🧬 biology

scLodestar: Scalable probabilistic clustering of single  cells in a continuous probability space

scLodestar est un cadre évolutif et performant qui modélise les données de cellule unique sous forme de distributions de probabilité continues sur des états de repère, permettant une quantification rigoureuse de l'incertitude, la découverte de populations cellulaires transitionnelles et le traitement efficace de millions de cellules sans les limitations du partitionnement discret et rigide.

Lingpin Pang, Yue Xu, Yunhua Zhao, Xuanhe Hou, Yue Ma, Huafeng Liu, Xiaoyu Liu, Han Wang, Luchun Yan, Chunjie Tian2026-07-06
🧬 biology

Spatiotemporal multi-omics reveal ISG15⁺ T cells as a predictive transitional state in cancer immunotherapy

En intégrant la multi-omique et le profilage spatial à travers 39 cancers, cette étude redéfinit les cellules T ISG15⁺ comme un réservoir transitionnel « sous pression » (spring-loaded), spatialement ancré dans le cœur tumoral mais capable d'être mobilisé en effecteurs actifs par le blocage des points de contrôle immunitaire, servant ainsi de biomarqueur prédictif robuste du succès thérapeutique.

Taiwen Li, Guile Zhao, Yiwen Lu, Hao Cui, Grace Lubamba, Zhongzheng Xiang, YingYing Lian, Yang Yang, Siying Zuo, Shouzhe (…)2026-07-06
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Activation of the innate immune system of the Antarctic sea urchin Sterechinus neumayeri by soluble fraction of diesel oil and high seawater temperature

Cette étude démontre que l'exposition à la fraction hydrosoluble du gasoil, particulièrement à des concentrations plus élevées et combinée à des températures d'eau de mer surélevées, active significativement le système immunitaire inné de l'oursin antarctique *Sterechinus neumayeri*, comme en témoignent l'augmentation de l'activité phagocytaire et les réponses spécifiques des coelomocytes.

José Roberto Machado Cunha Silva, João Carlos Shimada Borges, Renata Stecca Iunes, Marina Tenório Botelho, Leandro Nogue (…)2026-07-06
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Drp1-Associated Mitochondrial Dysfunction Is Involved in PNA-TPP-Mediated Reduction of Cisplatin Tolerance in A549 Lung Adenocarcinoma Stem-like Spheres

Cette étude démontre que le PNA-TPP réduit la tolérance au cisplatine dans les sphères de type cellules souches de l'adénocarcinome pulmonaire A549 en régulant à la hausse Drp1 pour induire un dysfonctionnement mitochondrial, altérant ainsi la pluripotence et augmentant la sensibilité aux médicaments.

lixia xie, yong cheng, guofeng zhu, xinyi zhang, xiaoqun ye2026-07-06
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Neurodynamic EEG Seizure Analysis Using CWT Scaleograms and Modified DenseNet

Cette étude propose un cadre neurodynamique explicable pour la classification des crises d'épilepsie qui transforme les signaux EEG 1D en scalogrammes CWT et les traite à travers une architecture DenseNet entièrement convolutive modifiée, atteignant une précision et une interprétabilité supérieures par rapport à divers modèles de référence.

Pankaj Kunekar, Jyoti Chavhan, Vanitha Soman, Ashutosh Kulkarni, Bhavna Arora, Tanushree Bhattacharjee2026-07-06
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Differential response of AP2/ERF genes under hormone and light in Coptis chinensis

Cette étude caractérise de manière exhaustive la famille des 125 facteurs de transcription AP2/ERF chez *Coptis chinensis*, révélant son expansion évolutive à travers des duplications du génome et identifiant des membres clés tels que CchERF45 et CchERF14 comme régulateurs centraux des voies de signalisation hormonale et lumineuse.

Qiang Ai, Xinyu Ma, Shanbin Li, Xiao Li, Mengting Ma, Yuexiao Wang, Ping Di, Hao chen2026-07-06
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Core functional convergence and spatiotemporal complementarity of soil microbial communities between rhizosphere and decomposing habitats in Foding Mountain Nature Reserve, China

Cette étude révèle que, dans la réserve naturelle de la montagne Foding, les plantes hôtes exercent une régulation bidirectionnelle sur les microbiomes de la rhizosphère, tandis que les champignons et les bactéries emploient une stratégie de complémentarité spatio-temporelle avec des rôles fonctionnels distincts lors de la décomposition de la matière organique, pilotant collectivement le cycle des matières et le maintien fonctionnel dans les écosystèmes de forêts subtropicales.

Jinhua Xu, Xinghong Wang, Anxiong Wei, Qingsong Ran, Haiyan Wang, Chunbo Dong, Yanwei Zhang, Wanhao Chen, Yanfeng Han2026-07-06
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Behavioural thermoregulation in a Neotropical frog is detectable only when physiological integrity allows movement

Cette étude démontre que la grenouille néotropicale *Pseudis limellum* ne présente une thermorégulation comportementale que lorsque les conditions thermiques permettent la locomotion, révélant une niche thermique étroite centrée autour de 27 °C qui rend l'espèce hautement vulnérable au réchauffement climatique projeté dans le Pantanal.

Diogo B. Provete, Carolina C. Ganci, Zaida Ortega2026-07-06
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Neuronal Mitochondrial Dysfunction Drives Astrocytic Mitochondrial Transfer after TBI: Reveals the Therapeutic Potential of astrocytic EV-Mito

À la suite d'un traumatisme crânien, le dysfonctionnement mitochondrial neuronal déclenche une réponse adaptative médiée par les astrocytes où les mitochondries sont transférées via des vésicules extracellulaires pour restaurer la bioénergétique somatique et neuritique, bien que ce mécanisme protecteur ne parvienne pas jusqu'aux synapses.

Gopal V Velmurugan, Hemendra J Vekaria, Alexander G Rabchevsky, Kai Saito, Josh M Morganti, Samir Patel, Brad Hubbard, P (…)2026-07-06
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SpikeTrainPatternDetector: a provenance-aware R/Shiny framework for neuronal firing-pattern detection and review

SpikeTrainPatternDetector (STPD) est un cadre R/Shiny open-source conçu pour préserver la provenance des décisions de détection de motifs de décharge neuronale à travers la génération automatisée de candidats, la résolution déterministe des conflits et la revue manuelle, servant d'infrastructure reproductible pour la validation par des experts plutôt que de classificateur biologique autonome.

Houchun Zhou, Alexey Sedov2026-07-06