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🧬 biology

Aging reprograms the functional, epigenetic, and metabolic landscape of macrophages

Este estudio revela que el envejecimiento reprograma activamente a los macrófagos mediante cambios coordinados en la epigenética, el metabolismo y la función —caracterizados por una menor capacidad de respuesta de las citocinas, un metabolismo lipídico alterado y cambios específicos de fenotipo— en lugar de simplemente causar un declive funcional, ofreciendo así un nuevo marco para comprender la inflamación asociada a la edad (inflammaging) y las enfermedades relacionadas con el envejecimiento.

Manasa Suresh, Francisco Tapia Belmonte, Bryan T. Weselman, Xintang Li, Marie Durr, Isabella Duchovny, Yanitza Gutierrez (…)2026-06-30
🧬 biology

Multi-state modeling associates proliferation genes with early estrogen receptor-positive breast cancer recurrence and survival

Este estudio utiliza el modelado de estados múltiples para demostrar que la alta expresión basal de genes relacionados con la proliferación está significativamente asociada con la recurrencia temprana y la mortalidad subsiguiente en el cáncer de mama con receptores de estrógeno positivos de alto riesgo, mientras que la recurrencia tardía está vinculada a vías de señalización distintas.

Yongzhe Wang, Christine Quinones, Irene Kang, Hope Rugo, Ernest Martinez, Victoria Seewaldt, Joanne Mortimer, Aritro Nat (…)2026-06-30
🧬 biology

Single-Cell Foundation Models in Biotechnology: A Scoping Review and Bibliometric Analysis of Multimodal AI for Cell-State, Perturbation, and Biomarker Prediction

Esta revisión de alcance y análisis bibliométrico de 1.042 estudios revela que, si bien los modelos fundacionales de célula única se están expandiendo rápidamente en la biotecnología, el campo sufre de una reproducibilidad inconsistente, un rigor de evaluación deficiente y una falta de recursos abiertos, con líneas base simples que a menudo resultan competitivas frente a arquitecturas complejas.

Behin Omidi, Mohammmad Mahdi Hemati Aalm, Arshia Farmahini Farahani, Amir Reza Hassan Poor Barkadehi2026-06-30
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Identification of Differentially Expressed Genes Related to UFMylation Modifications in Periodontitis: Integrated Insights from Transcriptomics and Clinical Experiments

Este estudio integra el análisis transcriptómico, el aprendizaje automático y la validación clínica para identificar a C4A, GANAB y TUBA4A como biomarcadores diagnósticos clave relacionados con la UFMilación para la periodontitis, elucidando sus funciones en las vías inmunitarias y metabólicas y proponiendo posibles dianas terapéuticas.

Changqing Mu, Juan Liu, Kaining Liu, Xiaofeng Huang2026-06-30
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Timing of menstrual cups to prevent transition from optimal to not optimal vaginal microbiome community state type: Results from a 6.5-year prospective observational cohort

En un estudio de cohorte prospectivo de 6.5 años en adolescentes kenianas de secundaria, el uso de la copa menstrual redujo significativamente el riesgo de transicionar de un microbioma vaginal óptimo dominante por *L. crispatus* a un estado no óptimo, lo que sugiere que proporcionar copas antes del debut sexual es crucial para mantener la salud vaginal.

Supriya Mehta2026-06-30
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Ethnicity-Stratified Inflammatory Phenotyping Using GMM Clustering and XGBoost Regression: A Cross-Ethnicity Nearest-Neighbour Framework for Precision CRP Estimation in NHANES 2017–2023

Este estudio utiliza un marco de aprendizaje automático de dos etapas que combina la agrupación GMM y la regresión XGBoost en los datos de NHANES 2017–2023 para revelar que las respuestas de la PCR impulsadas por los macronutrientes varían significamente según el fenotipo metabólico y la etnia, destacando una "Paradoja de Resiliencia de la Fibra" en las poblaciones afroamericanas no hispanas y abogando por un enfoque de nutrición de precisión estratificada.

Anshul Iyer, Vania Sharma2026-06-30
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EEG Signal Variance as a Biomarker for Ictal State Classification: Subject-Level Validation of a Random Forest Classifier using the University of Bonn Dataset

Este estudio demuestra que la varianza de la señal de EEG es un biomarcador robusto para distinguir los estados ictal y valida que un clasificador de Bosque Aleatorio, entrenado con el conjunto de datos de la Universidad de Bonn con una estricta partición de datos a nivel de sujeto para evitar la filtración, logra una alta precisión (96,2 %) y sensibilidad (98,3 %) en la detección de crisis.

Md. Ahasanul Al Hasib Ayon2026-06-30
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Differential Signaling in Adaptive Immunity: Deciphering the Mechanism to Identify the Physical and Evolutionary Bases of Non‑Self

Este artículo propone un marco mecanofísico que identifica el desplazamiento mecánico diferencial como la variable fundamental que permite a los receptores inmunitarios adaptativos discriminar lo propio de lo ajeno mediante la medición de desviaciones abruptas en los campos de fuerza física a resolución de aminoácidos, unificando así el reconocimiento humoral y celular a través de una cascada de decisión progresiva que resuelve paradojas de especificidad inmunitaria largamente persistentes.

Yasir Arafat Maassoom2026-06-30
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Fungal diversity in forest's soil: Moderate-term post-thinning effect of a Mediterranean mature Pinus halepensis forest.

Un estudio de un bosque de *Pinus halepensis* mediterráneo en Israel revela que, si bien el aclaramiento moderado reduce ligeramente la diversidad fúngica total, la eliminación completa de los árboles altera significativamente las características del suelo y desplaza las comunidades fúngicas de especies simbióticas asociadas al pino hacia taxones saprotróficos y patógenos típicos de áreas no forestales.

Segula Masaphy, Noam Levi, Limor Zabari, Ezra Orlofsky2026-06-30
🧬 biology

A multi-omics dataset of the developing zebrafish intestine: longitudinal transcriptomic and microbiome profiles in wild-type and IgZ knockout models

Este estudio presenta un conjunto de datos multiómicos que integra perfiles transcriptómicos y del microbioma longitudinales de peces cebra de tipo silvestre y con inactivación de IgZ para dilucidar el papel del desarrollo de IgZ en la regulación de la inmunidad intestinal y la homeostasis microbiana.

Raktakamol Pharrat, Xuyang Zhao, Zhengben Wu, Congran Bei, Yongyao Yu2026-06-30