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biophysics

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La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.

En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.

Quantitative Mapping of Sulfation, Iduronic Acid, and Secondary Structure in Glycosaminoglycans

Mediante simulaciones de dinámica molecular a gran escala, este estudio establece un vínculo cuantitativo entre los patrones de sulfatación y la composición de monosacáridos en los glicosaminoglicanos y su organización tridimensional, identificando que la conformación de pucker 1C4 del ácido L-idurónico es clave para la formación de hélices y proponiendo una nueva métrica estructural para clasificarlas.

Riopedre-Fernandez, M., Biriukov, D., Martinez-Seara, H.2026-03-18⚛️ biophysics

Functional coupling between ribosomal RNA transcription and processing guided by stable transcription factor binding

Mediante microscopía de molécula única, este estudio demuestra que el ensamblaje estable del complejo antiterminación rrnTAC, impulsado por la reclutación final de SuhB, es esencial para coordinar la transcripción y el procesamiento co-transcripcional del ARNr en bacterias, estableciendo una distinción funcional entre interacciones transitorias en la transcripción de ARNm y estables en la de ARNr.

Chaban, A., Qureshi, N. S., Duss, O.2026-03-18⚛️ biophysics

PSF-Driven Spatio-Temporal Blending in Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy and Its Mitigation via Mean-Shift Super-Resolution-Based Masking.

Este estudio presenta un flujo de trabajo que utiliza máscaras espaciales derivadas de la super-resolución por desplazamiento medio (MSSR) para mitigar la mezcla de señales temporales en la microscopía de imagen de vida media de fluorescencia (FLIM) causada por la función de dispersión del punto, mejorando así la resolución espacial sin alterar la cinética de descomposición ni la precisión de las mediciones.

Gonzalez-Gutierrez, M., Vazquez-Enciso, D. M., Mateos, N., Hwang, W., Torres-Garcia, E., Hernandez, H. O., Chacko, J. V., Coto Hernandez, I., Loza-Alvarez, P., Wood, C., Guerrero, A.2026-03-18⚛️ biophysics

Structural mechanisms of pump assembly and drug transport in the AcrAB-TolC efflux system

Este estudio presenta estructuras de criomicroscopía electrónica de alta resolución del sistema de eflujo tripartito AcrAB-TolC de *Escherichia coli*, revelando que la lipoproteína previamente no caracterizada YbjP actúa como un componente estructural esencial que ancla y estabiliza a TolC en la membrana externa durante el ciclo completo de transporte de fármacos.

Ge, X., Gu, Z., Wang, J.2026-03-17⚛️ biophysics

A predictive mechanochemical modeling framework for the deformation and remodeling of the nuclear lamina

Los autores desarrollaron y validaron experimentalmente un modelo predictivo basado en elementos finitos que demuestra cómo la nanotopografía del sustrato y la expresión de laminina A/C influyen en la deformación, el remodelado y la ruptura de la envoltura nuclear, regulando así el transporte nucleocitoplasmático y la localización de YAP/TAZ.

Francis, E. A., Sarikhani, E., Naghsh-Nilchi, H., Jahed, Z., Rangamani, P.2026-03-17⚛️ biophysics

Intramolecular interactions between folded and disordered regions shape ubiquilin structure and function

Mediante enfoques biofísicos y computacionales, este estudio revela que las interacciones intramoleculares entre regiones desordenadas y dominios plegados modulan la conformación cerrada de las ubiquilinas, lo que sugiere diferencias funcionales fundamentales entre sus homólogos en distintos linajes eucariotas.

Niblo, J. K., Acharya, N., Watkins, M. B., Castaneda, C. A., Sukenik, S.2026-03-17⚛️ biophysics

Molecular Interactions of Viral Insulin/IGF-like Peptides with Zebrafish Receptors

Este estudio utiliza simulaciones de dinámica molecular y cálculos de energía libre para caracterizar las interacciones moleculares entre péptidos virales similares a la insulina/IGF y sus receptores en el cebra, revelando tanto similitudes con los mecanismos humanos como interacciones únicas y residuos clave que podrían mutarse para mejorar la afinidad de unión.

Levintov, L., Vashisth, H.2026-03-17⚛️ biophysics

Reflectins form multicompartment liquid-liquid phase separated condensates that mirror and may facilitate spatial organization in squid skin Bragg lamellae

El estudio demuestra que las proteínas reflectinas de los calamares sufren una separación de fases líquido-líquido que genera condensados multicompartmentales cuya organización espacial interna, regulada por las proporciones y densidades de carga de las diferentes reflectinas, imita y podría explicar la segregación espacial observada in vivo en las láminas de Bragg responsables del camuflaje dinámico.

Gordon, R., Levenson, R., Malady, B., Al Sabeh, Y., Morse, D.2026-03-17⚛️ biophysics

Computational mapping of antibody-receptor energy landscapes to predict membrane internalization

Este estudio demuestra que las simulaciones de dinámica molecular pueden mapear los paisajes energéticos de unión entre anticuerpos y el receptor JAM-A para predecir la internalización celular, revelando que una topología de contacto orientada a la membrana y ciertas interacciones electrostáticas son más determinantes para la endocitosis que la mera afinidad de unión.

Llombart, P., Nieto-Jimenez, C., Pandiella, A., Ocana, A., Rene Espinosa, J.2026-03-17⚛️ biophysics