🧬 Category

q-bio

3821 Arbeiten

🧬 biology

SPICE: a simulator as teacher for learning beyond native-label coverage

Dieses Paper stellt SPICE vor, ein durch einen Simulator überwachtes Lernframework, das das Training physikalischer Modelle über die Abdeckung nativer Labels hinaus erweitert, indem es einen Allatom-Simulator nutzt, um Online-Feedback mit Gradienten auf vom Lerner generierte Vorschläge zu geben, wodurch die Entdeckung gültiger Zustände und die Generierung von konfidenzgewichteten Pseudo-Labels in labelarmen Umgebungen ermöglicht wird.

Kuang Jingwen2026-09-14
🧬 biology

Apparent sequence-model contribution depends strongly on negative-set construction: a calibration across 94 ENCODE eCLIP datasets

Diese Studie zeigt, dass der geschätzte Beitrag von Sequenzmodellen für RNA-bindende Proteine signifikant von der Methode zur Konstruktion des Negativ-Sets und dem verwendeten Baseline-Modell abhängt, was Forscher dazu drängt, Cross-Fitting anzuwenden, die Leistung ausschließlich basierend auf der Komposition zu berichten und den Vergleich von Beiträgen zu vermeiden, die aus unterschiedlichen Negativ-Set-Protokollen abgeleitet wurden.

Nirmalkumar Thirupallikrishnan Kesavan2026-09-14
🧬 biology

MA-5 attenuates disease-associated transcriptomic aging and pathological microglial states in Gaucher disease

Die Studie zeigt, dass die Mitochondrien-zielgerichtete Verbindung MA-5 die Neuroinflammation abschwächt und die beschleunigte transkriptomische Alterung bei Morbus Gaucher umkehrt, indem sie die mitochondriale Integrität bewahrt, die cGAS–STING- und NLRP3-Inflammasom-Signalisierung unterdrückt und die Zellfunktion sowohl in Mausmodellen als auch in patientenabgeleiteten Zellen verbessert.

Takaaki Abe, Yoshiyasu Tongu, Tomoko Kasahara, Kohta Nakamura, Alexander Tyshkovskiy, Yoshitsugu Oikawa, Tetsuro Matsuha (…)2026-09-14
🧬 biology

Hyperelastic Cardiovascular NN–FE: A Framework for Integrating Nonlinear Finite Element Solvers with Neural Networks for the Hyperelastic Modeling of Cardiac Valve Tissue

Diese Arbeit präsentiert ein hybrides NN–FE-Framework, das ein Feedforward-Neuronales-Netzwerk mit einem nichtlinearen Finite-Elemente-Solver integriert, um ein recheneffizientes, physikalisch konsistentes Ersatzmodell zur präzisen Vorhersage der hyperelastischen Verformung von Herzklappengewebe unter verschiedenen biaxialen Belastungsbedingungen zu erstellen.

Maedeh Makki, Gerhard Holzapfel, Maziar Raissi, Chung-Hao Lee2026-09-14
🧬 biology

An undeclared free parameter underneath in vitro microelectrode array metrics

Diese Arbeit zeigt auf, dass die in Mikroelektrodenarray-Studien weit verbreitete „Anzahl aktiver Elektroden“ kein objektives Maß für die Netzwerkreifung ist, sondern vielmehr ein Artefakt inkonsistent angewendeter Feuerratenschwellenwerte, und fordert Forscher dazu auf, ihre Kriterien explizit anzugeben und Sensitivitätsanalysen durchzuführen, um die Interpretierbarkeit der Daten zu gewährleisten.

Teertha Sri Rathod Banoth2026-09-14
🧬 biology

Bioproduction of Neospora caninum: a proof-of- concept towards a scalable serum-free process

Diese Studie demonstriert die Machbarkeit eines skalierbaren, serumfreien Bioproduktionsprozesses für das onkolytische Protozoon *Neospora caninum* unter Verwendung industrieller CHO-K1-Zellen und Advanced DMEM/F-12-Medium und adressiert damit kritische Engpässe bei der Standardisierung und der regulatorischen Konformität für dessen klinische Translation als Krebstherapie.

Zineb Lakhrif, Nathalie Moiré, Audrey Munos-Guillon, Anne di Tommaso, Céline Ducournau, Isabelle Dimier-Poisson, Cyril P (…)2026-09-14
🧬 biology

A Computational Study of Some Cancer Causing S100 Proteins Interacting With a Ligand, Parecoxib and Investigation of Drug Likenes Potential of the Ligand

Diese computergestützte Studie nutzt molekulares Docking, Molekulardynamik-Simulationen und MMPBSA-Freie-Energie-Berechnungen, um zu demonstrieren, dass der Wirkstoffkandidat Parecoxib starke nicht-kovalente Wechselwirkungen und eine vielversprechende Arzneimittelähnlichkeit mit dem krebsassoziierten S100A11-Protein aufweist.

Arup Kumar Sarma2026-09-14
🧬 biology

Systems Biology and CBMN-cyt Reveal Transplacental Genotoxicity of Pesticide Mixtures in an Agricultural Region of Colombia

Diese Studie integriert die systembiologische Netzwerkanalyse mit dem CBMN-Cyt-Biomonitoring, um zu zeigen, dass die pränatale Exposition gegenüber Pestizidgemischen in einer landwirtschaftlichen Region Kolumbiens signifikante zytogenetische Schäden und genomische Instabilität bei sowohl Müttern als auch Neugeborenen verursacht, was durch Störungen der Oxidationsstress- und Apoptosepfade vermittelt wird.

Shirley Salcedo Arteaga, Luisa fernanda Jimenes Vidal, Lavínia Schüler-Faccini2026-09-14
🧬 biology

Infants younger than one year retain episodic memories across a nap

Diese Studie zeigt, dass Säuglinge unter einem Jahr Alter während des Mittagsschlafs durch die Kopplung von Schlafspindeln und langsamen Oszillationen in der Lage sind, detaillierte episodische Gedächtnisinhalte schnell zu kodieren und zu konsolidieren, was darauf hindeutet, dass die infantile Amnesie auf spätere Gedächtnisprozesse zurückzuführen ist und nicht auf eine Unfähigkeit, diese Erinnerungen ursprünglich zu bilden oder zu konsolidieren.

Manuela Friedrich, Matthias Mölle, Eva-Maria Kurz, Jan Born2026-09-14
🧬 biology

Diversity and ecological distribution of spider assemblages in the Babor Mountains (Northeast Algeria)

Diese Studie stellt die erste umfassende Bewertung der Spinnendiversität in den Babor-Bergen im Nordosten Algeriens dar, wobei 125 Arten über sechs Habitate hinweg dokumentiert und Höhe, Bodenfeuchtigkeit, pH-Wert sowie Habitattyp als entscheidende Faktoren für die Gemeinschaftsstruktur identifiziert wurden.

SOUFYANE KAHLESSENANE, SAMIRA BOUSEKSOU, RIADH MOULAÏ, OURIDA KHERBOUCHE-ABROUS2026-09-14