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bioinformatics

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La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.

Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.

Non-consensus flanking sequence of hundreds of base pairs around in vivo binding sites: statistical beacons for transcription factor scanning

El estudio demuestra que los sitios de unión in vivo de factores de transcripción están rodeados por una firma estadística de secuencia no consenso, caracterizada por un aumento significativo del contenido de GC y alteraciones en la forma del ADN en un rango de 1000-1500 pb, lo que sugiere un mecanismo de escaneo grueso que facilita la localización de los objetivos.

Faltejskova, K., Sulc, J., Vondrasek, J.2026-03-10💻 bioinformatics

Bridging the gap between genome-wide association studies and network medicine with GNExT

El artículo presenta GNExT, una plataforma web de código abierto que integra estudios de asociación del genoma completo (GWAS) con la medicina de redes mediante pipelines estandarizados y herramientas como MAGMA y Drugst.One, facilitando la identificación de mecanismos de enfermedades y candidatos a reutilización de fármacos a gran escala.

Arend, L., Woller, F., Rehor, B., Emmert, D., Frasnelli, J., Fuchsberger, C., Blumenthal, D. B., List, M.2026-03-10💻 bioinformatics

scProfiterole: Clustering of Single-Cell Proteomic DataUsing Graph Contrastive Learning via Spectral Filters

El artículo presenta scProfiterole, un marco computacional que utiliza filtros espectrales de grafos y aprendizaje contrastivo para mejorar la agrupación y la identificación de tipos celulares en datos de proteómica de una sola célula, superando así las limitaciones de ruido y datos faltantes mediante la interpolación polinómica de filtros homófilos.

Coskun, M., Lopes, F. B., Kubilay Tolunay, P., Chance, M. R., Koyuturk, M.2026-03-10💻 bioinformatics

AQuA2-Cloud: a web platform for fluorescence bioimaging activity analysis

El artículo presenta AQuA2-Cloud, una plataforma web nativa en la nube que supera las limitaciones de licencias y requisitos computacionales de AQuA2, permitiendo a los investigadores realizar análisis cuantitativo de actividad de bioimagen espacial y temporal de alta precisión directamente desde un navegador web sin necesidad de instalar MATLAB.

Bright, M., Mi, X., Duarte, D., Carey, E., Lyu, B., Wang, Y., Nimmerjahn, A., Yu, G.2026-03-10💻 bioinformatics

Measuring Amorphous Motion: Application of Optical Flow to Three-Dimensional Fluorescence Microscopy Images

Este artículo presenta OpticalFlow3D, una herramienta de código abierto en Python y MATLAB que aplica el flujo óptico a imágenes de microscopía de fluorescencia tridimensional para cuantificar el movimiento de estructuras amorfas sin necesidad de segmentación, facilitando así la obtención de nuevos conocimientos biológicos.

Lee, R. M., Eisenman, L. R., Hobson, C., Aaron, J. S., Chew, T.-L.2026-03-10💻 bioinformatics

Automatic Generation of Model Sequences for Complex Regions in Assembly Graphs

Este artículo presenta el algoritmo Trivial Tangle Traverser (TTT), que automatiza la resolución de nudos en gráficos de ensamblaje genómico mediante un proceso de dos etapas basado en la profundidad de cobertura y la alineación de lecturas, permitiendo cerrar brechas y caracterizar regiones repetitivas complejas sin necesidad de curación manual.

Antipov, D., Chen, Y., Sollitto, M., Phillippy, A. M., Formenti, G., Koren, S.2026-03-10💻 bioinformatics

In silico analysis of the human titin protein (Immunoglobulin-like, fibronectin type III, and Protein kinase domains) as a potential forensic marker for postmortem interval (PMI) estimation

Este estudio presenta un análisis *in silico* que identifica los dominios de la proteína titina humana (especialmente el dominio Ig-like) como candidatos prometedores para la estimación del intervalo postmortem (PMI) en investigación forense, estableciendo una base computacional para futuras validaciones experimentales.

Gill, M. U., Akhtar, M.2026-03-10💻 bioinformatics

DIA-NN EasyFilter workflow for the fast and user-friendly critical assessment and visualization of DIA-NN proteomics analysis outcome

Este artículo presenta DIA-NN EasyFilter, un flujo de trabajo basado en KNIME que permite a los usuarios sin conocimientos de programación filtrar, evaluar y visualizar de manera rápida y sencilla los resultados de análisis proteómicos DIA generados por DIA-NN.

Moagi, M. G., Thatiana, F. F., Kristof, E. K., Arda, A. G., Arianti, R., Horvatovich, P., Csosz, E.2026-03-10💻 bioinformatics

NanoVI: a Bayesian variational inference Nextflow pipelinefor species-level taxonomic classification from full-length16S rRNA Nanopore reads

NanoVI es una nueva tubería de Nextflow que utiliza inferencia variacional bayesiana para realizar una clasificación taxonómica a nivel de especie de lecturas completas de 16S rRNA de Oxford Nanopore, ofreciendo estimaciones de abundancia con intervalos de credibilidad y una mayor eficiencia computacional en comparación con herramientas existentes.

Curiqueo, C., Fuentes-Santander, F., Ugalde, J. A.2026-03-10💻 bioinformatics