360 पेपर
13C-लेबल वाले ग्लिसराइज़ा (Glycyrrhiza) ऊतकों पर मॉलिक्यूलर नेटवर्किंग के साथ स्टेबल आइसोटोप-असिस्टेड कम्प्यूटेशनल मास स्पेक्ट्रोमेट्री को एकीकृत करके, शोधकर्ताओं ने पौधे के जड़-विशिष्ट मेटाबोलोम का लक्षण वर्णन किया और नवीन होमोपिपिकोेलिक एसिड-संयुग्मित फ्लेवोनॉइड एल्कलॉइड की खोज की, उनके संरचनाओं को मान्य किया और एक अद्वितीय जैवसंश्लेषण पथ प्रस्तावित किया।
mdCATH डेटाबेस से बड़े पैमाने के मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स डेटा का विश्लेषण करके, यह अध्ययन छह -टर्न प्रकारों को वर्गीकृत करता है—जिसमें एक नव-पहचाना गया हाइब्रिड I/I' मध्यवर्ती भी शामिल है—और यह प्रदर्शित करता है कि कैसे विशिष्ट अमीनो एसिड अनुक्रम और आसपास के संरचनात्मक संदर्भ संयुक्त रूप से उनकी संरचनात्मक गतिशीलता और लचीलेपन को नियंत्रित करते हैं।
एरीलमैलोनेट डिकार्बोक्सिलेज (AMDase) की हाइड्रोफोबिक पॉकेट को इंजीनियर करके, शोधकर्ताओं ने स्टेरिकली हिंडर्ड अल्फा-एरील और अल्फा-अल्केनाइल कार्बोक्सिलिक एसिड के (R)-इनैन्टीओमर्स को उत्कृष्ट इनैनटीओप्योरिटी के साथ संश्लेषित करने के लिए इसके सबस्ट्रेट स्कोप का सफलतापूर्वक विस्तार किया।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि BTK अवरोधकों (इनहिबिटर्स) में कोवेलेंट वारहेड्स की रासायनिक प्रकृति, विशेष रूप से 2-ब्यूटिनामाइड बनाम एक्रिलामाइड, केवल निष्क्रिय जुड़ाव समूहों के रूप में कार्य करने के बजाय सक्रिय रूप से प्रोटीन संरचनात्मक गतिशीलता और सिग्नलिंग प्रभावकारिता को नियंत्रित करती है, जिससे अवरोधक प्रदर्शन और संभावित प्रतिरोध तंत्र प्रभावित होते हैं।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि PACAP पेप्टाइड परिवार में विकासवादी रूप से संरक्षित अमाइलॉइड एकत्रीकरण (amyloid aggregation) हेपरिन-संवेदनशील लाइसिन/आर्जिनिन गेटकीपर अवशेषों द्वारा कड़ाई से नियंत्रित होता है, जो सशर्त स्विच के रूप में कार्य करते हैं ताकि ग्लुकागन परिवार से पर्याप्त अनुक्रम विचलन के बावजूद स्रावी कणिकाओं (secretory granules) में कार्यात्मक फाइब्रिल निर्माण को सक्षम किया जा सके।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि ऑक्सीडेटिव स्ट्रेस और EGF के जवाब में, ARHGEF7 के C312 अवशेष पर S-ग्लूटाथियोनिलैशन (S-glutathionylation), Rac1 के साथ इसके बंधन और सक्रियण को बढ़ाता है, जिससे Rac1-PAK1-LIMK1/MEK1 सिग्नलिंग अक्ष के माध्यम से कैंसर कोशिका प्रवासन और आक्रमण को प्रेरित किया जाता है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि प्यूरीन न्यूक्लियोटाइड्स अंतर्जात चयापचय गोंद (endogenous metabolic glues) के रूप में कार्य करते हैं जो पोषक तत्व संवेदन (nutrient sensing) के माध्यम से प्यूरीन जैवसंश्लेषण को विनियमित करने के लिए एंजाइम PPAT को उसके अवरोधक NUDT5 से बांधते हैं, एक ऐसी प्रक्रिया जिसका थियोप्यूरीन कीमोथेराप्यूटिक्स अनुकूलन योग्य बाइंडिंग पॉकेट्स के भीतर अद्वितीय ओरिएंटेशन अपनाकर बढ़ी हुई क्षमता के साथ शोषण करते हैं।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि पोषक तत्वों की कमी के दौरान तनाव-प्रतिक्रिया और जन्मजात प्रतिरक्षा मार्गों को संचालित करने के लिए, एस-एडिनोसिलमेथियोनिन (SAM) की प्रचुरता के बजाय, मेथियोनीन की उपलब्धता प्राथमिक चयापचय संकेत के रूप में कार्य करती है जो परमाणु MAT2A संचय और उसके बाद क्रोमैटिन रीमॉडलिंग को ट्रिगर करती है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एडेप्टर प्रोटीन NUB1L के साथ सह-अवसादन (co-sedimentation), वाइल्ड-टाइप, इंट्रिन्सिकली डिसऑर्डर्ड FAT10 N-डोमेन के उच्च-गुणवत्ता वाले MAS NMR संरचनात्मक विश्लेषण को सक्षम बनाता है, जो यह प्रकट करता है कि यह एक 'फजी कॉम्प्लेक्स' (fuzzy complex) बनाता है जो इसके स्थिर वेरिएंट के समान है और इसके N-टर्मिनस को प्रोटियासोमल क्षरण (proteasomal degradation) के लिए व्यवस्थित करता है।
डी नोवो प्रोटीन डिज़ाइन का उपयोग करते हुए, शोधकर्ताओं ने एक इंटीग्रिन-स्वतंत्र Tie2 एगोनिस्ट बनाया जो पुष्टि करता है कि रिसेप्टर सक्रियण के लिए इंटीग्रिन जुड़ाव आवश्यक नहीं है लेकिन सिग्नलिंग की अवधि को बढ़ाने के लिए आवश्यक है, जबकि तीव्र श्वसन संकट सिंड्रोम के एक माउस मॉडल में शक्तिशाली चिकित्सीय प्रभावकारिता प्रदर्शित करता है।