🧬 Category

q-bio

4124 articles

🧬 biology

Machine learning implementation for host-based infectious disease diagnostics

Cette revue systématique de 21 études (2020–2025) évalue 54 modèles d'apprentissage automatique pour le diagnostic des maladies infectieuses basés sur l'hôte, concluant que bien que les forêts aléatoires et les réseaux de neurones soient les algorithmes les plus courants, aucun modèle unique n'est universellement optimal, et que la future translation clinique nécessite un signalement normalisé, une validation externe et une sélection d'algorithmes sensible au contexte.

Samuel Harrington2026-09-03
🧬 biology

DeepCNet: A multimodal deep learning model for predicting cell type-specific gene expression and promoter-enhancer interactions from single-cell multiome data

DeepCNet est un nouveau cadre d'apprentissage profond multimodal qui exploite les données multiomiques à l'échelle de la cellule unique pour prédire avec précision l'expression génique spécifique au type cellulaire et inférer les interactions promoteur-enhancer régulatrices, permettant ainsi la construction de réseaux de régulation génique des facteurs de transcription et l'identification d'altérations régulatrices spécifiques à certaines conditions dans des maladies comme la maladie d'Alzheimer.

Li Chen, Weijia Jin, Fengdi Zhao, Xin Ma, Qing Lu, Karyn Esser, Ramon Sun2026-09-03
🧬 biology

Language development and pro-inflammatory IL-6/IL-10 imbalance in SARS-CoV-2-exposed pregnancies

Cette étude portant sur les enfants nés pendant la pandémie en Espagne révèle que si l'exposition prénatale au SARS-CoV-2 ne prédit pas uniformément les retards de langage à 18 mois, un déséquilibre pro-inflammatoire IL-6/IL-10 au sein des grossesses exposées est associé à une performance moindre dans des domaines linguistiques spécifiques tels que les verbes difficiles et les vocalisations, particulièrement chez les filles.

Alexandre Díaz-Pons, Sergio Castaño-Castaño, Carlos Martínez Asensi, Víctor Ortiz-García de la Foz, Claudia Parás, Ángel (…)2026-09-03
🧬 biology

Phenotype-informed trio analysis reveals a multi-layered fetal genomic architecture in preterm birth

Cette étude révèle que l'accouchement prématuré implique une architecture génomique fœtale hétérogène et multicouche caractérisée par des profils de variants rares distincts et des mutations de novo non codantes, qui sont mieux compris en intégrant la variabilité clinique dans un phénotype continu plutôt qu'en se fondant sur la charge mutationnelle globale.

Svetlana Dauengauer-Kirlienė, Laura Pranckėnienė, Austėja Letukienė, Faustas Puzeras, Ingrida Domarkienė, Alina Urnikytė2026-09-03
🧬 biology

From Movement to Meaning: Spatial Statistics Uncover Hidden Patterns in Avian Tracking Data

Cet article introduit un cadre novateur et reproductible qui applique l'analyse de processus ponctuels spatiaux eulériens, basés sur le lieu, aux données de suivi aviaire, permettant l'identification précise des états comportementaux et des habitats critiques à travers de multiples échelles tout en complétant les approches traditionnelles basées sur les trajectoires.

Hengjun Xiao, Hebo Peng, Zhengwang Zhang, Weipan Lei, Yang Wu, Bingrun Zhu, Yoshiaki Miyamoto, Donglai Li, De Chen, Tomo (…)2026-09-02
🧬 biology

Tirzepatide engages a brain-brown adipose tissue axis to promote body weight loss independent of appetite suppression

Cette étude révèle que la tirzépatide favorise la perte de poids chez les souris en activant un circuit distinct du tronc cérébral (AP→DMV→RPa) qui stimule la thermogenèse du tissu adipeux brun indépendamment de la suppression de l'appétit, un mécanisme qui rend compte d'environ 40 % de son efficacité et qui n'est pas efficacement engagé par la sémaglutide.

Jia Sun, Xiao Xiao, Kaibin Wu, Deyi Kong, Fangcai Mai, Hanbo Liu, Danyingzhu Xie, Jiarun Xie, Xiwen Yang, Peiwen Tang, X (…)2026-09-02
🧬 biology

Wildfire ash exposure reveals a disconnect between herbivore feeding behavior and fitness outcomes

Cette étude révèle que, bien que le dépôt de cendres de feux de forêt ne dissuade pas le comportement alimentaire de l'herbivore spécialiste *Manduca sexta*, il altère significativement sa fitness en ralentissant la croissance, en augmentant la mortalité et en épuisant les réserves de lipides, menaçant ainsi le fonctionnement de l'écosystème par la perturbation des interactions plante-herbivore.

Grace Genevieve Melone, Jamie Lynn Resis, Angela Smilanich, James Crall, Amy Trowbridge2026-09-02
🧬 biology

Association Analysis Between Gut Microbiota Characteristics and Body Weight of Maritime Workers

Cette étude révèle que les travailleurs maritimes en surpoids présentent une dysbiose du microbiote intestinal distincte et un métabolisme des lipides altéré par rapport à leurs homologues de poids normal, suggérant que des interventions ciblées sur le régime alimentaire et le microbiote pourraient aider à gérer le poids dans cette population.

chunhong zhang, dan li, qi shen, ziqi liu, siyu xing, dong liang, dawei hu, fengzhong wang2026-09-02
🧬 biology

Novel Genetic Insights into Early-Onset High Myopia Through Trio-Based Exome Sequencing

Cette étude de séquençage de l'exome entier basée sur des trios, portant sur 36 familles de forte myopie précoce, identifie un rendement diagnostique de 61,1 % principalement porté par des mutations de novo, révèle que la charge génétique est significativement corrélée à la sévérité des lésions du fond d'œil plutôt qu'à l'erreur de réfraction, et suggère un modèle d'héritage additif oligogénique impliquant des gènes liés à la perception visuelle, à l'assemblage des cils des photorécepteurs et au remodelage de la matrice extracellulaire.

Wenjing Li, zhenglai Wang, Bingtao Li, Keyan Liu, Zichun Lin, Rui Li, Yanan Ma, Meiling Su, Haixuan Wang, Jinjin Zhang (…)2026-09-02
🧬 biology

Exploring the interaction between extracellular matrix components of bone marrow and prostate cancer cells in a novel 3D model

Cette étude a développé un nouveau modèle in vitro 3D utilisant de la gelée de Wharton décellularisée pour démontrer que la matrice extracellulaire de la moelle osseuse induit une chimiorésistance, la dormance et une tumorigenicité accrue chez les cellules souches du cancer de la prostate CD133-positives, particulièrement au sein de la lignée cellulaire DU145.

Jianhui Yang, Peter Van Veldhuizen, Hani Awad, Hiroshi Miyamoto, Wojciech Wojciechowski, Kathleen Gillespie, Brian Marpl (…)2026-09-02