📄 other

Communication-space representation of multicellular tissue organization

El artículo presenta CommuSpace, un marco computacional que redefine la organización del tejido multicelular al mapear las células en un espacio de comunicación basado en las interacciones ligando-receptor, revelando así "ecosistemas de comunicación" emergentes como una capa fundamental de orden superior de la arquitectura tisular que trasciende las clasificaciones tradicionales de identidad celular y nicho espacial.

Hui-Sheng Li, Pai Peng, Yu-Ting Tan, Jia-Juan Tu, Xiao-Fei Zhang, Shou-Feng Shen, Luonan Chen2026-07-24
📄 other

Plant architecture reveals contrasting developmental strategies in two threatened West African timber species (Khaya senegalensisand Pterocarpus erinaceus): implications for conservation and sustainable forest management

Este estudio proporciona la primera caracterización arquitectónica integral de las especies de madera amenazadas de África Occidental, *Khaya senegalensis* y *Pterocarpus erinaceus*, revelando sus distintos modelos de desarrollo y respuestas plásticas a los gradientes ambientales para establecer una base científica para optimizar su conservación, reforestación y gestión sostenible.

Beda Innocent ADJI, Doffou Sélastique Akaffou, Kouadio Henri Kouassi, Marc Jaeger, Sylvie Annabel Sabatier, Jérôme Dumin (…)2026-07-24
📄 other

EEG-to-Report: An Annotation and Feature–Text Framework for Training Language Models on Clinical EEG

El artículo presenta EEG-to-Report, un marco de trabajo basado en el navegador que agiliza la anotación clínica de EEG mediante la integración de la ingesta de datos de múltiples formatos, la visualización interactiva y la extracción automatizada de características para generar pares de características-texto estructurados para el entrenamiento de modelos de lenguaje multimodales y la redacción de informes clínicos automatizados.

The Tran2026-07-24
📄 other

A Consensus Multifeature Deviation Index for Specific Detection of Locomotor Perturbation From Individualized-Baseline Wearable Inertial Signals

Este artículo introduce la Carga de Perturbación de la Marcha (GPB, por sus siglas en inglés), un índice de múltiples características por consenso y no supervisado que aprovecha las líneas base inerciales individualizadas de dispositivos vestibles para detectar específicamente perturbaciones locomotoras con una reducción significativa de falsos positivos durante la marcha normal en comparación con los métodos de una sola característica o de solo amplitud.

Alex Kubiak, Farzad Haji Boloori, Jared Nichols2026-07-24
📄 other

Phylogeny-associated codon evolution and conditional boundary dinucleotide structure in Platycerium plastomes

Este estudio demuestra que el uso de codones sinónimos en los plastomas de *Platycerium* conserva señales filogenéticas a través de linajes geográficos, al tiempo que revela un déficit conservado y evolutivamente significativo de dinucleótidos CpG en los límites de los codones que persiste a pesar de controles estrictos de composición de secuencias y conteos de codones.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-07-24
📄 other

Human Precursor microRNA Terminal Loop Regions Exhibit Distinct Sequence Characteristics and Motif Enrichment

Este estudio proporciona la primera caracterización exhaustiva de las regiones del bucle terminal de los pre-miRNA humanos, revelando arquitecturas de secuencia distintivas definidas por distribuciones de longitud específicas, sesgos nucleotídicos posicionales y motivos enriquecidos que pueden influir en la biogénesis de los miRNA y en las interacciones proteicas.

Amit Cohen, Mario Alberto Burgos-Aceves, Yoav Smith2026-07-24✓ Author reviewed ⓘ
📄 other

Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

Este estudio empírico demuestra que los embeddings de genes preentrenados del modelo scGPT codifican inherentemente estructuras físicas de interacción proteína-proteína, como lo evidencia una similitud de coseno significativamente mayor entre pares de genes que interactúan en comparación con controles no interactuantes emparejados a través de múltiples bases de datos.

Liu Chen2026-07-24
📄 other

Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

Este artículo demuestra empíricamente que el espacio de incrustación estática de genes y tokens del modelo fundacional scGPT codifica información detectable, aunque moderada, sobre interacciones proteína-proteína conocidas, como lo evidencia la similitud de coseno y las métricas de predicción de interacción significativamente más altas para pares de genes que interactúan en comparación con los controles que no interactúan.

Liu Chen2026-07-24