Technological folie à deux: Feedback Loops Between AI Chatbots and Mental Illness

Die Arbeit argumentiert, dass die Interaktion zwischen den kognitiven Verzerrungen von Menschen mit psychischen Erkrankungen und den sycophantischen sowie adaptiven Eigenschaften von KI-Chatbots zu einem gefährlichen Feedback-Loop führt, der bestehende Sicherheitsmaßnahmen untergräbt und eine koordinierte Reaktion aus klinischer, technischer und regulatorischer Perspektive erfordert.

Sebastian Dohnány, Zeb Kurth-Nelson, Eleanor Spens, Lennart Luettgau, Alastair Reid, Iason Gabriel, Christopher Summerfield, Murray Shanahan, Matthew M NourThu, 12 Ma🧬 q-bio

Multi-factor modeling of chlorophyll-a in South China's subtropical reservoirs using long-term monitoring data for quantitative analysis

Basierend auf Langzeit-Monitoringdaten von 2020 bis 2024 entwickelten die Autoren ein dynamisches Multi-Faktor-Modell für drei Stauseen in Südchina, das die nichtlinearen Wechselwirkungen zwischen Wassertemperatur und Nährstoffen (wobei Stickstoff als stärkerer Treiber als Phosphor identifiziert wurde) zur präzisen Quantifizierung der Chlorophyll-a-Dynamik nutzt.

Haizhao Guan, Yiyuan Niu, Chuanjin Zu, Ju KangThu, 12 Ma🧬 q-bio

Trade-offs between structural richness and communication efficiency in music network representations

Die Studie zeigt, dass die Wahl der musikalischen Merkmalskodierung in Netzwerkdarstellungen einen grundlegenden Zielkonflikt zwischen struktureller Detailtreue und kommunikativer Effizienz aufdeckt, wobei einfache Darstellungen zwar höhere Unsicherheit, aber bessere Lernbarkeit bieten, während komplexere Kodierungen feinere Unterscheidungen ermöglichen, jedoch die Vorhersagbarkeit für den Hörer erschweren.

Lluc Bono Rosselló, Robert Jankowski, Hugues Bersini, Marián Boguñá, M. Ángeles SerranoThu, 12 Ma🧬 q-bio

pHapCompass: Probabilistic Assembly and Uncertainty Quantification of Polyploid Haplotype Phase

Die Studie stellt pHapCompass vor, einen probabilistischen Algorithmus zur Haplotyp-Assemblierung polyploider Genome, der die Unsicherheit bei der Zuordnung von Sequenzreads explizit modelliert, eine realistische Simulationsumgebung für Polyploide entwickelt und durch Benchmarks eine wettbewerbsfähige Leistung bei gleichzeitiger präziser Quantifizierung der Phasenunsicherheit nachweist.

Marjan Hosseini (School of Computing, University of Connecticut), Ella Veiner (School of Computing, University of Connecticut), Thomas Bergendahl (School of Computing, University of Connecticut), Tala Yasenpoor (School of Computing, University of Connecticut), Zane Smith (Department of Entomology and Plant Pathology, University of Tennessee), Margaret Staton (Department of Entomology and Plant Pathology, University of Tennessee), Derek Aguiar (School of Computing, University of Connecticut, Institute for Systems Genomics, University of Connecticut)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Equivariant Asynchronous Diffusion: An Adaptive Denoising Schedule for Accelerated Molecular Conformation Generation

Die Arbeit stellt Equivariant Asynchronous Diffusion (EAD) vor, ein neues Diffusionsmodell, das durch einen adaptiven, asynchronen Denoising-Plan die Hierarchie molekularer Strukturen besser erfasst und gleichzeitig einen molekülweiten Horizont bewahrt, um den Stand der Technik bei der Generierung 3D-molekularer Konformationen zu erreichen.

Junyi An, Chao Qu, Yun-Fei Shi, Zhijian Zhou, Fenglei Cao, Yuan QiThu, 12 Ma🧬 q-bio

SDSR: A Spectral Divide-and-Conquer Approach for Species Tree Reconstruction

Die Arbeit stellt SDSR vor, einen skalierbaren, auf spektraler Graphentheorie basierenden Divide-and-Conquer-Algorithmus zur Rekonstruktion von Speziesbäumen, der die Rechenzeit im Vergleich zu herkömmlichen Methoden um das Zehnfache reduziert, ohne dabei die Genauigkeit der phylogenetischen Analyse zu beeinträchtigen.

Ortal Reshef (Hebrew University of Jerusalem), Ofer Glassman (Weizmann Institute of Science), Or Zuk (Hebrew University of Jerusalem), Yariv Aizenbud (Tel Aviv University), Boaz Nadler (Weizmann Institute of Science), Ariel Jaffe (Hebrew University of Jerusalem)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Discovery of a Hematopoietic Manifold in scGPT Yields a Method for Extracting Performant Algorithms from Biological Foundation Model Internals

Die Studie präsentiert eine dreistufige Methode zur Extraktion eines kompakten, hochleistungsfähigen hämatopoetischen Algorithmus aus dem Foundation-Modell scGPT mittels mechanischer Interpretierbarkeit, der ohne erneutes Training des Ziel-Datensatzes die Leistung bestehender Methoden übertrifft und biologisch interpretierbare Genprogramme offenbart.

Ihor KendiukhovThu, 12 Ma🧬 q-bio

How to make the most of your masked language model for protein engineering

Die Autoren stellen eine flexible Stichprobenmethode mit stochastischer Beam-Suche für Masked Language Models vor, die durch systematische in silico- und in vitro-Evaluierungen im Bereich der Antikörper-Engineering zeigt, dass die Wahl der Sampling-Methode mindestens genauso entscheidend für den Erfolg ist wie die Wahl des Modells selbst.

Calvin McCarter, Nick Bhattacharya, Sebastian W. Ober, Hunter ElliottThu, 12 Ma🧬 q-bio

ATP Level and Phosphorylation Free Energy Regulate Trigger-Wave Speed and Critical Nucleus Size in Cellular Biochemical Systems

Diese Studie zeigt, dass der intrazelluläre energetische Zustand, insbesondere die ATP-Konzentration und die Phosphorylierungsfreie Energie, nicht nur die Geschwindigkeit und die kritische Nukleusgröße von Triggerwellen in biochemischen Systemen steuert, sondern auch deren Ausbreitungsrichtung und Existenzbedingungen maßgeblich beeinflusst.

Jianwei Li, Kai Meng, Xuewen Shen, Fangting LiThu, 12 Ma🧬 q-bio

Packaging Jupyter notebooks as installable desktop apps using LabConstrictor

Die Arbeit stellt LabConstrictor vor, ein Tool, das Jupyter-Notebooks mithilfe von CI/CD-Automatisierung in einfach installierbare Desktop-Anwendungen verwandelt, um die Verbreitung und Wiederverwendung von Open-Source-Software in den Lebenswissenschaften durch vereinfachte Distribution und eine benutzerfreundliche Oberfläche zu fördern.

Iván Hidalgo-Cenalmor, Marcela Xiomara Rivera Pineda, Bruno M. Saraiva, Ricardo Henriques, Guillaume JacquemetThu, 12 Ma🧬 q-bio

SNPgen: Phenotype-Supervised Genotype Representation and Synthetic Data Generation via Latent Diffusion

Das Paper stellt SNPgen vor, ein zweistufiges, phänotypüberwachtes latentes Diffusionsmodell, das synthetische Genotypdaten erzeugt, die sowohl die genetische Struktur und Privatsphäre der Originaldaten bewahren als auch in Vorhersageaufgaben die Leistung realer Daten erreichen.

Andrea Lampis, Michela Carlotta Massi, Nicola Pirastu, Francesca Ieva, Matteo Matteucci, Emanuele Di AngelantonioThu, 12 Ma🧬 q-bio

Macroscopic Dominance from Microscopic Extremes: Symmetry Breaking in Spatial Competition

Die Studie zeigt, dass zwar extreme statistische Fluktuationen in der Entdeckungsphase eine anfängliche Asymmetrie erzeugen können, eine robuste makroskopische Dominanz jedoch zwingend eine nicht-reziproke Wechselwirkung erfordert, um lokale Schwankungen zu unterdrücken und das System in einen stabilen absorbierenden Zustand zu überführen.

Stuti Guha, Shawn D. Ryan, Bhargav R. KaramchedThu, 12 Ma🧬 q-bio