⚛️ Category

biophysics

302 artículos

La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.

En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.

Molecular dynamics simulations illuminate the role of sequence context in the ELF3-PrD-based temperature sensing mechanism in plants

Este estudio utiliza simulaciones de dinámica molecular para revelar cómo la longitud de un tracto de poliglutamina y el contexto de secuencia modulan la formación de condensados nucleares de la proteína ELF3 en respuesta al calor, un mecanismo clave para la regulación del crecimiento de las plantas que tiene implicaciones para el diseño de proteínas y la mejora de cultivos.

Lindsay, R. J., Sahoo, A., Viegas, R. G., Leite, V. B. P., Wigge, P. A., Hanson, S. M.2026-04-07⚛️ biophysics

A Spin-Glass Metabolic Hamiltonian optimized by Quantum Annealing Reveals Thermodynamic Phases of Cancer Metabolism

Este estudio introduce el modelo Metabolic Spin-Glass, optimizado mediante recocido cuántico, para demostrar que los estados metabólicos del cáncer corresponden a fases termodinámicas distintas y estables, permitiendo una estratificación pronóstica de pacientes basada en principios físicos en lugar de perturbaciones de vías aisladas.

Sung, J.-Y., Baek, K., Park, I., Bang, J., Cheong, J.-H.2026-04-07⚛️ biophysics

Allosteric Mechanisms Underlying Long QT Syndrome Type 2 (LQT2) Associated Mutations in hERG Channels

Este estudio demuestra mediante simulaciones de dinámica molecular que ciertas mutaciones asociadas al síndrome QT largo tipo 2 alteran alostéricamente la estructura del filtro de selectividad del canal hERG, comprometiendo su tráfico celular, y sugiere que mutaciones supresoras de segundo sitio pueden corregir estos defectos estructurales.

Deyawe Kongmeneck, A., San Ramon, G., Delisle, B., Kekenes-Huskey, P.2026-04-07⚛️ biophysics

Label-Free 4D Holotomography with Depth-Adaptive Segmentation for Quantitative Analysis of Lipid Droplet Dynamics in Hepatic Organoids

Este estudio presenta un marco de tomografía holotomográfica sin marcadores con segmentación adaptativa a la profundidad que permite cuantificar longitudinalmente la dinámica de los gotas lipídicas en organoides hepáticos vivos, revelando que el ácido oleico y el linoleico inducen acumulación lipídica mediante mecanismos distintos (aumento de volumen frente a aumento de número) mientras que el ácido palmítico compromete rápidamente la integridad del organoide.

cho, j., lee, h., oh, c., park, j., park, s., koo, b.-k., Park, Y.2026-04-06⚛️ biophysics

Doubling the Field of View in Common-Path Digital Holographic Microscopy via Wavelength Scanning and Polarization Gratings

Este artículo presenta un método de microscopía holográfica digital de camino común que, mediante el escaneo de longitud de onda y el uso de rejillas de polarización, elimina la superposición de réplicas para duplicar el campo de visión y permitir la imagen de muestras densas y dinámicas.

Piekarska, A., Rogalski, M., Stefaniuk, M., Trusiak, M., Zdankowski, P.2026-04-06⚛️ biophysics

Structural principles of transcriptional collisions

Mediante criomicroscopía electrónica, este estudio revela que las colisiones de la ARN polimerasa con obstáculos proteicos o con otras polimerasas convergentes inducen un estado inactivo de retroceso y giro mediado por deformaciones del ADN, proporcionando un marco mecánico para comprender cómo la célula supera estos conflictos transcripcionales.

Watters, J. W., Mueller, A. U., Ju, X., Chuquimarca, S. J., Ye, H. J., Darst, S. A., Alushin, G. M., Liu, S.2026-04-06⚛️ biophysics

Several multiple sequence alignment perturbation methods enhance AlphaFold3 sampling of alternative protein states

Este estudio demuestra que las estrategias de perturbación de alineamientos múltiples de secuencias mejoran significativamente la capacidad de AlphaFold3 para muestrear estados conformacionales alternativos de proteínas, superando a AlphaFold2 y mostrando un rendimiento comparable al modelo BioEmu.

Eriksson Lidbrink, S., Nissen, I., Ahrlind, J. K., Howard, R. J., Lindahl, E.2026-04-03⚛️ biophysics

Frustration Landscapes of Broadly Neutralizing SARS-CoV-2 Spike Antibodies Targeting Conserved Epitopes Reveal Energetic Logic of Escape-Proof and Escape-Prone Mechanisms

Este estudio revela que la neutralización amplia de SARS-CoV-2 por anticuerpos XGI se logra mediante la targeting de núcleos epitópicos mínimamente frustrados y evolutivamente restringidos, mientras que los sitios de escape inmune se localizan en zonas de frustración neutral que permiten la variación sin desestabilizar la proteína, estableciendo así una lógica energética para diseñar terapias dirigidas a núcleos virales invulnerables.

Alshahrani, M., Gatlin, W., Ludwick, M., Turano, L., Foley, B., Verkhivker, G.2026-04-03⚛️ biophysics