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🧬 biology

Static DNA-Methylation Burden Discriminates Hematologic-Malignancy Subtypes but Does Not License Per-Patient Trajectory Inference: A Public-Cohort Analysis and an Identifiability Framework

Este estudio demuestra que, si bien la carga y la entropía de la metilación del ADN estática pueden clasificar eficazmente los subtipos de neoplasias hematológicas y distinguirlos de los donantes sanos utilizando datos de cohortes públicas, tales medidas transversales son insuficientes para inferir las trayectorias individuales de la enfermedad, lo que requiere un muestreo prospectivo seriado para validar la estimación del tiempo de antelación.

Frederic Scheer2026-07-23
🧬 biology

Rapid bee inventories for monitoring changes in Cerrado assemblages: Complementary traps for multiple taxa and trait groups

Este estudio demuestra que la combinación de copas azules, botellas de aroma y trampas Malaise proporciona un marco integral y rentable para el inventario y monitoreo rápido de abejas en el Cerrado brasileño, revelando una alta riqueza de especies y el valor crítico de conservación del Parque Nacional de Brasilia.

José Vinicius, Alexandre S. Barbosa, César N. M. Teixeira, Helena Moriani, Rafael Chagas, Antonio J. C. Aguiar2026-07-23
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Contrasting roles of horizontal transfer and endogenous transposable element dynamics in microsporidian genome evolution

Este estudio revela que la expansión del genoma de los microsporidios es impulsada principalmente por estallidos endógenos de elementos transponibles facilitados por la deriva genética, mientras que la transferencia horizontal de genes de los huéspedes desempeña solo un papel menor y específico de cada taxón.

Anastasia Markelova, Mikhail Rayko, Elena Nassonova2026-07-23
🧬 biology

Cross-species functional analysis of a de novo DCLK1 variant associated with a neurodevelopmental disorder

Este estudio identifica una variante de novo en DCLK1 como el factor causal de un trastorno neurodesarrollador progresivo mediante la integración de genómica funcional transespecie en C. elegans y análisis neuronales derivados de pacientes para demostrar que la mutación induce defectos en las neuritas y neurodegeneración, los cuales pueden ser parcialmente rescatados mediante la expresión de DCLK1 de tipo silvestre o el direccionamiento de la vía.

Stephen Pak, David Butler, Weimin Yuan, hirokazu hashimoto, Hieu Hoang, Jonathan Sheehan, Vanessa Gomez, Jill Rosenfeld (…)2026-07-23
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The Complex Geometry of Biological Knowledge in Artificial Intelligence: Manifolds, Spectra, and Concept Structure in Foundation-Model Representations

Este estudio revela que, si bien los modelos de lenguaje de proteínas codifican información biológicamente significativa que es linealmente decodificable, carecen de las complejas variedades de baja dimensión, las estructuras espectrales multiescala y las geometrías de conceptos jerárquicos presentes en los modelos fundacionales de célula única, representando en su lugar el conocimiento a través de un espacio geométricamente simple y de alta dimensionalidad lineal, moldeado por la naturaleza discreta y dirigida por la homología de los datos de secuencias.

Liu Chen2026-07-23
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Beyond histology: self‑organizing map-derived MASLD transcriptomic subtypes for patient stratification

Este estudio utiliza el análisis de mapas autoorganizados de la transcriptómica hepática a través de diversas cohortes independientes para identificar cinco subtipos de MASLD distintos e independientes de la histología con perfiles moleculares e inmunostromales únicos, ofreciendo un nuevo marco para la estratificación de pacientes y estrategias terapéuticas dirigidas.

Maria Ryaboshapkina, Sophie Gunnarsson, Anna Whatling, Ian Henry, Vian Azzu2026-07-23
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Development of a biomimetic hydrogel cervical spinal cord surrogate for transverse compression across loading rates

Este estudio demuestra que los hidrogeles de doble red de poliacrilamida-alginato ajustables, particularmente aquellos reticulados con CaCl₂, replican con éxito el comportamiento de compresión transversal no lineal y dependiente de la tasa del tejido de la médula espinal cervical, ofreciendo un sustituto biomimético viable para la biomecánica de lesiones y la simulación quirúrgica.

Paria Arjmandisarvestani, Nicholas Cunha, Parham Foroutan, Yue Hui, Ashish Diwan, Ryan David Quarrington2026-07-23
🧬 biology

Caffeine decreases the accuracy of low-level force output during incremental contraction

En un ensayo de crossover, aleatorizado y de doble ciego, que involucró a 13 hombres jóvenes sanos, se encontró que la ingestión aguda de cafeína (6 mg/kg) afectaba significativamente la precisión de la salida de fuerza de bajo nivel durante contracciones incrementales en comparación con un placebo, lo que sugiere que puede comprometer las habilidades que requieren un control de fuerza fino.

Teppei Matsumura, Kosuke Endo, Kento Dora, Takeshi Hashimoto2026-07-23
🧬 biology

Two axes of drug transcriptional response, and a mechanistic correlate that organizes them: a conservation–divergence audit of Tahoe-100M

Este estudio analiza el atlas Tahoe-100M para definir un sistema de coordenadas interpretable para las respuestas a fármacos basado en dos ejes casi independientes —robustez de contexto y emergencia de dosis— e identifica la profundidad transcripcional diana como un correlato mecánico clave que organiza estas respuestas, ofreciendo una auditoría estructural de los mecanismos farmacológicos en lugar de un modelo predictivo.

Huazhang Shen2026-07-23
🧬 biology

Gene-resolved codon evolution and ordered CpG suppression in feline morbillivirus: implications for host adaptation and immune evasion

Este estudio revela que el morbillivirus felino exhibe entornos de codones específicos de cada gen y una supresión generalizada y ordenada de los dinucleótidos CpG a través de su genoma codificante, lo que sugiere un modelo evolutivo multiescala donde la adaptación al huésped y los potenciales mecanismos de evasión inmunitaria moldean conjuntamente la arquitectura viral.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu, Fang Hsu Lin, Han-Chia Chen, Kuan-Chien Yuan (…)2026-07-23