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364 artículos

La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.

En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.

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Modeling Reveals How Direct-Acting Antivirals Redirect HBV Capsid Assembly Pathways to Noninfectious Products

Al extender un modelo de Monte Carlo cinético para simular cómo los moduladores de ensamblaje de cápsides (CAM) se unen preferentemente a interfaces específicas de subunidades, este estudio esclarece los mecanismos termodinámicos y cinéticos mediante los cuales estos antivirales redirigen el ensamblaje de cápsides del virus de la hepatitis B hacia estructuras malformadas no infecciosas, avanzando así en el desarrollo de tratamientos para la VHB y de estrategias más amplias de autoensamblaje.

Frechette, L. B., Pradhan, S., Mohajerani, F., Perez-Segura, C., Hadden-Perilla, J. A., Zlotnick, A., Hagan, M. F.2026-05-26
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Nanometer-scale RNA protein clusters (RPCs) Foster Helicase Activity of DEAD-box eIF4A

Este estudio revela que la helicasa de iniciación de la traducción eIF4A forma clusters de ARN-proteína a escala nanométrica (RPCs) impulsados por las interacciones multivalentes de su cofactor eIF4B, un mecanismo esencial para coordinar la actividad helicasa dependiente de ATP y regular la iniciación de la traducción.

Shweta, H., Sokabe, M., Villa, N., Fraser, C. S., Goldman, Y. E.2026-05-25
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A unified ensemble-allosteric framework reconciles gain- and loss-of-function disease mutations in the IP3 receptor

Este estudio establece un marco unificado de alosterismo en conjunto que demuestra que las mutaciones patogénicas en el receptor de IP3 causan enfermedad no al alterar la estructura global de la proteína, sino al modificar las probabilidades del conjunto conformacional y el flujo de información alostérica para producir fenotipos de ganancia o pérdida de función.

Zhu, Y., Rahman, T.2026-05-24
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Overcoming Preferred Orientation in Cryo-EM With Ultrasonic Excitation During Vitrification

Este artículo demuestra que aplicar continuamente excitación ultrasónica durante la vitrificación supera eficazmente la orientación preferente de las partículas en criomicroscopía electrónica al interrumpir mecánicamente la adsorción de proteínas en la interfaz aire-agua, ofreciendo una solución sencilla y ampliamente aplicable a un desafío común de imagen.

Williams, H. M., Curtis, W. A., Haubner, M., Hruby, J., Drabbels, M., Lorenz, U. J.2026-05-21
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Energetic gradients emerge in developing motor-microtubule structures

Este estudio demuestra que el ensamblaje de estructuras estelares ordenadas a partir de mezclas desordenadas de microtúbulos y motores de cinesina genera gradientes reproducibles y duraderos de ATP y densidad de motores radiales, revelando que mantener estos gradientes espaciales de motores es la demanda energética dominante en tales sistemas del citoesqueleto fuera del equilibrio.

Duarte, A. I., Salmon, G. L., Lee, H. J., Najma, B., Ashok, M., Hirokawa, S., Postma, H. W. C., Banks, R. A., Thomson, M (…)2026-05-20
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Mechanochemical Decoupling of ATP Hydrolysis and RNA Translocation in SARS-CoV-2 nsp13 by the L405D Mutation

Este estudio revela que la mutación L405D en la nsp13 del SARS-CoV-2 desacopla la hidrólisis de ATP de la translocación de ARN al remodelar el paisaje conformacional de la proteína para eliminar las transiciones estructurales inducidas por la inducción, atrapando así a la enzima en estados no productivos y perjudicando su ciclo catalítico.

Fazelpour, E., Roy, P., Frederick, K., McCullagh, M.2026-05-20
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AlphaFold3 predicted LWO G-protein complex from European robin features active-state biased Gα

Este estudio evalúa dos modelos generados por AlphaFold3 del complejo de la proteína G LWO del petirrojo europeo, revelando que, si bien una predicción del complejo completo exhibe un fuerte sesgo intrínseco hacia el estado activo que puede limitar su interpretabilidad para los mecanismos de señalización, un ensamblaje guiado por plantillas ofrece un marco estructural más neutral para investigar la magnetorrecepción aviar.

Hungerland, J., Kostritski, A., Koch, K.-W., Solov'yov, I.2026-05-20
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Stretching mucins: revealing the complex rheology of a natural gly coprotein network

Mediante un reómetro personalizado de goteo sobre sustrato, este estudio revela que las soluciones de mucina exhiben una transición dependiente de la concentración en el flujo extensional, pasando de un adelgazamiento lineal a bajas concentraciones a un adelgazamiento elastocapilar en regímenes semidiluidos, antes de experimentar una reducción repentina en la extensibilidad y el tiempo de relajación a concentraciones más altas debido a asociaciones intercadena.

Hazt, B., Degen, G. D., Warwaruk, L., Read, D. J., OConnell, A., Harlen, O. G., McLinley, G. H., Sarkar, A.2026-05-19
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NMR Spectroscopy for the Validation of AlphaFold2 Structures

Este artículo presenta un enfoque híbrido novedoso que valida las estructuras de proteínas predichas por AlphaFold2 frente a espectros NOESY de RMN mediante heurísticas de contactos interresiduales y una máquina de vectores de soporte, demostrando su eficacia en la identificación de predicciones inexactas y en la resolución de estructuras de proteínas previamente sin resolver, como LoTOP.

Sachleben, J. R., Williams, J. L., Gagnon, I. A.2026-05-18