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GradeBins es un marco de software de código abierto que estandariza y mejora el control de calidad de los conjuntos de gérmenes metagenómicos mediante dos modos de ejecución (inferencia y verdad fundamental), ofreciendo métricas comparables y diagnósticos detallados para bacterias, arqueas y eucariotas con un bajo costo computacional.
Este estudio demuestra que la diferenciación de macrófagos humanos mediante M-CSF induce un estado antiviral que restringe la replicación del virus Chikungunya y promueve una respuesta de citoquinas más robusta, mientras que la diferenciación mediada por GM-CSF favorece una alta susceptibilidad y replicación viral, destacando el papel crucial del tipo de diferenciación en la patogénesis de la infección.
Este estudio describe *Thalassoporum longitrichum* sp. nov., una nueva cianobacteria marina epizoica con potencial antiinflamatorio y sin toxicidad, y propone la sinonimización del género *Limnothrix* en *Pseudanabaena* basándose en un análisis taxonómico polifásico.
Este estudio demuestra que la remodelación de la actina dependiente del complejo Arp2/3 es esencial para la eficiencia de la descapsidación del virus respiratorio sincitial (RSV) en células A549, un proceso que afecta la expresión viral y la respuesta inmune sin alterar la unión inicial del virus a la célula.
Este trabajo presenta la plataforma DropletFactory CORE, un sistema de citometría y clasificación de gotas de bajo costo diseñado para facilitar el cribado de alto rendimiento de células de levadura en biotecnología.
Este estudio demuestra que las partículas similares a virus (VLP) de SARS-CoV-2 beta mantienen su integridad estructural e inmunogenicidad durante el almacenamiento a 4 °C y -80 °C, especialmente cuando se utilizan excipientes estabilizadores como polisorbato 80, sorbitol o L-histidina.
Este estudio presenta un marco computacional basado en redes neuronales simpliciales dirigidas con geometría diferencial que integra datos genómicos y de Cell Painting para predecir de manera rápida e interpretable la resistencia antimicrobiana en aislados clínicos, identificando motivos genómicos específicos y sus asociaciones con rasgos morfológicos celulares.
Este estudio demuestra que el metabolismo de ácidos biliares secundarios por ciertas cepas de Clostridia atenúa la enfermedad mediada por toxinas de *C. difficile* in vivo de manera independiente a la resistencia a la colonización por competencia de nutrientes, sugiriendo que la atenuación de la virulencia es una estrategia clave para nuevas terapias.
Este estudio demuestra mediante metagenómica que, aunque la inducción de profagos no es un fenómeno generalizado en el microbioma humano tras la exposición a antibióticos, la ciprofloxacina sí provoca un aumento específico en las proporciones de profagos respecto a sus huéspedes bacterianos en ciertas especies.
El estudio demuestra que el hipofosfito, un compuesto inorgánico seguro y de origen natural, actúa como un inhibidor selectivo y eficaz de la metanogénesis sintrófica al interferir con el metabolismo del formiato, ofreciendo así una estrategia prometedora y económica para el control de las emisiones de metano en ecosistemas industriales y naturales.
Este estudio revela que la bacteria *Clostridium asparagiforme* metaboliza el metotrexato para producir DAMPA, una molécula que activa la señalización de STAT3 mitocondrial en las células epiteliales intestinales, preservando la integridad mitocondrial y aliviando la inflamación en la enfermedad inflamatoria intestinal.
El estudio demuestra que los metabolitos de *Photorhabdus* modifican las comunidades microbianas del suelo, lo que promueve el crecimiento de las plantas y activa respuestas sistémicas que aumentan su resistencia contra plagas de insectos.
Este estudio revela que *Toxoplasma gondii* activa la vía no canónica de NF-κB mediante una estrategia distribuida en la que ocho efectores dependientes de MYR1 actúan de forma cooperativa y aditiva para degradar TRAF3 y estabilizar NIK, superando así la robustez de la respuesta transcripcional del huésped.
Este estudio identifica y caracteriza a RcrB, una proteína de membrana interna previamente desconocida que confiere a la *Escherichia coli* uropatógena una alta resistencia a las especies reactivas de cloro mediante un mecanismo activo de desintoxicación química que requiere glutatión y protege a la bacteria de las defensas inmunitarias del huésped.
Este estudio demuestra que la bacteria *Corynebacterium mastitidis* requiere la proteína Sortasa F para anclar sus adhesinas, formar biopelículas y colonizar el ojo, lo cual es esencial para inducir una respuesta inmunitaria protectora específica.
Este estudio demuestra que la división celular ortogonal en *Staphylococcus aureus*, mediada por el factor PcdA, es esencial para organizar los factores de virulencia en la superficie bacteriana y facilitar la formación de comunidades de abscesos estafilocócicos encapsuladas en fibrina que protegen a la bacteria del sistema inmune.
Este estudio demuestra que la microgravedad simulada tiene un impacto mínimo en los requisitos génicos del simbionte bacteriano *Vibrio fischeri*, ya que se identificaron muy pocos genes esenciales específicos de esta condición en comparación con la gravedad normal.
Los investigadores descubrieron una vía de entrada rápida y dependiente de calcio en las células huésped para *Staphylococcus aureus* que, a diferencia de las vías de internalización lentas, altera la maduración fagosomal, facilita la translocación bacteriana al citosol y determina resultados distintos en la replicación bacteriana y la muerte celular.
Un estudio sobre el río Musi en Hyderabad, India, revela mediante modelado hidráulico que las aguas residuales sin tratar, y no los desechos farmacéuticos, son la principal fuente de resistencia antimicrobiana en este río urbano, lo que subraya la necesidad urgente de mejorar la gestión de aguas residuales.
Este estudio demuestra que en *Escherichia coli*, la ausencia de la proteína SanA altera el equilibrio de la síntesis de peptidoglicano septal debido a un exceso de disponibilidad de lípido II, lo que compromete la integridad de la membrana externa y aumenta la permeabilidad celular.