Contrasting population structures coexist in a strain-resolved estuarine microbiome

Durch den Einsatz von Nanopore-Sequenzierung und dem Assemblierer myloasm gelang es, aus einer einzigen Estuar-Probe 488 hochqualitative Einzelkontig-Genome zu rekonstruieren, was erstmals einen straff aufgelösten Einblick in koexistierende, evolutionär kontrastierende Mikrobenpopulationen ermöglicht und den langjährigen Traum Torbens nach vollständigen Pelagibacter-Genomen aus Metagenomen erfüllt.

Lui, L. M., Nielsen, T.2026-03-31🦠 microbiology

A replication-centered phylogeny illuminates the evolutionary landscape of bacterial plasmids

Die Studie stellt PInc vor, ein replikationszentriertes Klassifizierungsrahmenwerk, das auf konservierten Repressor-Initiator-Proteinen (RIPs) basiert und durch die Rekonstruktion einer umfassenden Phylogenie die evolutionäre Landschaft von Bakterienplasmiden aufklärt, wodurch historische Wirtsbias und die Grenzen bestehender Annotationsschemata überwunden werden.

Nishimura, Y., Kaneko, K., Kamijo, T. + 13 more2026-03-30🦠 microbiology

A Machine Learning Framework for Serogroup Classification of pathogenic species of Leptospira Based on rfb Locus Profiles

Diese Studie stellt einen zweistufigen maschinellen Lernrahmen vor, der auf Genomdaten des rfb-Lokus basiert, um pathogene Leptospira-Arten präzise in Serogruppen und neu definierte „Seroklassen" zu klassifizieren und damit eine skalierbare Alternative zu traditionellen serologischen Tests bietet.

de Carvalo Ferreira Filho, E., Melo Arruda, P., Cabral Afonso Ferreira, L. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

Does Infection Progression of Mycobacterium abscessus Depend on Sex, Age, and Mouse strain?

Die Studie identifiziert 5- bis 6-wöchige weibliche BALB/cJRJ-Mäuse als geeignetes murines Modell für die Bewertung von Medikamenten gegen Mycobacterium abscessus, da diese im Vergleich zu C57BL/6NCrl-Mäusen eine stabilere und weniger variable Infektionsverlauf aufweisen, ohne dass Geschlecht oder Alter signifikante Unterschiede bewirken.

Rima, M., Chauffour, A., Tournebize, R. + 4 more2026-03-30🦠 microbiology

A set of constitutive promoters with graded strengths for gene expression in diverse cyanobacterial strains

Diese Studie charakterisiert eine Bibliothek von 25 orthogonellen, konstitutiven Promotoren mit abgestuften Stärken, die in verschiedenen cyanobakteriellen Modell- und Nicht-Modellstämmen eine breite Palette an Genexpressionsniveaus ermöglichen und somit wertvolle genetische Werkzeuge für biotechnologische Anwendungen bereitstellen.

Trieu, K., Bishe, B., Taton, A. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

ONETest PathoGenome: A Multi-Cohort Evaluation of an Optimized NGS Assay for Detection of Lower Respiratory Pathogens in Bronchoalveolar Lavage

Die Studie zeigt, dass der automatisierte Hybrid-Capture-metagenomische Assay ONETest PathoGenome in Bronchoalveolär-Lavages-Proben eine hohe diagnostische Genauigkeit bietet, die Erregerdetektion im Vergleich zu herkömmlichen Kulturmethoden signifikant verbessert und dabei eine schnelle Ergebnisbereitstellung innerhalb von 24 Stunden ermöglicht.

Massoumi Alamouti, S., Nguyen, H. D., Daneshpajouh, H. + 9 more2026-03-30🦠 microbiology

DEAD-box RNA helicase DDX3X maintains the homeostasis of the Zika virus translation-replication cycle

Die Studie zeigt, dass die zelluläre RNA-Helikase DDX3X die Replikation des Zika-Virus in menschlichen Mikrogliazellen durch eine ATP-abhängige Förderung der Proteinsynthese und eine ATP-unabhängige Beeinträchtigung der RNA-Synthese steuert, wodurch sie einen spezifischen regulatorischen Mechanismus im Übersetzungs-Replikations-Zyklus dieses Virus aufdeckt.

Hernandez-Diaz, T., Gonzalez-Poblete, A., Giraldo-Ocampo, S. + 13 more2026-03-30🦠 microbiology

Evidence for the acquisition of a proteorhodopsin-like rhodopsin by a chrysophyte-infecting giant virus

Diese Studie beschreibt die erste Isolierung des Chrysophyceae Clade H virus SA1, eines Riesenvirus der Familie Mimiviridae, das einen Chrysophyten infiziert und durch eine einzigartige Morphologie sowie die erstmalige Entdeckung von Rhodopsinen und horizontal übertragenen Genen mariner Cyanobakterien in einem Virus charakterisiert ist.

Byl, P., Schvarcz, C. R., Thomy, J. + 6 more2026-03-29🦠 microbiology