609 artículos
La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.
En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.
Mediante microscopía de fuerza atómica de alta velocidad, este estudio visualiza en tiempo real cómo la transcriptasa inversa G2L4 y la ADN ligasa catalizan la reparación de roturas de doble cadena mediante unión mediada por microhomología, revelando los mecanismos moleculares de estabilización de intermediarios y sellado de nicks.
Este estudio demuestra que el calcio modula los contactos intramoleculares de largo alcance en la proteína α-sinucleína mutante A53T, relajando su conformación y alterando la estructura de sus fibrilas amiloides, lo que acelera su agregación y ofrece nuevas perspectivas sobre los mecanismos estructurales del Parkinson.
Este estudio presenta un modelo de dinámica molecular de polímeros que demuestra cómo las interacciones entre laminas y su afinidad con la envoltura nuclear determinan la topología de la malla de la lámina nuclear, ofreciendo nuevos conocimientos sobre los mecanismos biofísicos alterados en las laminopatías.
Este estudio revela que el potencial electrostático intrínseco de la ATP sintasa, el cual varía según la especie y puede ser constructivo u opuesto, modula directamente el voltaje efectivo que experimenta el motor Fo, influyendo así en la eficiencia termodinámica de la síntesis de ATP y en la disipación de calor.
Mediante simulaciones con el modelo DNAfold2, este estudio demuestra que el confinamiento espacial actúa como un selector estructural que estabiliza topologías compactas y reduce la flexibilidad conformacional de una unión de tres vías de ADN, redefiniendo fundamentalmente su paisaje de plegado y su estabilidad en entornos celulares densamente empaquetados.
Este estudio revela que los canales de cloruro inhibidores, como AVR-14B y el receptor de glicina humano, actúan como termosensores intrínsecos mediante un mecanismo de activación térmica dependiente de fenestraciones laterales que regula la excitabilidad neuronal, la eficacia de fármacos como el ivermectina y la tolerancia al calor en organismos.
Este estudio presenta las primeras estructuras de criomicroscopía electrónica de la mannosiltransferasa humana TMEM260 en complejos con su donante y aceptores, revelando el mecanismo molecular de la mannosilación O-unida en mamíferos y proporcionando una base estructural para comprender las malformaciones congénitas asociadas a esta enzima.
Este artículo presenta nuevas herramientas en RELION-5.1 para el procesamiento de imágenes de criomicroscopía electrónica de filamentos amiloides, incluyendo un selector automático, un procedimiento de preprocesamiento en tiempo real, una herramienta gráfica de clasificación y una red neuronal de denoising, demostrando su eficacia mediante la identificación de dos nuevos tipos de filamentos en proteínas hIAPP.
Este estudio combina simulaciones a gran escala con análisis de cumulantes de Binder y escalado de tamaño finito para mapear con precisión el régimen crítico de un dominio PLCD, delineando tres regímenes de fase distintos y corrigiendo estimaciones erróneas de la temperatura theta mediante el cálculo directo de los coeficientes de interacción de dos cuerpos.
Este estudio demuestra que los residuos de cisteína son determinantes críticos para la agregación espontánea y la propagación de tau en células, actuando como reguladores químicos centrales tan importantes como los motivos de amiloide.