Haerty, W.2026-04-09🧬 genomics

Systemic mutagen exposures reported by normal kidney cell genomes

Die Studie zeigt, dass die Genome normaler Nierenzellen, insbesondere der proximalen Tubuli, durch hochauflösende Sequenzierung ein breites Spektrum systemischer mutagener Expositionen aufdecken, darunter bekannte Karzinogene wie Aristolochiasäuren sowie bisher unbekannte mutagene Faktoren, die weltweit und insbesondere in Japan verbreitet sind.

Wang, Y., Knight, W., Ferreiro-Iglesias, A., Abedi-Ardekani, B., Pham, M. H., Moody, S., Hooks, Y., Abascal, F., Nunn, C., Fitzgerald, S., Cattiaux, T., Gaborieau, V., Fukagawa, A., Jinga, V., Rascu (…)2026-04-09🧬 genomics

Benchmarking SNP-Calling Accuracy Against Known Citrus Pedigrees Reveals Pangenome Advantages Over Linear References

Die Studie zeigt, dass ein Citrus-Pangenom-Referenzgraph im Vergleich zu linearen Referenzen die Genauigkeit der SNP-Identifizierung verbessert, indem er Referenzverzerrungen in divergenten Regionen reduziert und die Rekonstruktion von Haplotyp-Blöcken in Nachkommen erleichtert.

Kuster, R. D., Sisler, P., Sandhu, K., Yin, L., Niece, S., Krueger, R., Dardick, C., Keremane, M., Ramadugu, C., Staton, M. E.2026-04-09🧬 genomics

Genomic indicators of gene function: A systematic assessment of the human genome

Diese Studie zeigt, dass Transkriptionsaktivität und evolutionäre Konservierung die stärksten und konsistentesten genomischen Indikatoren für die Funktion von kodierenden und nicht-kodierenden Genen sind, während weitere Merkmale wie Histonmarkierungen und Chromatinzugänglichkeit ebenfalls wichtige Hinweise liefern.

Cooper, H. B., Rojas Lopez, K. E., Schiavinato, D., Black, M. A., Gardner, P. P.2026-04-09🧬 genomics

Evolutionary transfer learning enables organism-wide inference of mammalian enhancer landscapes

Diese Studie stellt STEAM vor, ein evolutionär erweitertes Deep-Learning-Modell, das durch den Transfer von regulatorischen Mustern aus 241 Säugetiergenomen und eine umfangreiche Einzelzell-Chromatin-Datenbank die Vorhersage von Enhancer-Landschaften über den gesamten menschlichen und mäuseembryonalen Entwicklungsverlauf sowie in weiteren Säugetierarten ermöglicht.

Qiu, C., Daza, R. M., Welsh, I. C., Patwardhan, R. P., Martin, B. K., Li, T., Yang, S., Kempynck, N., Taylor, M. L., Fulton, O., Le, T.-M., O'Day, D. R., Lalanne, J.-B., Domcke, S., Murray, S. A., Aer (…)2026-04-08🧬 genomics

Nascent CUT&Tag captures transcription factor binding after chromatin duplication

Die Studie stellt die Nascent CUT&Tag-Methode vor, um die Bindung von Transkriptionsfaktoren auf neu synthetisierter DNA zu analysieren, und zeigt, dass die Wiederherstellung des GAGA-Faktors (GAF) nach der Replikation von Chromatin-Umschichtung durch BAF abhängt und je nach Motiflänge und Funktion unterschiedliche Zeitverläufe aufweist.

Wooten, M., Nguyen, K., Takushi, B. N., Ahmad, K., Henikoff, S.2026-04-07🧬 genomics

Endogenous mutational mechanisms and metabolic context shape endometrial cancer

Diese Studie analysiert genomweite Sequenzierungsdaten von 440 Endometriumkarzinomen und zeigt, dass endogene Mutationsmechanismen, metabolische Faktoren wie der Body-Mass-Index sowie spezifische genomische Instabilitätsmuster die Subtypen, die evolutionären Verläufe und die therapeutischen Implikationen dieser Tumoren maßgeblich prägen.

Sang, J., Zhang, M., Chavez, S., Kim, Y., Veith, T., Zhou, W., Luo, W., Miranda, A. M., Luebeck, J., Wang, G., Zhu, B., Bafna, V., Chanock, S. J., Zhang, T.2026-04-07🧬 genomics