🧬 biology

Unifying the statistical foundations of variant and methylation calling for enabling sequencing platform and calling scenario independence within Varlociraptor

Diese Arbeit präsentiert ein verallgemeinertes bayessches statistisches Framework innerhalb von Varlociraptor, das die Detektion von genetischen Varianten und Methylierungsraten über verschiedene Sequenzierplattformen hinweg vereinheitlicht und somit eine genauere, unsicherheitsbewusste sowie gemeinsame Analyse von genomischen und epigenomischen Daten ermöglicht.

Adrian Dominic Prinz, Johannes Köster2026-09-04
🧬 biology

Predictive Neurobiomarker of Memory Performance Based on Hippocampus– Amygdala Gamma Activity During Encoding

Diese Studie zeigt, dass ein prädiktiver Neurobiomarker, der hippokampale und amygdaläre Mid-Gamma-Spektralleistung sowie Konnektivitätsmerkmale kombiniert, die während der Enkodierung aus dem intrakraniellen EEG abgeleitet wurden, die nachfolgende Gedächtnisleistung (R² = 0,8064) genau schätzen kann und somit eine potenzielle Grundlage für Echtzeit-Systeme zur kognitiven Rehabilitation bietet.

Hyung-Tak Lee, Eun-Bi Cho, Soyeon Jun, June-Sic Kim, Chun-Kee Chung, Han-Jeong Hwang2026-09-04
🧬 biology

Vulnerability of terrestrial mammals hunted for human consumption

Unter Verwendung eines phylogenetischen Modells basierend auf IUCN-Daten für über 5.000 Arten identifiziert diese Studie die Körpermasse und die Nahrungsschicht als entscheidende Prädiktoren für die Jagdbeständigkeit bei terrestrischen Säugetieren, wobei sie aufzeigt, dass mehr als 450 derzeit nicht gejagte Arten gefährdet sind, und globale Hotspots kartiert, um das zukünftige Naturschutzmonitoring zu leiten.

Michela Pacifici, Andrea Cristiano, Giordano Mancini, Martina Fernando, Marco Davoli2026-09-04
🧬 biology

Position-resolved k-mer analysis of mature microRNAs reveal widespread CG and UA depletion across taxa

Diese Studie analysiert nahezu 49.000 reife MikroRNA-Sequenzen über 271 Organismen hinweg, um eine weit verbreitete, linienassoziierte Positionsorganisation aufzuzeigen, die durch eine signifikante Depletion von CG- und UA-Dinukleotiden sowie eine Anreicherung von UG gekennzeichnet ist, was auf strukturelle oder evolutionäre Beschränkungen hindeutet, die über eine einfache Mutationsverzerrung hinausgehen.

Chandhru Srinivasan, Mano Chitra Karthikeyan, Abirami Jayaprakash, Indhirakumar Murugesan, Vignesh Packiyaraj, Antony Jo (…)2026-09-04
🧬 biology

Effects of phytoplankton blooms on aquatic macroinvertebrate assemblages in a tropical karst lake

Diese Studie über die Lagoa Misteriosa zeigt, dass Phytoplanktonblüten (WAB) und deren Ausbleiben (AAB) zwar den Zusammenhang spezifischer Makroinvertebraten-Taxa und funktioneller Nahrungsbruppen mit distinkten Wasserqualitätsparametern signifikant beeinflussen, jedoch nicht die gesamte Gemeinschaftsstruktur oder die ökologischen Indizes verändern.

Éverton Gustavo Miguel Neves, Anderson Ferreira2026-09-04
🧬 biology

Genome-wide identification of the PSK family and the association between SlPSK7 and auxin signaling in tomato

Diese Studie identifiziert acht PSK-Familien-Gene in Tomate und zeigt auf, dass SlPSK7 als positiver Regulator der Auxin-Signalisierung während des Fruchtansatzes fungiert, indem es Expressionsmuster und regulatorische Effekte auf ARF-Gene aufweist, die den Auxin-Antworten parallel verlaufen.

Shaoli Zhang, Lu Xie, Yuanyuan Song, Haidong Li, Guiyun Wang, Pengcheng Yi, Shude Yang, Luying Zhu, Kai Pan2026-09-04
🧬 biology

DPP3-mediated Destabilization of SLC3A2 Promotes Ferroptosis and Restores Chemosensitivity in Gastric Cancer

Diese Studie identifiziert DPP3 als einen kritischen Regulator der Chemosensitivität bei Magenkrebs, der die Ferroptose fördert und die therapeutische Wirksamkeit wiederherstellt, indem er SLC3A2 destabilisiert, um die Cystinaufnahme und die Glutathionsynthese zu beeinträchtigen.

Lan Yu, Ting Wu, Xuan Feng, Zhu Xu, Hui Zhi, Xuanyao Yu, Ruiying Tong, Mao Jiang, Pengfei Zhang2026-09-04
🧬 biology

Astrocyte reactivity impairs lymphopoiesis through cholesterol-dependent mTOR suppression in common lymphoid progenitors

Diese Studie zeigt auf, dass Astrozytenreaktivität die Knochenmarklymphopoese beeinträchtigt, indem sie eine Cholesterinakkumulation in gemeinsamen lymphoiden Vorläuferzellen induziert, was die mTOR-Signalisierung unterdrückt und die B-Zell-Entwicklung behindert.

Fang Ni, Rui Zhao, Xian Song, Yakun Liu, Jing Du, Tingting Liang, Zhi Yang, Lili Qian, Mingming Zhu, Jiani Zheng, Xinru (…)2026-09-04
🧬 biology

Energy Availability, Not Stress Tolerance, Determines Archaeal Persistence in Extraterrestrial Habitats

Entgegen der vorherrschenden Annahme, dass die Stresstoleranz das Überleben in extraterrestrischen Umgebungen bestimmt, offenbart eine groß angelegte genomische Analyse von 3.531 Archaeen-Genomen, dass die Energieverfügbarkeit, insbesondere die nutzbare Energiedichte der Methanogenese, der primäre Determinant für das Fortbestehen von Archaeen über verschiedene Habitate des Sonnensystems hinweg ist.

Ajay Vellanki2026-09-04
🧬 biology

Thousands of pathogenic variants in ClinVar show signs of incomplete loss-of-function

Diese Studie zeigt, dass, obwohl spezifische Metriken wie LOFTEE, pext-Scores und NMD-Analysen dabei helfen können, pathogene von benignen Varianten zu unterscheiden, tausende bekannte pathogene ClinVar-Varianten Anzeichen eines unvollständigen Funktionsverlusts aufweisen, was die erheblichen Einschränkungen verdeutlicht, die mit der ausschließlichen Nutzung automatisierter Filterregeln zum Ausschluss solcher Varianten verbunden sind.

Tatyana E. Lazareva, Yury A. Barbitoff, Yulia A. Smirnova, Andrey S. Glotov2026-09-04