🧬 biology

BARCODE: A Chromosome Karyotype Analysis Model Based on a Banding Code Framework

BARCODE est un modèle image-vers-séquence interprétable et efficace en données qui convertit les motifs de bandes G des chromosomes en séquences symboliques alignées sur l'ISCN afin de permettre la détection zéro-shot d'anomalies structurelles et une localisation précise au niveau des bandes sans nécessiter d'entraînement sur des échantillons anormaux.

Kaijie Wu, Zehan Qiu, Wenjing Hu, Hao Cheng, Jiawei Cao, Chuchu Gong, Shuyuan Li, Haodong Pan, Chendi Li, Xinping Guan (…)2026-08-11
🧬 biology

Identification of Macrophage Polarization-Related Genes as Biomarkers for Tendinopathy Based on Bioinformatics Analysis

Cette étude identifie et valide trois gènes liés à la polarisation des macrophages (PTCHD1, NEURL1 et ST8SIA5) comme des biomarqueurs diagnostiques robustes pour la tendinopathie, révélant leur sous-expression, leur association avec l'infiltration immunitaire, leur implication dans des voies de signalisation clés et leur potentiel en tant que cibles thérapeutiques.

Ling Ren, Chengqi He, Yuxi Qin2026-08-11
🧬 biology

Longitudinal multi-omic profiling of a pig-to-human lung xenograft reveals phased immune and tissue-remodeling responses

Cette étude utilise le profilage multi-omique longitudinal pour caractériser les réponses phasiques de l'immunité et du remodelage tissulaire d'une xénogreffe de poumon de porc à l'humain avec six gènes édités sur neuf jours, révélant des signatures moléculaires distinctes d'activation du complément, de remodelage myéloïde et de récupération épithéliale qui éclairent l'ingénierie future des donneurs et les stratégies d'immunosuppression.

Jianxing He, Ruoyu Zhou, Xiaoyou Liu, Jiang Shi, Yang Chao, Guiling Peng, Haoxiang Yang, Shuilin Liao, Chentao Yang, Bin (…)2026-08-11
🧬 biology

Integrated Computational Design and Molecular Dynamics Evaluation of Novel siRNAs Targeting the Hemagglutinin Gene of Measles Virus

Cette étude a utilisé un pipeline computationnel intégré, incluant des simulations de dynamique moléculaire et du docking, pour identifier et valider trois candidats siRNA prometteurs (S3, S4 et S7) ciblant le gène de l'hémagglutinine conservé du virus de la rougeole pour le développement potentiel de thérapies antivirales.

Mohaimen Ahmed Rijvy, Md. Tanvir Rahman Saikat, Mowmita Tabassum, Md. Mosharof Hossain, Sanjida Jahan Shimu, Gazi Tanjim (…)2026-08-11
🧬 biology

Chromatin regulator perturbation causes heme pathway imbalance in yeast and human cells

Cette étude révèle que la perturbation de régulateurs de la chromatine spécifiques rompt l'équilibre transcriptionnel de la voie de biosynthèse de l'hème — affectant particulièrement ses enzymes intermédiaires tout en épargnant l'enzyme terminale régulée par le fer — entraînant une accumulation toxique de porphyrines chez la levure et contribuant au déséquilibre de l'hème dans les cancers humains.

Alexander Alexandrov, Olga Mitkevich, Vitaly Kushnirov, Michael Agaphonov2026-08-11
🧬 biology

Developmental multi-omics reveals provenance-dependent regulatory and metabolic trajectories underlying geo-authenticity in Dendrobium officinale

Cette étude emploie l'omique multi-développementale pour élucider comment les réseaux de régulation spécifiques à la provenance et les trajectoires métaboliques se coordonnent pour établir l'authenticité géographique et la qualité médicinale de *Dendrobium officinale*, offrant ainsi un cadre pour son évaluation et son utilisation.

Chong Feng, Xinlian Chen, Jun Liu, Yu’e Chen, Enyao Ma, Depo Yang, Zhimin Zhao2026-08-11
🧬 biology

A new endemic species of Spermacoce L. 1753 (Equisetopsida: Gentianale: Rubiaceae) from Tamil Nadu, India: Spermacoce Venkatesalui

Cet article décrit *Spermacoce venkatesalui*, une nouvelle espèce endémique en danger critique d'extinction provenant du bosquet sacré de Vellimalai au Tamil Nadu, en Inde, la distinguant de l'espèce apparentée *S. hispida* par une analyse morphologique détaillée et fournissant un compte taxonomique complet.

Sugaseelan Akash, Anbudass Sasi Bharathi, Kathavarayan Manikandan, Selvam Srikanth, Authinarayanan Rajesh2026-08-11
🧬 biology

Athletes exhibit distinct gut microbial signatures and predicted metabolic functions compared with sedentary adults

Cette étude démontre que l'entraînement physique de longue durée chez les athlètes de compétition asiatiques est associé à un microbiote intestinal plus sain, caractérisé par une diversité accrue, un enrichissement taxonomique bénéfique et des fonctions métaboliques améliorées, lesquels peuvent être distingués avec précision des individus sédentaires à l'aide de modèles d'apprentissage automatique pour identifier des biomarqueurs potentiels d'adaptation à l'exercice.

Jiahui Jin, Yufan Xiao, Qiaoqing Xiao, Yingying Diao, Meihua Su2026-08-11
🧬 biology

A structurally and evolutionarily validated catalog of taxonomically restricted and de novo genes in the Anopheles gambiae species complex

Cette étude présente un catalogue rigoureusement validé de gènes taxonomiquement restreints et de novo au sein du complexe d'espèces *Anopheles gambiae* en surmontant les artefacts d'assemblage et les échecs de détection d'homologie grâce à un cadre de familles de gènes de base interspécifiques, révélant que ces innovations spécifiques à la lignée sont transcrites, contraintes et présentent un gradient de désordre structurel cohérent avec les modèles de naissance de gènes de novo.

Giridhar Athrey, Mark Mattine, Maame Asiamah2026-08-11
🧬 biology

Single-cell analysis of pre-rRNA in Escherichia coli indicates distinct pathways of action for YbeX and YbeY proteins in ribosome biogenesis

L'analyse en cellule unique révèle que, bien que YbeX et YbeY soient tous deux impliqués dans la biogenèse des ribosomes, la délétion de YbeX sous limitation en magnésium provoque une accumulation hétérogène de l'ARN pré-rRNA 17S à travers les cellules individuelles entraînant une phase de latence, tandis que la délétion de YbeY entraîne une accumulation d'ARN pré-rRNA plus uniforme pendant la croissance exponentielle, indiquant des mécanismes d'action distincts pour ces protéines.

Abbas Mansour, İSMAİL SARIGÜL, Tanel Tenson, Ülo Maiväli2026-08-11