🧬 biology

Resource Depletion and Replication-Rate Optimization in Autocatalytic Lineages

Cet article présente un cadre mathématique à gros grains qui démêle les dynamiques distinctes de l'activité de lignée à horizon fini, de la production d'entropie thermodynamique, de la persistance stochastique et de l'avantage compétitif dans les systèmes autocatalytiques, révélant que les taux de réplication optimaux sont finis en raison des contraintes de ressources et que la dominance compétitive ne garantit pas une persistance écologique absolue.

Siddarth D Murthy2026-09-15
🧬 biology

Structural confidence and template coverage of selected proteins from Flavobacterium azizsancarii

Cette étude évalue la confiance structurelle et la couverture de modèles de 25 protéines de la bactérie antarctique *Flavobacterium azizsancarii* à l'aide de prédictions AlphaFold, révélant une fiabilité globale élevée des modèles et des informations fonctionnelles spécifiques pour des enzymes métaboliques clés, tout en notant que ces hypothèses structurelles ne confirment pas encore les fonctions biochimiques ou les performances environnementales.

Cem Boyraz2026-09-15
🧬 biology

Cells are not replicates: permutation calibration of the unit-of-analysis error in a pooled sleep single-cell design (GSE137665)

Cet article démontre que la réanalyse d'un ensemble de données de séquençage de l'ARN en cellule unique issu d'un pool de sommeil (GSE137665) révèle une erreur grave d'unité d'analyse où le fait de traiter les cellules individuelles comme des réplicats indépendants gonfle les taux de fausses découvertes à 37,7 %, prouvant qu'aucune inférence valide au niveau de la population ne peut être tirée de tels modèles et soulignant la nécessité critique de rapporter les tailles d'échantillon au niveau de l'animal et d'utiliser le calibrage par permutation.

永新 杨2026-09-15
🧬 biology

Differential Gene Expression of Iron Metabolism and Erythropoiesis-Related Genes in Human Erythroblasts: A Bioinformatics Analysis with Relevance to Iron Deficiency Anemia in Pakistan

Cette étude bioinformatique analyse les données d'expression génique d'érythroblastes humains afin d'identifier l'expression différentielle significative des gènes liés au métabolisme du fer et à l'érythropoïèse, fournissant des perspectives moléculaires qui soutiennent l'intégration de la génomique nutritionnelle dans les stratégies visant à lutter contre le fardeau élevé de l'anémie ferriprive au Pakistan.

Namra Shams Awanᵃ2026-09-15
🧬 biology

TNF and IFN-γ converge and diverge in the molecular reprogramming of human brain microvascular endothelial cells under flow

Cette étude révèle que, sous des conditions de flux physiologique, le TNF et l'IFN-γ induisent un reprogrammage distinct mais chevauchant dans les cellules endothéliales microvasculaires cérébrales humaines, où le TNF favorise principalement l'adhésion des leucocytes et le retrait du cycle cellulaire tandis que l'IFN-γ favorise la présentation de l'antigène, suggérant collectivement que le ratio local de cytokines, plutôt que la charge totale, dicte le profil spécifique des leucocytes recrutés.

Nahla Galal Metwally2026-09-15
🧬 biology

Ordered Absorption Reveals Green-Kubo Memory Hidden from Survival Curves

Cet article démontre que, tandis que les courbes de survie standards ne peuvent pas distinguer un processus de son inverse temporel, une nouvelle méthode utilisant des impulsions d'absorption ordonnées peut extraire la mémoire de Green-Kubo cachée et reconstruire la dynamique de Markov à états finis, une capacité validée par une analyse rétrospective de données expérimentales de piège optique.

Idrees Oreibi, Rehab Shather Abdul Hamza2026-09-15
🧬 biology

Subject Identity Is a Major Source of Variance in EEG Spectral Features and Can Inflate Machine Learning Evaluation

Cette étude démontre que l'identité du sujet est une source dominante de variance dans les caractéristiques spectrales de l'EEG qui peut artificiellement gonfler la performance de l'apprentissage automatique lorsque les évaluations utilisent des découpages de données standards, nécessitant ainsi des protocoles d'évaluation par sujet pour garantir une découverte de biomarqueurs valide.

Hassan Ugail, Newton Howard2026-09-15
🧬 biology

SOX17 drives resilience of the arterial endothelium under shear stress

Cette étude identifie SOX17 comme un régulateur critique de l'intégrité et de la résilience de la barrière endothéliale artérielle induit par la contrainte de cisaillement, démontrant que sa déficience altère la stabilité jonctionnelle et favorise les lésions vasculaires par la régulation à la baisse de l'effecteur en aval SEMA3G.

Jurjan Aman, Beau Neep, Laura de Heus, Lion Raaz, Xiaoqing Sun, Xiaoke Pan, Femke van Leeuwen, Robert Szulcek, Chris Dic (…)2026-09-15