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🧬 biology

A leakage-aware benchmark for evaluating chemical and cellular generalization in single-cell perturbation-response prediction

Ce document introduit un cadre de référence sensible aux fuites qui définit explicitement des voisinages d'entraînement-test pour évaluer rigoureusement les capacités de généralisation des modèles de perturbation de cellules uniques à travers des contextes chimiques et cellulaires, révélant que les divisions aléatoires standards surestiment souvent la performance en conservant des chevauchements structurels et mécanistes que la validation par exclusion conjointe élimine avec succès.

Da Lin¹, Ying Chen², Yue Liu², Yu Zhang¹2026-08-10
🧬 biology

Reprogramming lipid metabolism in virus-infected neuronal cells

Cette étude démontre que les infections virales par l'HSV-1 et le ZIKV régulent à la baisse des voies métaboliques lipidiques clés, incluant le métabolisme des sphingolipides et des glycérophospholipides, dans les cellules neuronales dérivées d'iPSC, suggérant un mécanisme par lequel le reprogrammage viral du métabolisme de l'hôte contribue à la pathogenèse des maladies neurodégénératives.

Luzhao Li, Haoran Qu, Wen Fu, Shu Feng2026-08-10
🧬 biology

Mirror Symmetry Drug Design (MSDD): A Parity-Inversion Framework for Generative De Novo Design of Proteolytically Stable Dual-Targeting D-Peptides against Bcl-2 and Mcl-1

L'article introduit la conception de médicaments par symétrie miroir (MSDD), un nouveau cadre de calcul qui contourne les limitations chirales de l'IA générative actuelle en inversant les poches des protéines cibles afin de permettre la conception de novo d'inhibiteurs doubles de type D-peptide, à haute affinité et protéolytiquement stables, pour Bcl-2 et Mcl-1 sans nécessiter de réentraînement du modèle.

Sharon Melhi2026-08-10
🧬 biology

Occupancy-Driven Attenuation in Radiation-Sensitive Chromatin Domains: A Statistical-Mechanical Model of the Overkill Effect and RBE Maximum

Cet article propose un modèle de mécanique statistique démontrant que l'« effet d'overkill » et le maximum de l'efficacité biologique relative (EBR) qui en résulte découlent de l'occupation progressive de domaines de chromatine sensibles aux radiations de taille finie, ce qui limite la formation d'événements létaux supplémentaires à un transfert d'énergie linéique (TEL) élevé.

Ladan Rezaee2026-08-10
🧬 biology

Heterozygous HMGB1 variants and neurodevelopmental disorder: phenotypic and allelic spectrum

Cette étude internationale caractérise le spectre phénotypique et allélique d'un trouble du neurodéveloppement causé par des variants hétérozygotes de *HMGB1*, le distinguant du BPTAS en confirmant que, bien que la microcéphalie soit fréquente, le trouble englobe divers types de mutations codantes et non codantes qui ne génèrent pas la queue C-terminale riche en arginine associée à ce dernier syndrome.

Himanshu Goel, Kayla Treat, Theodore Wilson, Angela Peron, Manuela Morleo, Vincenzo Nigro, Konrad Platzer, Rosanna Krako (…)2026-08-10
🧬 biology

Transcriptomic and Metabolic Basis of Volatile Compound Dynamics in Apricot Fermentation

Cette étude élucide la dynamique temporelle de la biosynthèse des arômes chez *Wickerhamomyces anomalus* LY13 lors de la fermentation de résidus d'abricot, révélant que les composés volatils clés atteignent un pic à 48 heures sous l'effet de l'induction précoce de gènes et identifiant une alcool déshydrogénase à chaîne courte spécifique (WICANDRAFT_98376) responsable de la conversion du phénylacétaldéhyde en 2-phényléthanol.

Lei Li, Yunfei Chen, Zhifei Chen, Jiaming Zhao, Xueying Cao, Haoyang Chen, Gaolei Xi, Li Han, Xingwang Song2026-08-10
🧬 biology

Invasion status and mycorrhizal responsiveness jointly shape context-dependent plant-soil feedbacks in Northern Great Plains grasslands

Cette étude démontre que dans les prairies de graminées des Grandes Plaines du Nord, la réactivité mycorhizienne seule ne détermine pas les rétroactions plantes-sol positives ; plutôt, un héritage de rétroaction positive est généré de manière unique par l'espèce envahissante l'euphorbe de feuilles, à travers une combinaison de libération des ennemis et d'accumulation de mutualistes, tandis que les espèces indigènes réactives aux mycorhizes accumulent des rétroactions négatives dictées par les agents pathogènes du sol.

Rebeca Crespo-Teixeira, Hanh N. H. Pham, Jonathan A. Bennett2026-08-10
🧬 biology

Scalable regional genomic surveillance reveals previously unrecognized SARS-CoV-2 recombinant diversity and limited onward transmission

En analysant 3 360 génomes de SARS-CoV-2 du nord-est de l'Allemagne à l'aide d'un nouveau cadre de détection en deux étapes, cette étude révèle une diversité recombinante non reconnue significative et démontre que, bien que les co-infections soient fréquentes, la transmission ultérieure réussie des recombinants demeure une contrainte évolutive majeure.

Christian Kohler, Ana Tzvetkova, Anne Pohlmann, Kathrin Lehmann, Tilo Sasse, Veronika Balau, Martin Beer, Lars Kaderali (…)2026-08-10
🧬 biology

Segmentation and profile-based classification of movement strategies from animal tracking data

Cet article introduit un cadre de classification basé sur des profils qui segmente les trajectoires GPS animales et classifie les stratégies de mouvement en utilisant des profils comportementaux empiriques et le bootstrapping pour fournir des assignations probabilistes avec des estimations d'incertitude, ne nécessitant que des données d'entraînement modestes et démontrant une grande précision à travers des simulations et deux espèces écologiquement distinctes.

Ivo Kadlec, Johannes Signer, Martin Sládeček, Miroslav Kutal, Martin Duľa, Aldin Selimović, Vendula Meissner-Hylanova, N (…)2026-08-10
🧬 biology

Cognitive, Behavioral, and Sleep Characterization of Sex Differences in the Ts65Dn Mouse Model of Down syndrome

Cette étude révèle des différences sexuelles significatives dans le modèle de souris Ts65Dn de la trisomie 21, où les femelles présentent une mémoire de reconnaissance supérieure, un comportement de type dépressif réduit et un sommeil plus stable par rapport aux mâles, soulignant la nécessité critique de prendre en compte les variations spécifiques au sexe dans les recherches et les stratégies thérapeutiques futures.

Tula Lawsin Kurashige, Stella Tapia Lopez, Sadie Peroulas, Lauren Chan, H. Craig Heller, Elsa Pittaras2026-08-10