🧬 Category

genomics

368 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

🧬 genomics

Comparative Analysis of Transposable Elements in Hermetia illucens

Diese Studie zeigt auf, dass der lineagespezifische Turnover von DNA-Transposon-Familien, statt Veränderungen auf Klassenebene, die Genomvariation und Adaptation in *Hermetia illucens* vorantreibt, während sie gleichzeitig demonstriert, dass Multi-Genom-Repeat-Bibliotheken die Detektion und Klassifizierung von transponierbaren Elementen und deren assoziierten Strukturvarianten im Vergleich zu Single-Reference-Ansätzen signifikant verbessern.

Hector Rosche-Flores, H., Fischer, S., Picard, C. J.2026-07-11
🧬 genomics

Characterizing the Small Non-Coding RNA Pathways in the Invasive Zebra Mussel (Dreissena polymorpha)

Diese Studie charakterisiert die einzigartigen kleinen RNA-Signalwege in der invasiven Zebramuschel und zeigt eine modifizierte siRNA-Maschinerie auf, die dennoch das durch dsRNA induzierte Gen-Silencing unterstützt, wodurch eine Grundlage für die Entwicklung von RNAi-basierten Werkzeugen zur Bekämpfung dieser schädlichen Art geschaffen wird.

Hernandez Elizarraga, V. H., O'Brien, L. G., Ballantyne, S., Gohl, D. M.2026-07-11
🧬 genomics

Joint analysis of multiply perturbed cells improves statistical power and cost efficiency in Perturb-seq

Das Papier stellt PerturbMatch vor, ein statistisches Framework, das Guide-Multiplets (Doublets und Triplets) in Perturb-seq-Experimenten nutzt, um die Kosten pro Zelle signifikant zu senken und die statistische Power zu erhöhen, während die Signalrekonstruktion vergleichbar mit technischen Replikaten bleibt.

Yeung, J., Tan, J., Wang, L., Wu, D., Melo Carlos, S., Kageyama, J., Kamm, J., Chu, B. B., Mayba, O., Forrest, W. F., Xi (…)2026-07-11
🧬 genomics

Genomic impact of the second plague pandemic on three human populations

Diese Studie analysiert Ganzgenomsequenzierungsdaten von 529 antiken Individuen an drei nordeuropäischen Fundorten und findet keine Belege dafür, dass die zweite Pestepidemie eine starke positive Selektion auf protektive genetische Varianten vorantrieb, sondern offenbart stattdessen eine signifikante Reduktion der Langstreckeneinwanderung und der Diversität der Abstammung nach der Ankunft der Pandemie, was mit dem Ende des Wikingerzeitalters, der Christianisierung und dem Beginn der Kleinen Eiszeit zusammenfällt.

Liu, X., Moore, K., Ebenesersdottir, S. S., Arcini, C., Walker, G.-T., Denham, S. D., Slavin, P., Sotofte, M. B., Nielse (…)2026-07-10
🧬 genomics

Persistence of tobacco-mutated alveolar progenitor cells after smoking cessation mirrors long term risk of lung adenocarcinoma

Diese Studie zeigt auf, dass die divergierenden Risiken nach dem Rauchstopp bei Lungenkrebs-Subtypen durch unterschiedliche regenerative Dynamiken getrieben werden, wobei persistierend mutierte Alveolar-Progenitorzellen das Adenokarzinom-Risiko aufrechterhalten, während nahezu normale basale Stammzellen expandieren, um vor Plattenepithelkarzinomen zu schützen.

Przybilla, M. J., Ammar, A., Selway-Clarke, H., Lawson, A. R. J., Spencer Chapman, M., Jung, H., Gowers, K. H. C., Nicol (…)2026-07-09
🧬 genomics

Schizophrenia-associated DNA methylation differences in the cortex are neuron-specific

Diese Studie zeigt, dass die mit Schizophrenie assoziierten DNA-Methylierungsunterschiede im präfrontalen Kortex hochspezifisch für Neuronen sind und in Bulk-Gewebeanalysen weitgehend maskiert werden, was durch zelltypspezifische genomweite Assoziationsstudien auf neuroentwicklungsbedingte und synaptische Signalwege hindeutet.

Hannon, E., Walker, E. M., Chioza, B., Burrage, J., Blake, G. E. T., Sharp, M., Babtie, A., Frith, M., Clifton, N. E., S (…)2026-07-09
🧬 genomics

A chromosome-level reference genome of the largest cervid species - the European moose (Alces alces; Linnaeus, 1758)

Diese Arbeit präsentiert die erste Chromosom-Ebene umfassende, haplotyp-aufgelöste Referenzgenom-Assemblierung des Europäischen Elches (*Alces alces*), welche zwei hochwertige Pseudo-Haplotypen mit nahezu vollständigen BUSCO-Scores und einer extensiven Genannotation aufweist.

Torresen, O. K., Mysterud, A., Skage, M., Danneels, B., Strand, M. A., Ferrari, G., Tooming-Klunderud, A., Jakobsen, K. (…)2026-07-08
🧬 genomics

Recombination and repetitive genomic landscapes are decoupled in a close relative of Caenorhabditis elegans

Durch die Erstellung einer genetischen Karte des Nematoden *C. inopinata* zeigt diese Studie, dass trotz der für diese Art untypischen gleichmäßigen Verteilung von repetitiven Elementen und Genen die Rekombinationsraten teilweise konserviert bleiben und weitgehend von diesen genomischen Merkmalen entkoppelt sind, was die Annahme infrage stellt, dass Rekombinationsvariation allein eine solche chromosomale Organisation vorantreibt.

Moser, K. A., King, C., Woodruff, G. C.2026-07-07
🧬 genomics

FIND: a software tool for identifying population-enriched pathogenic variants in gnomAD

Die Autoren präsentieren FIND, ein frei verfügbares Web-Tool, das populationsangereicherte pathogene Varianten in der gnomAD-Datenbank identifiziert, indem es Allele mit signifikant höheren Frequenzen in spezifischen Abstammungsgruppen detektiert und dadurch die Entdeckung von Gründer-Mutationen sowie populationsspezifischer Krankheitslast, einschließlich historisch unterrepräsentierter Populationen, erleichtert.

Horowitz, A. L., Liebman, A. Z., Liebman, S. W.2026-07-07
🧬 genomics

EDTA v2: enabling scalable TE annotation in animal genomes

EDTA v2 ist ein verbessertes, skalierbares Werkzeug, das die automatisierte Annotation von transponierbaren Elementen in tierischen Genomen ermöglicht, indem es die Detektion von LINE/SINE integriert, den TIR-Learner für die Einsatzfähigkeit umschreibt und strukturelle Detektoren signifikant beschleunigt.

Ou, S., Lu, T., Nguyen, H., Gerhardt, K., Fang, N. F., Rashid, U., Guhlin, J., Dainat, J., Bao, Z., Bayer, P. E., Na, Y. (…)2026-07-06