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🧬 biology

Long-read RNA-seq resolves isoform-level and context-specific regulatory architecture of complex traits in cattle

Este estudio aprovecha datos de RNA-seq de lectura larga a escala poblacional y multiómica de 432 vacas lecheras para construir un atlas transcripcional bovino exhaustivo, revelando miles de isoformas novedosas y variantes regulatorias específicas de contexto que mejoran significativamente la resolución de la genética de rasgos complejos y cierran la brecha de la "regulación faltante" dejada por los métodos tradicionales de lectura corta.

Lingzhao Fang, Weijie Zheng, Qi Zhang, Jinfeng He, Xiaoning Zhu, Mian Gong, Houcheng Li, Lin Liu, Jianbin Li, Zhu Ma, Bo (…)2026-08-31
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Valorization of Shrimp Shell Waste: Crude Protease-Assisted Astaxanthin Extraction Using Bacillus cereus XT-1 and Functional Gene Analysis

Este estudio demuestra que *Bacillus cereus* XT-1, el cual regula al alza el gen *nprC* para producir una proteasa neutra clave de 35 kDa, sirve como un agente biológico eficiente y ecológico para la extracción de astaxantina de alto rendimiento y estable a partir de desechos de cáscaras de camarón con una actividad antioxidante mejorada.

Xiaoxi Zeng, Lan Yu, Cheng Zhang, Keting Lei, Xuan Li, Yongjian Shao, Lingzhi Chen, Yang Fang, Jie Liu, Liang Ma2026-08-30
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Symbiodiniaceae shifts in the corals Acropora cf. solitaryensis and A. aff. divaricata at the climate-driven poleward margin

Este estudio demuestra que, si bien las poblaciones en expansión de *Acropora cf. solitaryensis* y *A. aff. divaricata* en su margen hacia el polo impulsado por el clima mantienen una alta diversidad genética del huésped y conectividad, exhiben ensamblajes de Symbiodiniaceae distintos caracterizados por un cambio de simbiontes de la radiación C3 a la radiación C1, probablemente impulsado por temperaturas de agua de mar más bajas.

Nina Yasuda, Akifumi Shimura, Masumi Kamata, Hiroki Taninaka, Kenji Takata, Takashi Nakamura, Akira Iguchi, Takehisa Yam (…)2026-08-30
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Sexual evolution in plants: genetic network co-option and reproductive innovation

Esta revisión propone un marco evolutivo integrador que demuestra cómo la reproducción sexual de las plantas, originada en las algas verdes ancestrales hace más de mil millones de años, se diversificó a través de los linajes terrestres mediante la cooptación, duplicación y reconfiguración iterativa de módulos genéticos conservados, tales como los factores de transcripción MADS-box y los sistemas hormonales.

Vladimir Brukhin2026-08-30
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A Two-step Feature Selection Framework for Computationally Efficient Machine Learning on Genome-wide SNP Data

Este artículo propone un marco de selección de características de dos etapas que combina el filtrado rígido basado en la varianza con XGBoost para reducir 61 millones de SNPs a un subconjunto computacionalmente tratable, permitiendo la predicción eficiente del origen geográfico mediante aprendizaje automático en conjuntos de datos genómicos a gran escala sin requisitos de recursos prohibitivos.

Jinhyun Kim, Seungjun Lee, Daewon Lee, Seo Woo Song, Cheolheon Park, Huiran Yeom2026-08-30
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Type IV Collagen-Enriched 3D Extracellular Matrix Niche Enhances Proliferation and Preserves Phenotype in Primary Mouse Hepatocytes

Este estudio demuestra que un nicho de matriz extracelular 3D enriquecido con colágeno tipo IV preserva eficazmente el fenotipo maduro y la proliferación estable de hepatocitos primarios de ratón durante periodos de cultivo prolongados, al tiempo que previene la metaplasia biliar típicamente inducida por sustratos convencionales como Matrigel.

Yusuke Murasawa2026-08-29
🧬 biology

Preclinical evaluation of a novel multiplex ddPCR assay for detecting tetracycline resistance and differentiating Ureaplasma species

Este estudio desarrolló y validó un ensayo de ddPCR múltiple altamente sensible, específico y reproducible capaz de cuantificar simultáneamente los genes de resistencia a la tetraciclina (tetM e int-Tn) y diferenciar entre Ureaplasma urealyticum y Ureaplasma parvum para guiar estrategias de tratamiento clínico óptimas.

Lihong Zhao, Yuanyuan Jiang, Yulong Zong, Ruiying Li, Hui Zhang, Jin Wang, Zhe Li2026-08-29
🧬 biology

Locus-resolved reconstruction of the pig UGT family reveals an isoform-collapse artifact in frozen ESM-2 retrieval

Este estudio reconstruye la familia de genes UGT del cerdo para revelar que, si bien los embeddings ESM-2 congelados mejoran la clasificación de isoformas proteicas específicas, no superan a los métodos tradicionales de búsqueda de secuencias en la recuperación de genes adicionales una vez que la evaluación se estandariza al nivel del locus, exponiendo así un artefacto de resolución de isoformas en la evaluación comparativa previa.

Xiaotong Zhao¹, Hua Chang², Zhuoyu Zhao¹, Xun Xiang¹2026-08-29
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Balancing Protein Expression and Minicell Yield in E. coliNissle 1917 via RBS Engineering

Este estudio demuestra que la ingeniería de la fuerza del sitio de unión al ribosoma (RBS) en minicélulas de *E. coli* Nissle 1917 permite el equilibrio preciso entre los niveles de expresión de proteínas recombinantes y el rendimiento de las minicélulas, revelando que, si bien una mayor expresión reduce la producción debido a la carga metabólica, las minicélulas proporcionan un entorno superior para mantener la solubilidad de las proteínas.

Yao Ruan, Honglei Xie, Yan Niu, Tian Liu, Xi Shen, Mingxia Zhang, Shengping Lei, Jun Yu2026-08-29