419 artículos
La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.
En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.
La adhesión de nanopartículas esféricas a membranas puede inducir la formación de tubos mediante un recubrimiento cooperativo que resulta energéticamente favorable debido a la interacción entre las energías de curvatura y adhesión en las regiones de contacto, aunque esta ganancia energética depende críticamente del alcance del potencial de adhesión y puede verse limitada por el radio mínimo de los cuellos de membrana.
Este estudio presenta un motor de ADN bípedo de alto rendimiento y controlado por computadora que utiliza un esquema de combustible y anticombustible para lograr un movimiento bidireccional preciso y programable sobre una pista de origami de ADN con un rendimiento superior al 98% por paso, superando significativamente la eficiencia de los motores moleculares externos anteriores.
El artículo presenta ATLAS, una biblioteca de motivos de ARN 3D basada en grafos que incorpora interacciones no Watson-Crick y pseudonudos, ofreciendo herramientas para la búsqueda, descarga y análisis de similitud estructural de motivos de ARN junto con un modelo mecanicista de evolución del ARN.
Los autores presentan un sistema de templado molecular catalítico libre de enzimas, impulsado por una hebra de combustible, que supera la inhibición por producto para permitir la replicación de información genética en copolímeros de ADN.
Mediante simulaciones de dinámica molecular, este estudio demuestra que el entorno de la membrana regula el pKa funcional de los lípidos ionizables en las nanopartículas lipídicas, estableciendo principios de diseño cuantitativos para optimizar su composición y rendimiento en la entrega de fármacos.
El estudio demuestra que la fluorescencia de la proteína MagLOV2 en bacterias *E. coli* responde a campos magnéticos externos de manera no monótona, un comportamiento que confirma que el efecto se rige por el mecanismo de pares de radicales.
Este estudio demuestra que la señalización ratiométrica permite a las células integrar temporalmente la actividad de los receptores de manera imparcial, lo que suprime el ruido y supera los límites teóricos de detección de gradientes espaciales, mejorando así la precisión direccional en entornos ruidosos.
El artículo presenta HXMS, un formato de archivo estandarizado y legible que preserva el contenido isotópico completo de los datos de intercambio hidrógeno/deuterio (HX-MS), junto con PFLink, una herramienta de Python que facilita la conversión de formatos existentes para mejorar el análisis cuantitativo, el intercambio de datos y el desarrollo de aplicaciones futuras en este campo.
Este estudio revela mediante estructuras de criomicroscopía electrónica que la demetilasa de óxido de trimetilamina de *Paracoccus* es una enzima bifuncional que canaliza el formaldehído inestable desde su sitio catalítico hasta un sitio de unión de tetrahidrofolato distante, optimizando así la eficiencia metabólica y la detoxificación.
Este estudio utiliza criomicroscopía electrónica in-cell para demostrar que los inhibidores de tipo I promueven la formación de filamentos de LRRK2 y su asociación con microtúbulos, mientras que los inhibidores de tipo II no inducen dichas estructuras, revelando así efectos diferenciales en la organización molecular de la proteína.