🧬 biology

Proteomic profiling of formalin-fixed paraffin-embedded specimens reveals candidate intraoperative diagnostic biomarkers for Hirschsprung disease

Este estudio utilizó el perfilado proteómico de tejidos fijados en parafina embebidos para identificar cuatro nuevos biomarcadores candidatos (CTNNA2, EPDR1, NACAD y NCAM2) que se expresan específicamente en las regiones ganglionares, ofreciendo herramientas prometedoras para el diagnóstico intraoperatorio de la enfermedad de Hirschsprung.

Shigemitsu Kojima, Ayako Yamazaki, Masahito Yoshihara, Ryo Konno, Kenichiro Konishi, Shinya Takazawa, Akira Nishi, Jun F (…)2026-08-31
🧬 biology

Somatic PIK3CA Mutation Status and Gene Expression in Cervical Cancer: A TCGA-CESC Reanalysis

Este reanálisis de TCGA-CESC revela que las mutaciones somáticas de PIK3CA en el cáncer cervical están asociadas con una firma transcripcional amplia enriquecida para las vías de la matriz extracelular y la adhesión focal en lugar de la señalización canónica de PI3K-AKT, al tiempo que destaca un enriquecimiento no resuelto en los procesos ciliares y flagelares.

Emmanuel Frimpong2026-08-31
🧬 biology

Context-aware LLM extraction and controlled-vocabulary normalization of GEO transcriptomic sample metadata

Este artículo presenta un flujo de trabajo de modelo de lenguaje de gran tamaño desplegable localmente que extrae y normaliza metadatos transcriptómicos de GEO no estructurados en etiquetas de vocabulario controlado y estructuradas para tejido, condición y tratamiento, logrando una alta precisión y superando significativamente a los métodos de coincidencia deterministas.

Mateusz Szczepaniak, Jonathan Wren2026-08-31
🧬 biology

Associations between bacteriome and chemical pollutants in indoor dust from Czech households

Este estudio analiza el polvo de interiores de 88 hogares checos para revelar asociaciones significativas entre géneros bacterianos específicos, tales como *Methylobacterium-Methylorubrum* y *Sphingomonas*, y diversos contaminantes químicos como los PAHs y los PBDEs, sugiriendo que las interacciones entre contaminantes biológicos y químicos pueden alterar los riesgos para la salud en interiores a pesar de la necesidad de más investigación mecánica para establecer la causalidad.

Klvanova Eva, Jan Böhm, Paula Marcinekova, Lisa Melymuk, Petr Kukacka, Petr Senk, Jakub Martinik, Petra Pribylova, Simon (…)2026-08-31
🧬 biology

Comprehensive Comparative Evaluation and Consensus Strategy for CRISPR/Cas9 gRNA Design Targeting the TaDREB1 Gene in Bread Wheat (Triticum aestivum)

Este estudio establece una estrategia de consenso robusta para el diseño de gRNA de CRISPR/Cas9 en trigo pan mediante la comparación de cinco herramientas de predicción dirigidas al gen TaDREB1 para identificar una secuencia guía altamente confiable y resaltar las limitaciones críticas en los resultados algorítmicos actuales.

Tarek Osama Mohamed Amin, Ghufran Siddiq2026-08-31
🧬 biology

A Computationally De-Risked CD47 Inhibitor for Glioblastoma

Este estudio presenta un proceso de descubrimiento de fármacos impulsado computacionalmente que identificó e ingenierizó una nueva proteína de cefalópodo no secretada por Fc, AOA_UR2_F7P_M16C, como un inhibidor de CD47 potente y desinmunizado con alto potencial para tratar el glioblastoma, evitando al mismo tiempo la toxicidad hematológica y la inmunogenicidad de las terapias de anticuerpos previas.

Timothy Payton2026-08-31
🧬 biology

Study on the mechanism of type 2 diabetes mellitus on tendon repair based on bioinformatics analysis combined with machine learning models

Este estudio integra la aleatorización mendeliana, la bioinformática y el aprendizaje automático para establecer un vínculo causal entre la diabetes tipo 2 y el deterioro de la reparación tendinosa, identificando a MYL2, MYL3 y TTN como genes centrales clave que probablemente interrumpen la cicatrización mediante la disfunción del citoesqueleto y alteraciones inmunitarias mediadas por macrófagos.

Shulong Sun, Hua Li, Guanghui Li, Yan Li, Liubing Yang, Yujing Cao, Ji Li2026-08-31
🧬 biology

3D µEFPocket for Multimodal Communications with Brain Organoids

Este artículo presenta el µEFPocket, una biointerfaz microfluídica conformable y ultrafina fabricada a partir de parileno C que permite la estimulación química y eléctrica espaciotemporal de alta resolución junto con el registro óptico y eléctrico en organoides cerebrales humanos, superando así los desafíos de la complejidad 3D para facilitar ensayos funcionales multimodales y estudios de bucle cerrado.

Yihang Wang, Miguel Cuevas, Zhihan Zhang, Gooyoon Chung, Jingze Zhang, Yilan Yin, Qianzhi Luo, Will Lipman, Josh Henders (…)2026-08-31
🧬 biology

Exploration of Evolutionary Dynamics and Genomic Architecture in Acinetobacter baumannii

Este estudio integra análisis de pangenoma, filogenómicos y de composición para revelar que el linaje ST2 de *Acinetobacter baumannii*, dominante a nivel mundial, depende de una arquitectura de genoma abierto donde los genes de resistencia antimicrobiana adquiridos horizontalmente se mantienen de manera estable dentro de islas genómicas, lo que subraya la necesidad crítica de una vigilancia genómica integral a través de cromosomas, plásmidos y fagos para combatir la resistencia a los carbapenémicos.

Rhythm Sharma, Dinesh Lakhanpal2026-08-31