Geometric early warning indicator from stochastic separatrix structure in a random two-state ecosystem model

Este artículo propone un indicador geométrico basado en la estructura de la separatrix estocástica para predecir el inicio de floraciones de fitoplancton en el Ártico, superando las limitaciones de las señales de alerta temprana convencionales en sistemas ruidosos con registros observacionales limitados.

Yuzhu Shi, Larissa Serdukova, Yayun Zheng, Sergei Petrovskii, Valerio LucariniWed, 11 Ma🔢 math

The Black Death Anomaly: A Non-Abelian Field Theory of Epidemiological Safe Zones

Este artículo propone una teoría de campo gauge no abeliana que, al modelar la dinámica del patógeno como un transporte covariante acoplado a la mutación, demuestra que las zonas de seguridad geográfica durante la Peste Negra, como Polonia y Bohemia, son vacíos topológicos matemáticamente necesarios resultantes de la interferencia destructiva de ondas de mutación viajeras.

Jose de Jesus Bernal-Alvarado, David DelepineWed, 11 Ma🧬 q-bio

Toda-like Hamiltonian as a probe for quantized prey-predator dynamics

Este artículo presenta un marco teórico predictivo que utiliza un Hamiltoniano tipo Toda para analizar las dinámicas depredador-presa cuantizadas mediante corrientes de Wigner, demostrando que, además de la estabilidad clásica de los modelos Lotka-Volterra, estos sistemas competitivos microscópicos exhiben una estabilidad cuántica robusta con correcciones analíticas no perturbativas.

Alex E. Bernardini, Orfeu BertolamiWed, 11 Ma⚛️ quant-ph

Controllable Sequence Editing for Biological and Clinical Trajectories

El modelo CLEF introduce un método de edición de secuencias que permite modificar de forma controlada y específica el momento y las variables afectadas en trayectorias biológicas y clínicas, superando significativamente a los métodos existentes en precisión y capacidad de generación de contrafactuales.

Michelle M. Li, Kevin Li, Yasha Ektefaie, Ying Jin, Yepeng Huang, Shvat Messica, Tianxi Cai, Marinka ZitnikTue, 10 Ma🤖 cs.LG

A Class of Unrooted Phylogenetic Networks Inspired by the Properties of Rooted Tree-Child Networks

Este artículo propone las nuevas clases de redes qq-cortables como una alternativa computacionalmente útil y reconocible en tiempo polinómico a las redes orientables a árbol-hijo, demostrando que permiten resolver eficientemente problemas como la contención de árboles que son intratables en otras clases de redes filogenéticas no enraizadas.

Leo van Iersel, Mark Jones, Simone Linz, Norbert ZehTue, 10 Ma🔢 math

Modeling the spillover risk of highly pathogenic avian influenza from wild birds to cattle in Denmark: A data-driven risk assessment framework

Este estudio presenta un marco de evaluación de riesgos basado en datos que, al calibrarse con brotes en EE. UU., estima la probabilidad semanal de transmisión de la influenza aviar altamente patógena de aves silvestres al ganado bovino en Dinamarca, identificando periodos y zonas costeras de mayor riesgo para fortalecer la vigilancia y la preparación.

You Chang, Jose L. Gonzales, Erik Rattenborg, Mart C. M. de Jong, Beate ConradyThu, 12 Ma🧬 q-bio

SDSR: A Spectral Divide-and-Conquer Approach for Species Tree Reconstruction

El artículo presenta SDSR, un método escalable basado en la teoría espectral de grafos que utiliza un enfoque de dividir y conquistar para reconstruir árboles filogenéticos de especies, logrando una reducción significativa en el tiempo de ejecución sin comprometer la precisión en comparación con los métodos tradicionales aplicados a datos completos.

Ortal Reshef (Hebrew University of Jerusalem), Ofer Glassman (Weizmann Institute of Science), Or Zuk (Hebrew University of Jerusalem), Yariv Aizenbud (Tel Aviv University), Boaz Nadler (Weizmann Institute of Science), Ariel Jaffe (Hebrew University of Jerusalem)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Macroscopic Dominance from Microscopic Extremes: Symmetry Breaking in Spatial Competition

Este modelo estocástico demuestra que, aunque la ruptura de simetría inicial en la competencia espacial por recursos depende de las estadísticas de valores extremos de los tiempos de primer paso, la dominancia macroscópica estable requiere necesariamente una interacción no recíproca para suprimir las fluctuaciones locales y alcanzar un estado absorbente.

Stuti Guha, Shawn D. Ryan, Bhargav R. KaramchedThu, 12 Ma🧬 q-bio

Conditionally Site-Independent Neural Evolution of Antibody Sequences

El artículo presenta CoSiNE, un modelo que combina cadenas de Markov de tiempo continuo con redes neuronales para capturar las interacciones epistáticas en la evolución de anticuerpos, superando a los modelos de lenguaje actuales en la predicción de efectos de variantes y permitiendo la optimización dirigida de la afinidad de unión mediante un esquema de muestreo guiado.

Stephen Zhewen Lu, Aakarsh Vermani, Kohei Sanno, Jiarui Lu, Frederick A Matsen, Milind Jagota, Yun S. SongMon, 09 Ma🤖 cs.LG

Can deleterious mutations surf deterministic population waves? A functional law of large numbers for a spatial model of Muller's ratchet

Este artículo demuestra que, bajo una escala apropiada, el modelo espacial de la ruleta de Muller converge a un sistema de ecuaciones diferenciales parciales que permite determinar rigurosamente la velocidad de propagación de la población y confirmar que las mutaciones deletéreas pueden surfear las ondas poblacionales.

João Luiz de Oliveira Madeira, Marcel Ortgiese, Sarah PeningtonMon, 09 Ma🔢 math

Extracting useful information about reversible evolutionary processes from irreversible evolutionary accumulation models

El estudio demuestra que, aunque los modelos de acumulación evolutiva asumen la irreversibilidad de las características, pueden proporcionar información fiable sobre el orden relativo de adquisición y la estructura dinámica de las vías evolutivas reales reversibles, a pesar de presentar errores en la estimación de interacciones e incertidumbre.

Iain G. JohnstonFri, 13 Ma🧬 q-bio

A mean-field theory for heterogeneous random growth with redistribution

Este estudio de teoría de campo medio analiza la competencia entre el crecimiento multiplicativo aleatorio y la redistribución en sistemas grandes, revelando que una migración fuerte evita la localización extrema en tasas de crecimiento estáticas, mientras que el ruido temporal introduce una fase parcialmente localizada que mitiga pero no elimina la concentración, con implicaciones para el crecimiento poblacional y la desigualdad de riqueza.

Maximilien Bernard, Jean-Philippe Bouchaud, Pierre Le Doussal2026-03-11💰 q-fin

A hybrid discrete-continuum modelling approach for the interactions of the immune system with oncolytic viral infections

Este trabajo presenta un modelo híbrido discreto-continuo que integra dinámica estocástica de agentes y ecuaciones diferenciales parciales para analizar la interacción entre el sistema inmunitario y los virus oncolíticos, revelando que una respuesta inmune excesivamente rápida puede reducir la eficacia de la terapia y subrayando la necesidad de modularla clínicamente según las características del tumor y del paciente.

David Morselli, Marcello E. Delitala, Adrianne L. Jenner + 1 more2026-03-10🧬 q-bio