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Establishing Lethal and Growth Reduction Doses of Fast Neutron Irradiated Cowpea [Vigna Unguiculata (L.) Walp.]

Cette étude a déterminé les doses de dose létale médiane (DL₅₀) et de réduction de croissance (RC₅₀) de l'irradiation par neutrons rapides pour deux variétés de niébé, révélant que SAMPEA 21 est plus radiosensible que SAMPEA 20T et fournissant des références spécifiques aux génotypes essentiels pour optimiser les protocoles de sélection par mutation.

Ibrahim Ashiru, Umar U. Uwais, Ibrahim Halima, Almustapha Zakari, Abdullahi A. Dabo, Aminu Isyaku2026-07-24
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Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

Cette étude empirique démontre que les plongements de jetons de gènes préentraînés du modèle scGPT encodent intrinsèquement des structures physiques d'interaction protéine-protéine, comme en témoigne la similitude cosinus significativement plus élevée entre les paires de gènes interagissant par rapport aux contrôles non interagissants appariés à travers plusieurs bases de données.

Liu Chen2026-07-24
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Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

Cet article démontre empiriquement que l'espace d'enchâssement statique des gènes-tokens du modèle de fondation scGPT encode des informations détectables, bien que modérées, sur les interactions protéine-protéine physiques connues, comme en témoignent des similitudes cosinus et des métriques de prédiction d'interaction significativement plus élevées pour les paires de gènes interagissant par rapport aux contrôles ne interagissant pas.

Liu Chen2026-07-24
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What Knowledge Can Be Extracted from Single-Cell Data? An Empirical Analysis of Donor-Robust Cell-Type Annotation

Une analyse empirique de données de séquençage d'ARN en cellule unique du pancréas humain démontre que, pour les types cellulaires abondants et canoniques, les modèles d'annotation de types cellulaires se généralisent de manière robuste entre les donneurs avec seulement de légères baisses de performance lorsqu'ils sont évalués via une méthode de type « leave-one-donor-out » par rapport à un fractionnement aléatoire, soulignant la nécessité d'énoncer explicitement la population et le champ technique lors de l'affirmation de connaissances extraites de données de cellule unique.

Liu Chen2026-07-24
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When Do Single-Cell Foundation Models Beat PCA? A Simulation-Based Empirical Analysis of Label Scarcity and Perturbation Generalization

Cette étude basée sur la simulation démontre que les modèles de fondation à cellule unique surpassent de manière significative les pipelines PCA classiques dans les tâches d'annotation à faible disponibilité de labels (1 à 5 cellules étiquetées par classe), mais n'offrent que peu ou pas d'avantage par rapport aux simples bases linéaires lorsque suffisamment de labels sont disponibles ou lors de la prédiction de réponses à de nouvelles perturbations.

Liu Chen2026-07-24
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Rank or Value? An Empirical Analysis of Single-Cell Transformer Tokenization under Sequencing-Depth Loss

Cette étude empirique démontre que, dans le séquençage de l'ARN en cellule unique, le partitionnement par valeurs d'expression fixes surpasse l'encodage par rang de la médiane du corpus pour la classification cellulaire sous perte de profondeur de séquençage, révélant que l'invariance à la multiplication de la taille de la bibliothèque ne garantit pas la robustesse face à la perte stochastique de molécules.

Liu Chen2026-07-24
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Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology

Cette analyse empirique démontre que la restriction des espaces de candidats dans les tests de référence de réseaux de régulation génique déstabilise considérablement le classement des méthodes entre les tissus, indiquant que les choix de définition des candidats peuvent modifier les conclusions comparatives et devraient être rapportés aux côtés des résultats plutôt que d'être traités comme neutres.

Liu Chen2026-07-24
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Bacteria getting wired: The porin-cytochrome complex Om(abc)B kickstarts extracellular electron transfer and nanowire formation

Cette étude révèle que *Geobacter sulfurreducens* utilise une stratégie de transfert d'électrons extracellulaire séquentielle en deux étapes où le complexe porine-cytochrome Om(abc)B permet d'abord la synthèse énergivore de nanofils OmcS, permettant ainsi aux cellules de passer d'un mode sans fil à un mode filaire qui élargit considérablement leur accès au Fe(III) pour la réplication.

Nikhil Malvankar, Joseph Erwin, Kejue Jia, Cong Shen, Vanessa Saldivar, Aldo Salazar Morales, Vasilije Pentalic, Fadel S (…)2026-07-24
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Efficiency of timber harvesting with a harvester in fir stands with designated and undesignated thinning

Cette étude a révélé que, bien que l'exploitation de peuplements de sapins avec une éclaircie non désignée prenne environ 12 % de temps en plus qu'avec une éclaircie désignée en raison de l'extension des déplacements des machines et de la planification des coupes, la charge mentale et les niveaux de concentration de l'opérateur restent comparables dans les deux scénarios.

Grzegorz Szewczyk, Paweł Tylek, Rafał Dyjach, Damian Najman, Tomasz Repak2026-07-24
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WITHDRAWN: Milk Quality and Associated Safety Risk Factors along the Fresh Milk Value Chain in Pastoral Communities of Yabello Town, Borana Zone, Southern Ethiopia

Cet article, qui étudiait à l'origine la qualité du lait et les risques pour la sécurité dans les communautés pastorales de la ville de Yabello, en Éthiopie, a été retiré par les auteurs afin de se conformer aux politiques institutionnelles relatives aux prépublications et ne doit pas être cité.

Hailu Lemma, Tadicha Bute, Lechisa Asefa, Israel Melaku, Assefa Asnakew, Girma Berhanu, Degefa Dhengesu, Habtamu Roba2026-07-24